Septicaemia in a population‐based HIV clinical cohort in rural Uganda, 1996–2007: incidence, aetiology, antimicrobial drug resistance and impact of antiretroviral therapy

• Published in: Tropical medicine & international health Vol. 15; no. 6; pp. 697 - 705
• Main Authors: Mayanja, B. N., Todd, J., Hughes, P., Van der Paal, L., Mugisha, J. O., Atuhumuza, E., Tabuga, P., Maher, D., Grosskurth, H.
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: Oxford, UK Blackwell Publishing Ltd 01.06.2010; Blackwell
• Subjects: Adolescent; Adult; aetiology; Anti-Bacterial Agents - therapeutic use; Anti-Retroviral Agents - therapeutic use; antimicrobial; antimicrobianos; antimicrobien; antiretroviral therapy; Bacteria - isolation & purification; Bacterial diseases; Bacterial sepsis; Biological and medical sciences; Cohort Studies; Drug Resistance, Bacterial; etiología; Female; Formicidae; General aspects; HIV; HIV Infections - complications; HIV Infections - drug therapy; HIV Seronegativity; HIV Seropositivity; Human bacterial diseases; Human immunodeficiency virus; Human viral diseases; Humans; Incidence; incidencia; Infectious diseases; Male; Medical sciences; Microbial Sensitivity Tests; Middle Aged; Ouganda; Rural Health; Salmonella; Salmonidae; Sepsis - drug therapy; Sepsis - epidemiology; Sepsis - microbiology; septicaemia; septicemia; septicémie; Streptococcus pneumoniae; terapia antirretroviral; thérapie antirétrovirale; Uganda; Uganda - epidemiology; VIH; Viral diseases; Viral diseases of the lymphoid tissue and the blood. Aids; Young Adult; étiologie; Uganda; Africa; antimicrobial; Antiretroviral agent; Drug susceptibility test; antiretroviral therapy; Epidemiology; Antimicrobial agent; Incidence; Etiology; Antiviral; Tropical medicine; Immunopathology; Treatment resistance; septicaemia; Rural environment; Septicemia; Retroviridae; AIDS; Immune deficiency; Lentivirus; Infection; Virus; Chemotherapy; Treatment; HIV; Viral disease; aetiology; Uganda; Human immunodeficiency virus
• ISSN: 1360-2276; 1365-3156
• DOI: 10.1111/j.1365-3156.2010.02528.x

Summary Objectives  To describe the incidence and aetiology of septicaemia, and antimicrobial drug resistance in HIV‐infected and uninfected individuals, and the impact of antiretroviral therapy (ART) on septicaemia. Methods  Between 1996 and 2007, we followed up a rural population–based cohort of HIV‐infected and uninfected participants. The aetiology and incidence of septicaemia, and antimicrobial drug resistances were determined. ART became available in 2004, and its impact on the incidence of septicaemia was examined. Results  The overall septicaemia incidence (per 1000 pyrs) was 32.4 (95% CI 26.2–40.6) but was only 2.6 (95% CI 1.3–6.2) in HIV‐negative patients and 67.1 (95% CI 53.4–85.4) in HIV‐positive patients not on ART. Among those on ART, the overall incidence was 71.5 (95% CI 47.1–114.3), although it was 121.4 (95%CI 77.9–200.4) in the first year on ART and 37.4 (95%CI 18.9–85.2) in the subsequent period. Septicaemia incidence was significantly associated with lower CD4 counts. The commonest isolates were Streptococcus pneumoniae (SPN, n = 68) and Non‐typhi salmonellae (NTS, n = 42). Most SPN isolates were susceptible to ceftriaxone and erythromycin, while resistance to cotrimoxazole and penicillin was common. All NTS isolates were susceptible to ciprofloxacin, but resistance to cotrimoxazole and chloramphenicol was common. Conclusions  Septicaemia incidence was higher in HIV‐infected than in HIV‐uninfected participants, and it remained high for some time among those who started ART. Starting ART earlier at higher CD4 counts is likely to lead to lower septicaemia incidence. Both SPN and NTS, the commonest isolates, were resistant to most commonly available antimicrobials. Blood culture laboratory surveillance systems to monitor antibiotic susceptibility and inform treatment guidelines are needed in Africa. Septicémie dans une cohorte clinique VIH basée sur la population en milieu rural en Ouganda de 1996 à 2007: incidence, étiologie, résistance aux médicaments antimicrobiens et impact de la thérapie antirétrovirale Objectifs:  Décrire l’incidence et l’étiologie de la septicémie, la résistance aux médicaments antimicrobiens chez les individus infectés et non infectés par le VIH et l’impact du traitement antirétroviral sur la septicémie. Méthodes:  Entre 1996 et 2007, une cohorte basée sur la population rurale, de participants infectés et non infectés par le VIH, a été suivie. L’étiologie et l’incidence de la septicémie ainsi que la résistance aux médicaments antimicrobiens ont été déterminées. L’ART est devenue disponible en 2004 et son impact sur l’incidence de la septicémie a été examiné. Résultats:  L’incidence globale de septicémie (pour 1000 personnes‐année) était de 32,4 (IC95%: 26,2 ‐40,6) mais était seulement de 2,6 (IC95%: 1,3 ‐ 6,2) chez les patients VIH‐négatifs et 67,1 (IC95%: 53,4 ‐ 85,4) chez les patients VIH positifs non sous ART. Chez ceux sous ART, l’incidence globale était de 71,5 (IC95%: 47,1 ‐ 114,3), mais elle était de 121,4 (IC95%: 77,9 ‐ 200,4) dans la première année sous ART et 37,4 (IC95%: 18,9 ‐ 85,2) par la suite. L’incidence de septicémie était significativement associée à des taux faibles de CD4. Les isolats les plus courants étaient Streptococcus pneumoniae (SPN, n = 68) et salmonellae non typhi (SNRC, n = 42). La plupart des isolats de SPN étaient sensibles à la ceftriaxone et à l’érythromycine, tandis que la résistance au cotrimoxazole et à la pénicilline était fréquente. ous les isolats de SNRC étaient sensibles à la ciprofloxacine, mais la résistance au cotrimoxazole et au chloramphénicol était fréquente. Conclusions:  L’incidence de septicémie était plus élevée chez les participants infectés que chez ceux non infectés par le VIH, et est restée élevée pendant quelque temps chez ceux qui ont commencé ART. L’ART commencée plus tôt, à des taux plus élevés de CD4 est susceptible de mener à une plus faible incidence des septicémies. Autant SPN que NTS, les deux plus communs isolats, étaient résistants aux antimicrobiens les plus couramment disponibles. Des systèmes de surveillance de laboratoire utilisant la culture d’échantillons sanguins pour contrôler la sensibilité aux antibiotiques et informer les directives de traitement sont nécessaires en Afrique. Septicemia en una cohorte clínica de VIH basada en la población en Uganda rural, 1996 ‐ 2007: incidencia, etiología, resistencia a antibióticos e impacto en la terapia antirretroviral Objetivos:  Describir la incidencia y etiología de la septicemia, y la resistencia a antimicrobianos en individuos infectados y sin infectar con VIH, y el impacto de la terapia antirretroviral sobre la septicemia. Métodos:  Entre 1996 y 2007, seguimos una cohorte basada en una población rural de participantes infectados con VIH y sin infectar. Se determinaron la etiología e incidencia de la septicemia, y las resistencias a medicamentos antimicrobianos. El TAR estuvo disponible a partir del 2004 y se ha examinado su impacto sobre la incidencia de la septicemia. Resultados:  La incidencia total (por 1,000 personas año) era de 32.4 (95% IC 26.2 a 40.6), siendo solamente del 2.6 (95% IC 1.3 a 6.2) en pacientes VIH negativos mientras que en pacientes VIH‐positivos que no estaban en TAR era del 67.1 (95% CI 53.4 a 85.4). Entre aquellos recibiendo TAR, la incidencia total era del 71.5 (95% IC 47.1 a 114.3), aunque era de 121.4 (95%CI 77.9 a 200.4) para pacientes en primer año de TAR y de 37.4 (95%CI 18.9 a 85.2) para pacientes en periodos subsiguientes. La incidencia de septicemia estaba significativamente asociada con un conteo más bajo de CD4. Los aislados más comunes eran Streptococcus pneumoniae (SPN, n=68) y salmonella no‐typhi (SNT, n=42).La mayoría de los aislados de SPN eran susceptibles a ceftriaxona y eritromicina, mientras que la resistencia a cotrimoxazol y penicilina era común. Todos los aislados de SNT eran susceptibles a ciprofloxacino, pero la resistencia a cotrimoxazol y cloranfenicol era común. Conclusiones:  La incidencia de septicemia era mayor entre los infectados con VIH que entre los pacientes no infectados, y se mantuvo alta durante algún tiempo entre aquellos que comenzaron TAR. El comenzar TAR antes, cuando aún se tienen conteos altos de CD4, podría llevar a una menor incidencia de septicemia. Tanto los SPN como NTS, los aislados más comunes, eran resistentes a los antimicrobianos disponibles más comunes. Se requieren sistemas de seguimiento en los laboratorios para los cultivos de sangre con el fin de monitorizar la susceptibilidad antibiótica e informar sobre las guías de tratamiento en África.