Reclassification of “ Propionibacterium rubrum” as P. jensenii

• Published in: Research in microbiology Vol. 146; no. 1; pp. 51 - 58
• Main Authors: de Carvalho, A.F, Guezenec, S, Gautier, M, Grimont, P.A.D
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: Paris Elsevier SAS 1995; Elsevier
• Subjects: Bacteriology; Biological and medical sciences; DNA relatedness, 16S rRNA gene, Biochemical characteristics, “ P. rubrum”, P. jensenii, P. thoenii; DNA, Bacterial - genetics; Fundamental and applied biological sciences. Psychology; Homologie ADN-ADN, ARNr 16S, Caractéristiques biochimiques, P. rubrum, P. jensenii, P. thoenii; In Vitro Techniques; Microbiology; Molecular Sequence Data; Nucleic Acid Hybridization; Phenotype; Propionibacterium - classification; Propionibacterium - genetics; RNA, Ribosomal, 16S - genetics; Systematics; Taxonomie, Phylogénétique, Propionibacterlum; Taxonomy, Phylogenetics, Propionibacterium; Taxonomie, Phylogénétique, Propionibacterlum; Taxonomy, Phylogenetics, Propionibacterium; DNA relatedness, 16S rRNA gene, Biochemical characteristics, “ P. rubrum”, P. jensenii, P. thoenii; Homologie ADN-ADN, ARNr 16S, Caractéristiques biochimiques, P. rubrum, P. jensenii, P. thoenii; Propionibacterium thoenii; Taxonomy; DNA; Propionibacteriaceae; 16S-RNA; Bacteria; Actinomycetes; Phylogeny
• ISSN: 0923-2508; 1769-7123
• DOI: 10.1016/0923-2508(96)80270-1

The taxonomic relationship of strains previously designated as “ Propionibacterium rubrum” to P. thoenii and P. jensenii was investigated by use of 16S ribosomal RNA sequence comparison, biochemical characteristics and DNA hybridization. A total of 46 strains representing the species P. jensenii and P. thoenii and the former species “ P. rubrum” and also including 21 reference strains and 25 strains isolated from dairy sources were studied. The 16S rRNA sequence of strain “ P. rubrum” CNRZ 85 (= ATCC 4871) was found to be almost identical to that of the type strain of P. jensenii. DNA hybridization data indicated that “ P. rubrum” should belong to the species P. jensenii rather than P. thoenii, as formerly proposed. The “ P. rubrum” strains should then be reclassified as a β-haemolytic biovar of P. jensenii. The genomic species P. jensenii and P. thoenii could be differentiated by biochemical characteristics such as the production of acid from myo-inoshol and starch. Nous avons vérifié la relation taxonomique entre les souches identifiées comme “ Propionibacterium rubrum” et les espèces P. jensenii et P. thoenii en utilisant la comparaison des séquences de l'AKN ribosomal 16S, les caractéristiques biochimiques et l'hybridation ADN-ADN. Vingt-et-une souches de référence et vingt-cinq souches isolées du lait cm ou du fromage appartenant aux espèces P. jensenii, P. thoenii, et l'ancienne espèce “ P. rubrum” ont étéétudiées. La séquence de l'ARNr 16S de la souche CNRZ 85R (ancienne souche type de l'espèce “ P. rubrum”) est très proche de celle de la souche-type de P. jensenii. L'hybridation ADN-ADN a confirmé que les souches identifiées comme “ P. rubrum” appartenaient au groupe génomique de P. jensenii et non au groupe de P. thoenii comme il a été proposé précédemment. Les souches de “ P. rubrum” pourront être reclassées comme un biovar β-hémolytique de P. jensenii. Les espèces génomiques de P. jensenii et P. thoenii peuvent être différenciées par leurs caractéristiques phénotypiques comme la production d'acide à partir de myo-inositol et d'amidon.