广西猪瘟病毒E2基因克隆及序列分析

【目的】了解广西猪瘟病毒（CSFV）流行毒株的变异规律及其与疫苗株的基因差异，为正确选择猪瘟疫苗和防制广西猪瘟提供参考依据。【方法】以广西本地的阳性猪瘟病料为研究对象，应用RT—PCR扩增CSFV的E2基因，经克隆、测序后用DNASTAR软件对其序列进行比对分析，并绘制遗传进化树。【结果】从41份疑似猪瘟病料中共扩增出4个阳性样品的E2基因（1140bp），经序列比对分析发现，扩增获得的4株CSFV毒株（GXGG1、GXLC1、GXLC2和GXNN1）与兔化弱毒株（HCLV）、Shimen强毒株的核苷酸同源性为82．1％，82.3％和82．9％～83．4％、其推导氨基酸同源性为88．4％～89...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in南方农业学报 Vol. 43; no. 4; pp. 528 - 531
Main Author 陆增荣 张民秀 肖雄 王艺 刘芳 刘欢 卢冰霞 刘磊 郭旋 黎木兰 黄福标 黄伟坚
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 广西大学动物科学技术学院,南宁530005 2012
广西丽原生物股份有限公司,南宁530001%广西大学动物科学技术学院,南宁,530005
Subjects
E2基因
同源性
广西
序列分析
氨基酸变异
猪瘟病毒
E2基因
序列分析
氨基酸变异
猪瘟病毒
同源性
广西
Online AccessGet full text
ISSN2095-1191
DOI10.3969/j:issn.2095-1191.2012.04.528

Cover

More Information
Summary:【目的】了解广西猪瘟病毒（CSFV）流行毒株的变异规律及其与疫苗株的基因差异，为正确选择猪瘟疫苗和防制广西猪瘟提供参考依据。【方法】以广西本地的阳性猪瘟病料为研究对象，应用RT—PCR扩增CSFV的E2基因，经克隆、测序后用DNASTAR软件对其序列进行比对分析，并绘制遗传进化树。【结果】从41份疑似猪瘟病料中共扩增出4个阳性样品的E2基因（1140bp），经序列比对分析发现，扩增获得的4株CSFV毒株（GXGG1、GXLC1、GXLC2和GXNN1）与兔化弱毒株（HCLV）、Shimen强毒株的核苷酸同源性为82．1％，82.3％和82．9％～83．4％、其推导氨基酸同源性为88．4％～89．2％和88．9％～90．0％，4株毒株间的E2基因核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为90．8％～99．6％和94．2％～99．5％，且均属于基因群Ⅱ；E2基因推导的氨基酸表明，E2蛋白空间结构及抗原结构的氨基酸位点693Cys、737Cys、792Cys、818Cys、828Cys、856Cys、833Pro、834Thr、837Arg均未发生变异，但其单抗识别位点G713E、N729D、K734R发生变异。【结论】近年来广西CSFV流行毒株的变异未出现较大差异，与HCLV株、Shimen强毒株亲缘关系较远，但与Paderbom株、GXWZ02株亲缘关系较近。
Bibliography:classical swine fever virus （CSFV） ; E2 gene ; sequence analysis ; homology ; amino acid variation ; Guangxi
45-1381/S
LU Zeng-rong, ZHANG Mln-xiu , XIAO Xiong, WANG Yi, LIU Fang, LIU Huan, LU Bing-xia, LIU Lei, GUO Xuan, LI Mu-lan, HUANG Fu-biao, HUANG Wei-jian（1College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning 530005, China; 2Guangxi Liyuan Biological Corporation Ltd., Nanning 530001, China）
[ Objective ]Variations regulation of classical swine fever virus （CSFV） prevalent strains in Guangxi and its difference with vaccine strain was studied in order to select a swine fever vaccine for controlling this disease in Guangxi. [Method]The CSFV E2 gene in local positive diseased swine samples was amplified using RT-PCR, cloned into the pMD18-T vector and sequenced. The sequences were comparatively analyzed using DNASTART Software and heredity evolutionary tree was drawn. [Result]Four positive strains （GXGG1, GXLC1, GXLC2 and GXNN1 ） of E2 gene were amplified from 41 CSF samples. The length of E2
ISSN:2095-1191
DOI:10.3969/j:issn.2095-1191.2012.04.528