Intérêt du séquençage nucléotidique dans l'étude de la transmission du virus de l'immunodéficience humaine (VIH)

• Published in: Revue française des laboratoires Vol. 2000; no. 320; pp. 49 - 53
• Main Authors: Goujon, Christophe-P., Dény, Paul, Milinkovitch, Michel C.
• Format: Journal Article
• Language: French
• Published: Elsevier B.V 01.02.2000
• Subjects: analyses pylogénétiques; enquête; HIV; Infection nosocomiale; Nosocomial infection; nucleotide sequence; nurse-to-patient; phylogenetic analysis; request; soignant-soigné; séquence nucléotidique; VIH; nucleotide sequence; soignant-soigné; Nosocomial infection; request; phylogenetic analysis; VIH; HIV; enquête; Infection nosocomiale; analyses pylogénétiques; séquence nucléotidique; nurse-to-patient
• ISSN: 0338-9898
• DOI: 10.1016/S0338-9898(00)80396-0

A la suite d'une demande des autorités sanitaires françaises, nous avons été confrontés à l'étude d'une hypothèse de transmission nosocomiale soignant-soigné du virus VIH1. En prenant ce cas pour exemple, nous décrivons notre démarche (analyses phylogénétiques des séquences nucléotidiques provirales et virales) et les précautions prises pour obtenir des résultats fiables. Dans une situation où deux soignants séropositifs pour le VIH1 ont été en contact avec le soigné, nos résultats moléculaires, intégrés au contexte clinique, démontrent que le virus infectant l'un des deux soignants n'est en aucun cas la source d'infection du patient et suggèrent que le virus infectant l'autre soignant soit probablement la source de l'infection nosocomiale. Devant une telle hypothèse de transmission virale, il faut insister sur l'importance d'un travail synergique entre les laboratoires de virologie, de bio-informatique et de génétique de l'évolution. Following a request from the French sanitary authorities, we have investigated the hypothesis of a nosocomial nurse-to-patient transmission of HIV1. Taking this case as a model, we describe here the methodologies we followed (molecular phylogenetic analyses of viral and proviral nucleotide sequences) to reach reliable conclusions. Our results, integrated to the clinical context, and based on extensive analyses using multiple methodologies, allowed us to unambigously exclude one HIV-positive nurse and strongly suggest the other HIV-positive nurse as the source of infection of the patient. It is important to insist that such investigations of transmission hypotheses require a multidisciplinary approach integrating competences from virology, bio-informatics, and evolutionary genetics laboratories.