Epidemiology and molecular characterization of Cryptococcus neoformans isolated from pigeon excreta in Mazandaran province, northern Iran

• Published in: Journal de mycologie médicale Vol. 22; no. 2; pp. 160 - 166
• Main Authors: Agha Kuchak Afshari, S., Shokohi, T., Aghili, R., Badali, H.
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: Paris Elsevier SAS 01.06.2012; Masson
• Subjects: Agar; Animals; Biochemical characteristics; Biological and medical sciences; Caractérisation moléculaire; Carrier State - microbiology; Carrier State - veterinary; Colonies; Columbidae - microbiology; Cryptococcosis - epidemiology; Cryptococcosis - transmission; Cryptococcus neoformans; Cryptococcus neoformans - genetics; Cryptococcus neoformans - growth & development; Cryptococcus neoformans - isolation & purification; Disease Reservoirs; DNA, Fungal - genetics; DNA, Intergenic - genetics; Epidemiology; Feces - chemistry; Feces - microbiology; Fientes de pigeon; Fundamental and applied biological sciences. Psychology; Genes, Mating Type, Fungal; Humans; Infectious diseases; Iran; Iran - epidemiology; Mating types; Medical sciences; Microbiology; Miscellaneous; Molecular characterization; Molecular Sequence Data; Mycology; Mycoses; Nitrogen; Nitrogen - analysis; Pathogenicity, host-agent relations, miscellaneous strains, epidemiology; Pigeon excreta; Polymerase chain reaction; Primers; Seeds; Sequence Analysis, DNA; Spacer region; Urban Health; Zoonoses; Épidémiologie; Iran; Asia; Middle east; Cryptococcus neoformans; Iran; Caractérisation moléculaire; Épidémiologie; Molecular characterization; Epidemiology; Pigeon excreta; Fientes de pigeon; Fungi; Vertebrata; Yeast; Mycology; Molecular epidemiology; Genotype; Fungi Imperfecti; Aves; Pigeon
• ISSN: 1156-5233; 1773-0449
• DOI: 10.1016/j.mycmed.2012.02.002

The aims of this study were to verify the presence of Cryptococcus neoformans in pigeon excreta in Mazandaran province, Iran, to identify the varieties of the C. neoformans isolates using D1/D2 and IGS sequencing, and determining the presence of the two mating types: α and a. Four hundred pigeon droppings samples were collected from 15 different cities in Mazandaran province over a period of 1 year (February 2010–March 2011). Identification of C. neoformans was determined based on growing brown colonies on Niger seed agar (NSA) and biochemical characteristics. We used MATα and MATa specific primers for determining mating type and sequence analysis of the D1/D2 and intergenic spacer regions were done. Out of 400 samples, 20 samples (5%) were positive for C. neoformans and all of these isolates were α mating types. Sequence analysis of polymerase chain reaction (PCR) amplicons of D1/D2 regions revealed that all of the isolates were C. neoformans var. grubii except two isolates that were C. neoformans var. neoformans. Our results reinforced that the pigeon excreta is a favorable environment rich in nitrogen and supports the growth of C. neoformans and the pigeon could play an important role in spread of this organism. Les objectifs de cette étude étaient de vérifier la présence de Cryptococcus neoformans dans les fientes de pigeons d’origine de la province de Mazandaran (Iran), afin d’identifier les variétés de C. neoformans isolées à l’aide des séquences D1/D2 et IGS et de déterminer la présence des deux types : α et a. Les 400 échantillons d’excréments de pigeons ont été recueillis dans 15 villes différentes de la province de Mazandaran durant une période de plus d’un an (février 2010–mars 2011). L’identification de C. neoformans a été réalisée sur la base de la croissance de colonies brunes sur gélose à base de graines de Niger (NSA) et des caractéristiques biochimiques. Nous avons utilisé les amorces spécifiques MATα et MATa pour déterminer le type sexuel et analysé les séquences D1/D2 et inter-géniques. Sur les 400 échantillons, 20 échantillons (5 %) étaient positifs pour C. neoformans et l’ensemble de tous ces isolats étaient de type α. Les séquences analysées par PCR des amplicons des régions D1/D2 ont révélé que tous les isolats étaient C. neoformans var. grubii sauf deux isolats qui étaient C. neoformans var. neoformans. Nos résultats ont confirmé que les excréments de pigeon sont un environnement favorable riche en azote qui favorise la croissance de C. neoformans et que le pigeon joue un rôle important dans la propagation de cet organisme.