Population structure of Neisseria meningitidis ST-9493 identified in Colombian isolates

• Published in: Enfermedades infecciosas y microbiología clínica Vol. 41; no. 5; pp. 290 - 293
• Main Authors: Alarcon, Zonia Katerin, Prada, Diego, Gabastou, Jean Marc, Sanabria, Olga, Duarte, Carolina, Moreno, Jaime
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: Elsevier España, S.L.U 01.05.2023
• Subjects: Clon; Clone; Multilocus sequence typing; Neisseria meningitidis; Secuenciación de genoma completo; Serogroup B; Serogrupo B; Tipificación multilocus de secuencias; Whole genome sequencing; Secuenciación de genoma completo; Whole genome sequencing; Tipificación multilocus de secuencias; Serogrupo B; Clon; Neisseria meningitidis; Serogroup B; Multilocus sequence typing; Clone
• ISSN: 0213-005X
• DOI: 10.1016/j.eimc.2022.01.016

Neisseria meningitidis is associated with invasive infections causing high mortality rates. The objective of this study was to describe the population structure of Colombian invasive isolates with ST-9493, a potentially emerging clonal group in the country. The complete genomes of 34 invasive isolates of serogroup B with ST-9493 and its variants at one or two loci were sequenced by Illumina to describe the phenotypic and genotypic characteristics of these isolates. The relationship of a clonal group associated with ST-136 CC41/44 was phylogenetically established, identifying two main clades composed of isolates from an outbreak or endemic. The most frequent alleles and peptides included porA 17, porB 44, fHbp 2.24, NHBA 10, and the FetA F5-17 variant. Most of the isolates were susceptible to the antibiotics evaluated. This study shows that meningococcal isolates with ST-9493 are an autochthonous clonal group with population dynamics and the capacity to cause endemic and epidemic meningococcal disease in Colombia. Neisseria meningitidis se asocia con infecciones invasivas que causan altas tasas de mortalidad. El objetivo de este estudio fue describir la estructura poblacional de aislamientos invasivos colombianos con ST-9493, un grupo clonal potencialmente emergente en el país. Se secuenció por Illumina el genoma completo de 34 aislamientos invasivos, serogrupo B con ST-9493 y sus variantes en uno o doble locus para describir sus características fenotípicas y genotípicas. Se estableció filogenéticamente la relación como grupo clonal asociado con el ST-136 CC41/44, identificando 2 clados principales conformados por aislamientos de un brote o endémicos. Los alelos y péptidos más frecuentes fueron porA 17 y porB 44; fHbp 2.24, NHBA 10 y la variante FetA F5-17. La mayoría de los aislamientos fueron susceptibles a los antibióticos evaluados. Este estudio muestra que los aislamientos meningocócicos con ST-9493 son un grupo clonal autóctono con dinámica poblacional y capacidad de causar enfermedad meningocócica endémica y epidémica en Colombia.