持久性有机污染物4，4’-DDE和CB-153的反向虚拟筛选

持久性有机污染物（POPs）会导致人类和动植物各种疾病的发生，已经成为一种新的全球性环境问题．研究发现，POPs分子能够特异性地结合到生物体内一些蛋白质受体上，发挥其致病机制．本文运用基于分子对接的反向虚拟筛选方法，从蛋白质结构数据库中筛选出配体分子可能的受体蛋白质，研究了持久性有机污染物4，4’-DDE和CB-153潜在的受体蛋白质．结合实验信息，讨论分析了排在前5％的蛋白质受体．值得注意的是，已知的一些蛋白质受体都排在了虚拟筛选结果的前列．该研究不仅有助于进一步了解这些有毒污染物分子的致病机制，还将为设计针对该类污染物分子的生物传感器提供有用的信息．...

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Published in物理化学学报 Vol. 29; no. 10; pp. 2276 - 2285
Main Author 许先进 苏计国 刘斌 李春华 谭建军 张小轶 陈慰祖 王存新
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100124%燕山大学理学院,河北秦皇岛,066004 2013
Subjects
反向虚拟筛选
持久性有机污染物
生物传感器
蛋白质靶点
持久性有机污染物
Persistent organic pollutant
蛋白质靶点
生物传感器
Biosensor
Reverse virtual screening
反向虚拟筛选
Protein target
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ISSN1000-6818
DOI10.3866/PKU.WHXB201307161

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Summary:持久性有机污染物（POPs）会导致人类和动植物各种疾病的发生，已经成为一种新的全球性环境问题．研究发现，POPs分子能够特异性地结合到生物体内一些蛋白质受体上，发挥其致病机制．本文运用基于分子对接的反向虚拟筛选方法，从蛋白质结构数据库中筛选出配体分子可能的受体蛋白质，研究了持久性有机污染物4，4’-DDE和CB-153潜在的受体蛋白质．结合实验信息，讨论分析了排在前5％的蛋白质受体．值得注意的是，已知的一些蛋白质受体都排在了虚拟筛选结果的前列．该研究不仅有助于进一步了解这些有毒污染物分子的致病机制，还将为设计针对该类污染物分子的生物传感器提供有用的信息．
Bibliography:11-1892/06
Persistent organic pollutants （POPs） cause various diseases in both human and wildlife and have become a new global environmental problem. The toxic effects of POPs can be induced through their binding to specific proteins in the body. In the present work, a reverse virtual screening method based on molecular docking was used to search for potential protein targets for two POPs, 4,4＇-dichlorodiphenyldichloroethane （4, 4＇-DDD） and 2,2＇,4,4＇,5,5＇-hexachlorobiphenyl （CB-153）, from a protein structure database. Targets ranked in the top 5% were chosen for analysis using experimental information. All known targets appeared in the top 5% of targets. This study not only increases understanding of the toxic mechanism of POPs, but may also aid the design of novel recognition elements in biosensors.
Persistent organic pollutant; Reverse virtual screening; Protein target; Biosensor
XU Xian-Jin, SU Ji-Guo, LIU Bin,LI Chun-Hua, TAN Jian-Jun, ZHANG Xiao-Yi, CHEN Wei-Zu, WANG Cun-Xin（1College of Life Science and Bio
ISSN:1000-6818
DOI:10.3866/PKU.WHXB201307161