Caracterización molecular de Colletotrichum gloeosporioides aislado de plantas de ñame de la Costa Atlántica Colombiana utilizando la técnica “DNA Amplification Fingerprinting (DAF)”

• Published in: Revista Colombiana de biotecnologia Vol. 18; no. 1; pp. 95 - 103
• Main Authors: Giraldo Marroquín, Natalia, Bustamante Rodríguez, Silvia Lizette, Pinzón Gutiérrez, Yeimy Alexandra, Buitrago Hurtado, Gustavo
• Format: Journal Article
• Language: English; Portuguese; Spanish
• Published: Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional de Colombia 01.01.2016; Universidad Nacional de Colombia
• Subjects: ADN; anthracnose; antracnosis; BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY; diversidad genética; DNA; fungi; genetic diversity; hongo; necrosis; anthracnose; genetic diversity; diversidad genética; antracnosis; hongo; necrosis; fungi; DNA; ADN
• ISSN: 0123-3475; 1909-8758; 1909-8758
• DOI: 10.15446/rev.colomb.biote.v18n1.57720

La antracnosis en ñame, causada por el hongo Colletotrichum gloeosporioides, es una enfermedad relevante que posee el potencial de destruir el 100% de la cosecha, convirtiéndose en la principal limitante fitosanitaria para el rendimiento del cultivo en el país. Esta es una situación preocupante considerando que aproximadamente 35.000 familias de pequeños y medianos agricultores de la Costa Atlántica Colombiana subsisten de este cultivo; es por esto que el objetivo de este trabajo fue caracterizar molecularmente 42 aislamientos del hongo procedentes de plantas de ñame con síntomas de la enfermedad, utilizando la técnica molecular “DNA Amplification Fingerprinting (DAF)”, caracterizada por su resolución en la determinación de la variabilidad genética de diferentes organismos. Para la determinación de polimorfismos, se amplificaron 16 marcadores DAF implementando iniciadores tipo decámero, los cuales fueron visualizados por electroforesis en microchip con el equipo MCE-202 MultiNA. Se evaluó la reproducibilidad de la técnica DAF. La amplificación arrojó 391 bandas inequívocamente polimórficas en todas las muestras, el coeficiente de Dice identificó cinco grupos con 0.30% de similaridad y el índice de diversidad genética fue de 0.28; datos que reflejan un alto grado de variabilidad en la colección estudiada de C. gloeosporioides. Ésta puede deberse, al intercambio de germoplasma, a su condición heterotálica, a las mutaciones y al alto potencial de dispersión de las conidias que le permiten mantener la viabilidad bajo condiciones adversas. Por último, se encontró que DAF es una técnica reproducible, confirmando que es una metodología fiable para la caracterización molecular de hongos.