教育のための手計算によるクラスター分析

• Published in: Japanese journal of crop science Vol. 78; no. 3; pp. 395 - 398
• Main Authors: Anas, 吉田, 智彦, 小林, 俊一
• Format: Journal Article
• Language: Japanese
• Published: 日本作物学会 2009
• Subjects: クラスター分析; 手計算; 教育; 樹状図
• ISSN: 0011-1848; 1349-0990
• DOI: 10.1626/jcs.78.395

生物種あるいは品種間の相互関係を表示するために，通常はコンピュータソフトを利用したクラスター分析により樹状図を作成しているが，教育的効果を目的としてコンピュータを用いず手動でクラスター分析をすることを試みた．オオムギ品種間のRAPD分析によるDNA多型データを用いて，品種間で異なるバンドを示したDNAマーカー数（異なるマーカー数）をその品種間での距離とした．まず，異なるマーカー数の最も少ない組合せを選び，それを最初のクラスターとした．次にそのクラスターの平均値からの距離と残りの品種との間の値を計算し直して，第2のクラスターを決定し，順次同様に行っていった．育成地の異なるオオムギの二条，六条種を含む品種間で試みたところ，ほぼ満足すべき結果が得られた．コンピュータソフトを利用した結果とも一致した．本方法では，クラスター分析を手計算で行うことにより，理解が容易であり，教育的効果が大きい．