New species emergence via recombination among isolates of the brazilian tomato infecting Begomovirus complex

• Published in: Pesquisa agropecuaria brasileira Vol. 41; no. 8; pp. 1329 - 1332
• Main Authors: Inoue-Nagata, Alice Kazuko, Martin, Darren Patrick, Boiteux, Leonardo Silva, Giordano, Leonardo de Britto, Bezerra, Isabel Cristina, Ávila, Antonio Carlos de
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: Embrapa Informação TecnológicaPesquisa Agropecuária Brasileira 01.08.2006; Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento; Pesquisa Agropecuária Brasileira
• Subjects: AGRICULTURE, DAIRY & ANIMAL SCIENCE; AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY; begomovirus; begomovírus; geminivirus; geminivírus; ISOLAMENTO; ISOLATION TECHNIQUES; LYCOPERSICON ESCULENTUM; PLANT VIRUSES; recombinação viral; TECHNIQUE DE L'ISOLEMENT; TECNICAS DE AISLAMIENTO; TOMATE; VIRUS; VIRUS DE LAS PLANTAS; VIRUS DES VEGETAUX; virus recombination; recombinação viral; begomovirus; begomovírus; geminivírus; geminivirus; virus recombination
• ISSN: 0100-204X; 1678-3921; 1678-3921; 0100-204X
• DOI: 10.1590/S0100-204X2006000800018

Partial nucleotide sequences of five tomato infecting Begomovirus isolates were determined from DNA-A fragments, corresponding to the 5' region of the replication associated protein gene, the intergenic region and the 5' region of the coat protein gene. Isolate DFM shared 95% identity with Tomato mottle leaf curl virus (TMoLCV), isolates 34, PA-05, and Ta4 were 88% identical to Tomato yellow vein streak virus and isolate DF-BR3 shared 77% identity with TMoLCV. Recombination analysis indicated that isolate DF-BR3 was a chimaera, and it provided evidence that there is a complex and actively recombining population of tomato infecting begomoviruses in Brazil. A seqüência de nucleotídeos parcial de cinco isolados de Begomovirus foi determinada do DNA-A, correspendente à região intergênica e à porção 5' do gene associado à replicação e da capa protéica. O isolado DFM apresentou identidade de 95% com Tomato mottle leaf curl virus (TMoLCV); os isolados 34, PA-05 e Ta4 foram 88% idênticos ao Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV); e o isolado DF-BR3 mostrou 77% de identidade com TMoLCV. Análise de recombinação indicou que o isolado DF-BR3 seria uma quimera e evidencia que um complexo de espécies de begomovírus bipartidos está em formação no Brasil.