广西猪圆环病毒2型的遗传进化分析

【目的】了解广西各地当前流行的猪圆环病毒2型(PCV2)基因型差异、出现的时间、致病性及其今后流行趋势。【方法】根据GenBank中已发表的PCV2核苷酸全序列设计1对引物,从广西不同市(县)采集的猪组织样本(脾脏、肺脏、淋巴结、流产胎儿)中成功克隆获得34株PCV2 ORF2基因序列,并对其进行遗传进化分析。【结果】获得的34株PCV2中有9株ORF2基因全长为705bp,1株为696bp,其余的为702bp;经遗传进化分析,发现PCV2可以分为PCV2a、PCV2b、PCV2c、PCV2d、PCV2e5个基因型,在34株PCV2ORF2基因中,有7株属于PCV2d型,1株属于PCV2e型,...

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Published inNanfang nongye xuebao = Journal of Southern Agriculture Vol. 42; no. 3; pp. 311 - 314
Main Author 廖承球 何苹萍 郭旋 兰家暖 张民秀 黄福标 卢冰霞 刘磊 刘芳 黄伟坚
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 广西大学动物科学技术学院,南宁,530005%广西兽医研究所,南宁,530001 2011
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ISSN2095-1191
DOI10.3969/j.issn.2095-1191.2011.03.020

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Summary:【目的】了解广西各地当前流行的猪圆环病毒2型(PCV2)基因型差异、出现的时间、致病性及其今后流行趋势。【方法】根据GenBank中已发表的PCV2核苷酸全序列设计1对引物,从广西不同市(县)采集的猪组织样本(脾脏、肺脏、淋巴结、流产胎儿)中成功克隆获得34株PCV2 ORF2基因序列,并对其进行遗传进化分析。【结果】获得的34株PCV2中有9株ORF2基因全长为705bp,1株为696bp,其余的为702bp;经遗传进化分析,发现PCV2可以分为PCV2a、PCV2b、PCV2c、PCV2d、PCV2e5个基因型,在34株PCV2ORF2基因中,有7株属于PCV2d型,1株属于PCV2e型,25株属于PCV2b型,未发现PCV2a和PCV2c型,而新发现的GXHP-2不归属于任何一个基因型。【结论】广西目前流行的PCV2有PCV2b、PCV2d、PCV2e3个基因型,其中以PCV2b为主。
Bibliography:porcine circivirus type 2; ORF2 gene; genotype; genetic variation
S858.28
45-1381/S
genetic variation
porcine circivirus type 2
ORF2 gene
genotype
ISSN:2095-1191
DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2011.03.020