基于生物信息学方法和免疫组化分析FASN在宫颈癌组织的表达及临床意义

R737.33; 目的 利用生物信息学方法和免疫组化分析脂肪酸合酶(FASN)在宫颈癌(CC)组织中的表达水平及相应的临床意义.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载CC患者的RNA测序数据及临床信息,通过R4.2.2提取FASN表达数据,并结合患者的临床特征,探讨FASN在CC组织中的表达水平、与临床特征的相关性以及患者预后的关系.同时,通过基因集富集(GSEA)揭示FASN相关的生物学功能和信号通路.最后,通过免疫组化实验证实了FASN在CC组织中的表达,并分析了FASN表达的免疫组化(IHC)评分与临床特征的相关性.结果 (1)TCGA数据库及本研究的临床标本均证实,与癌旁组织相...

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Published in生物医学转化 Vol. 5; no. 1; pp. 101 - 116
Main Authors 徐欣, 张珊, 廖丽鑫, 郭钰珍
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 兰州大学第二医院(第二临床医学院),甘肃 兰州 730030 2024
Subjects
Immunohistochemistry
生物信息学
脂肪酸合酶
宫颈癌
Fatty acid synthase
临床意义
Bioinformatics
Clinical significance
免疫组化
Cervical cancer
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ISSN2096-8965
DOI10.12287/j.issn.2096-8965.20240112

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Summary:R737.33; 目的 利用生物信息学方法和免疫组化分析脂肪酸合酶(FASN)在宫颈癌(CC)组织中的表达水平及相应的临床意义.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载CC患者的RNA测序数据及临床信息,通过R4.2.2提取FASN表达数据,并结合患者的临床特征,探讨FASN在CC组织中的表达水平、与临床特征的相关性以及患者预后的关系.同时,通过基因集富集(GSEA)揭示FASN相关的生物学功能和信号通路.最后,通过免疫组化实验证实了FASN在CC组织中的表达,并分析了FASN表达的免疫组化(IHC)评分与临床特征的相关性.结果 (1)TCGA数据库及本研究的临床标本均证实,与癌旁组织相比,FASN在CC组织中呈现高表达(P<0.001,P=0.028 5),并与淋巴结转移和病理分级显著相关(P<0.001,P=0.029;P=0.012,P=0.047).(2)FASN在CC患者中表达水平较高者,其总生存期与无进展生存期明显缩短(P<0.001,P<0.001).(3)FASN表达的IHC高评分组CC患者的身体质量指数(BMI)显著高于低评分组(P<0.001).(4)HPV感染状态对于FASN表达的IHC评分高低具有显著差异性(P<0.001).(5)FASN高表达CC患者的基因富集在癌症途径、细胞外基质-受体相关作用、氮代谢、黑色素瘤和肌动蛋白细胞骨架等调节通路.结论 FASN在CC组织中高表达,且与患者淋巴结转移、病理分级、HPV感染状态、BMI和不良预后相关,有望成为诊断CC的新兴生物标志物及治疗靶点.
ISSN:2096-8965
DOI:10.12287/j.issn.2096-8965.20240112