棕榈科植物SSR分子标记反应体系的建立

以棕榈科植物的DNA为材料，通过对SSR反应体系中模板DNA、dNTPs、引物、Taq聚合酶和MgCl25个因素采用单因素试验法设定5个梯度，并比较不同的浓度、不同的用量对扩增效果的影响，建立最佳反应体系。研究最终确定了20μLPCR反应体系的最佳条件为：模板DNA2μL，dNTPs0．2μL，引物1．0μL，Taq聚合酶O．2μL，MgCl22．0μL。该优化体系稳定可靠，适合应用于棕榈科植物SSR分析。...

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Published in江西农业学报 Vol. 25; no. 11; pp. 6 - 10
Main Author 符海泉 杨耀东 符海瑜 万婕 马子龙 吴翼
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 海南省热带油料作物生物学重点实验室/中国热带农业科学院 椰子研究所,海南 文昌,571339%江西中医学院 科技学院,江西 南昌,330025%中国热带农业科学院 热带生物技术研究所,海南 海口,571101 2013
Subjects
SSR
优化
棕榈科
棕榈科
SSR
Palm tree
Optimization
优化
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ISSN1001-8581

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Summary:以棕榈科植物的DNA为材料，通过对SSR反应体系中模板DNA、dNTPs、引物、Taq聚合酶和MgCl25个因素采用单因素试验法设定5个梯度，并比较不同的浓度、不同的用量对扩增效果的影响，建立最佳反应体系。研究最终确定了20μLPCR反应体系的最佳条件为：模板DNA2μL，dNTPs0．2μL，引物1．0μL，Taq聚合酶O．2μL，MgCl22．0μL。该优化体系稳定可靠，适合应用于棕榈科植物SSR分析。
Bibliography:36-1124/S
To establish the optimal SSR - PCR reaction system for palm trees, different factors that mostly affected the amplifi- cation of SSR - PCR reaction, including DNA template, dNTPs, primers, TaqDNA and MgC12, were investigated and optimized by setting up 5 gradients with single - fact test method in the experiment. Meanwhile, we also compared the influences of different con centrations and different consumptions on the amplification. The results showed that the optimal SSR - PCR system was DNA template 2 μL, dNTPs 0.2 μL, primers 1.0 μL, TaqDNA 0.2 μL, and MgC12 2.0 μL, which was more stable and suitable for the SSR analysis of palm plants.
Palm tree; SSR; Optimization
FU Hai-quan, YANG Yao- dong, FU Hai-yu2 WAN Jie MA Zi-long, WU Yi （ 1. Hainan Provincial Key Laboratory of Tropical Oil Crops Biology/Coconut Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Wenchang 571339, China; 2. College of Science and Technology, Jiangxi University of Traditional Chinese Medicine, Nanchang 33002
ISSN:1001-8581