小蓬NeMT2基因的克隆及其植物表达载体的构建

该研究利用RACE（Rapid amplification of cDNA ends）技术从小蓬中成功分离编码金属硫蛋白（Metallothionein,MT）的cDNA序列,命名为NeMT2,在GenBank中登录号为KT835290。该基因全长590 bp,开放阅读框为237 bp,编码78个氨基酸,编码的氨基酸序列中含有14个半胱氨酸残基（Cys,C）,呈C-C,C-X-C,C-X-X-C排列,集中分布在肽链的N端和C端,基因编码蛋白的分子量为7.603 6 kD,等电点为4.71。系统发育分析表明,小蓬金属硫蛋白NeMT2与藜科的海蓬子（AEF01492）和盐穗木（AHI62953）同...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in广西植物 Vol. 36; no. 8; pp. 897 - 905
Main Author 葛风伟 曾卫军 李艳红 赵惠新
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室，新疆师范大学 生命科学学院，乌鲁木齐830054 2016
Subjects
NeMT2
RACE
小蓬
序列分析
植物表达载体
小蓬
rapid amplification of cDNA ends
RACE
序列分析
sequence analysis
Nanophyton erinaceum
plant expression vector
NeMT2
植物表达载体
Online AccessGet full text
ISSN1000-3142
DOI10.11931/guihaia.gxzw201601029

Cover

More Information
Summary:该研究利用RACE（Rapid amplification of cDNA ends）技术从小蓬中成功分离编码金属硫蛋白（Metallothionein,MT）的cDNA序列,命名为NeMT2,在GenBank中登录号为KT835290。该基因全长590 bp,开放阅读框为237 bp,编码78个氨基酸,编码的氨基酸序列中含有14个半胱氨酸残基（Cys,C）,呈C-C,C-X-C,C-X-X-C排列,集中分布在肽链的N端和C端,基因编码蛋白的分子量为7.603 6 kD,等电点为4.71。系统发育分析表明,小蓬金属硫蛋白NeMT2与藜科的海蓬子（AEF01492）和盐穗木（AHI62953）同源性最高,其次是甜菜（XP_010667708.1）。生物信息学分析表明,金属硫蛋白NeMT2无信号肽结构,属于非跨膜亲水性蛋白;疏水性分析表明,NeMT2蛋白的35~45个氨基酸之间有较强的疏水性,其中第41位Asp具最强的疏水性（1.444）;结构预测分析该蛋白质二级结构的主要元件是无规则卷曲。通过RT-PCR对NeMT2基因的表达分析发现,NeMT2基因在铜矿区和非铜矿区的小蓬叶片中均有表达,但该基因在铜矿区小蓬叶片的表达量明显高于非铜矿区。将小蓬NeMT2基因定向克隆到植物表达载体pCAMBIA1300的35S启动子下游,构建该基因的植物超表达载体pCAMBIA1300＋NeMT2。该研究结果为进一步研究该基因的功能和小蓬响应重金属胁迫的分子机制提供了一定基础。
Bibliography:GE Feng-Wei, ZENG Wei-Jun, L1 Yan-Hong, ZHAO Hui-Xin（Xinjiang Key Laboratory of Special Species Conservation and Regulatory Biology,College of Life Sciences, Xinjiang Normal University, Urumqi 830054 ）
Nanophyton erinaceum; NeMT2; rapid amplification of cDNA ends; sequence analysis; plant expression vector
Nanophyton erinaceum has a long living history at Aletai Copper Mine in Xinjiang. In order to analyze the relation between metallothionein gene and heavy metal response stress,a new heavy metal-responsive gene cD NA sequence was successfully cloned by RACE（ Rapid amplification of cD NA ends） from N. erinaceum. The gene was named as NeMT2,and its accession number in GenB ank was KT835290. The metallothionein gene NeMT2 was 590 bp in full length,and it had 237 bp ORF（ open reading frame） which encoded 78 amino acid residues. There were 14 Cys residues,arranged in the form of C-C,C-X-C and C-X-X-C,in the 78 amino acid residues,and these Cys residues distributed in N terminal and C terminal of peptides. The prote
ISSN:1000-3142
DOI:10.11931/guihaia.gxzw201601029