Analysis of a cis-active sequence mediating catabolite repression in Gram-positive bacteria

• Published in: Research in microbiology Vol. 145; no. 7; pp. 503 - 518
• Main Authors: Hueck, C.J, Hillen, W, Saier, M.H
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: Paris Elsevier SAS 1994; Elsevier
• Subjects: Amino Acid Sequence; Analyse des séquences; Bacillus; Bacillus - enzymology; Bacillus - genetics; Bacillus - metabolism; Bacteriology; Bactérie Gram; Biological and medical sciences; Carbohydrate Metabolism; Carbon; Carbone; Catabolism; Catabolisme; Cis-acting element; Elément agissant en cis; Endopeptidases - genetics; Fundamental and applied biological sciences. Psychology; Genes, Regulator - genetics; Genetics; Glycoside Hydrolases - genetics; Gram-Positive Bacteria - enzymology; Gram-Positive Bacteria - genetics; Gram-Positive Bacteria - metabolism; Gram-positive bacterium; In Vitro Techniques; Microbiology; Molecular Sequence Data; Repression; Répression; Sequence analysis; Répression; Carbone; Catabolisme; Bactérie Gram; Repression; Carbon; Analyse des séquences; Bacillus; Gram-positive bacterium; Catabolism; Elément agissant en cis; Sequence analysis; Cis-acting element; Nucleotide sequence; Consensus sequence; Sequence alignment; Bacillaceae; Regulation(control); Bacillales; Gene; Gram positive bacteria; Bacteria; Cis effect; Catabolic repression
• ISSN: 0923-2508; 1769-7123
• DOI: 10.1016/0923-2508(94)90028-0

One form of catabolite repression (CR) in the Gram-positive genus, Bacillus, is mediated by a cis-acting element (CRE). We use here a consensus sequence to identify such elements in sequenced genes of Gram-positive bacteria. These are analysed with respect to position and type of gene in which they occur. CRE sequences near the promoter region are mainly identified in genes encoding carbon catabolic enzymes, which are thus likely to be subject to CR by a global mechanism. Functional aspects of CREs are evaluated. Une forme de répression catabolique chez les bactéries Gram-positives du genre Bacillus est médiée par l'élément CRE agissant en cis. Dans ce travail, nous avons utilisé une séquence consensus pour identifier de tels éléments dans les gènes séquencés des bactéries Gram +. La position de ces éléments et le type de gènes dans lesquels ils sont présents sont analysś. Les séquences CRE sont principalement localisées près de la région promoteur de gènes codant pour les enzymes dy catabolisme du carbone, lesquels sont ainsi probablement soumis à la répression catabolique selon un mécanisme général. Les aspects fonctionnels des séquences CRE sont évalués.