Isolation, bioprospecting and diversity of salt-tolerant bacteria associated with sugarcane in soils of Pernambuco, Brazil

• Published in: Revista brasileira de engenharia agrícola e ambiental Vol. 18; no. suppl; pp. 73 - 79
• Main Authors: Leite, Maria C. B. S., Farias, Andreza R. B. de, Freire, Fernando J., Andreote, Fernando D., Kuklinsky-Sobral, Júlia, Freire, Maria B. G. S.
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: Departamento de Engenharia Agrícola - UFCG 2014
• Subjects: AGRICULTURAL ENGINEERING; ENVIRONMENTAL SCIENCES; endophytic; promoção de crescimento vegetal; endofítica; variabilidade genética; plant growth promotion; genetic variability
• ISSN: 1415-4366; 1807-1929; 1415-4366
• DOI: 10.1590/1807-1929/agriambi.v18nsupps73-s79

ABSTRACT The selection of salinity tolerant bacteria may provide greater promotion of plant growth in soils with salt stress. This study aimed to isolate and select bacterial isolates of sugarcane, tolerant to salinity and plant growth promoters, and assess genetic diversity. To do so, endophytic root and rhizosphere of sugarcane, were isolated in culture medium with and without NaCl. The bacterial population density, the potential for biological nitrogen fixation (BNF), production of indole acetic acid (IAA), inorganic phosphate solubilization and quorum sensing molecule production were evaluated. Furthermore, the genetic diversity was assessed by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) of nifH. Salinity tolerance tests were also conducted. There was no statistical difference in population density. As for the potential for BNF, IAA production, phosphate solubilization and quorum sensing molecule production, there was a high percentage of positive isolates. In the technique of DGGE nifH, the dendrogram showed high genetic variability. So there was the selection of bacteria that can contribute to the better development of sugarcane in saline soils. RESUMO A seleção de bactérias tolerantes a salinidade poderá propiciar maior promoção de crescimento vegetal em solos com estresse salino. Objetivou-se isolar e selecionar isolados bacterianos de cana-de-açúcar, tolerantes à salinidade e promotores de crescimento vegetal, e avaliar a diversidade genética. Para tanto, bactérias endofíticas de raiz e rizosfera, de cana-de-açúcar, foram isoladas, em meio de cultura com e sem NaCl. Avaliou-se a densidade populacional bacteriana, o potencial para a fixação biológica de nitrogênio (FBN), produção de ácido indol acético (AIA), solubilização de fosfato inorgânico e produção da molécula quorum sensing. Além disso, a diversidade genética foi avaliada pela técnica da Eletroforese em Gradiente de Gel Desnaturante (DGGE) do NifH. Testes de tolerância à salinidade também foram realizados. Não houve diferença estatística na densidade populacional. Quanto a FBN, produção de AIA, solubilização de fosfato e produção da molécula quorum sensing, houve alto percentual de isolados positivos. Na técnica do DGGE do gene nifH, o dendrograma indicou alta variabilidade genética. Portanto, houve a seleção de bactérias que possam contribuir para o melhor desenvolvimento da cana-de-açúcar em solos salinos.