Ccr-lncRNA172145靶向miR-206在锦鲤体色调控中的作用初探

S917.4; 为了解非编码RNA在锦鲤体色分化变异中的分子调控机制,在课题组前期对锦鲤皮肤组织转录组测序的基础上,筛选到4条在3种皮肤(黑色、红色、白色)组织中显著差异表达的lncRNA;基于RNAhybrid和TargetScan靶基因预测软件,发现lncRNA172145与黑色素合成通路中miR-206之间存在靶向结合位点.借助CPC、CPAT及CNIT软件,对lncRNA172145编码能力进行分析,证实该序列为lncRNA,不具备编码蛋白的能力.然后,利用qRT-PCR技术对该序列时空表达水平进行了检测,发现在眼睛、黑色皮肤、鳍条及血液中表达量显著高于其他组织;自原肠胚时期表达量开始...

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Published in水产学报 Vol. 45; no. 12; pp. 1955 - 1964
Main Authors 罗明坤, 王兰梅, 朱文彬, 傅建军, 董在杰
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡 214128 2021
中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室,江苏无锡 214081%中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室,江苏无锡 214081
Subjects
锦鲤;Ccr-lncRNA172145;miR-206;体色
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ISSN1000-0615
DOI10.11964/jfc.20201112496

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Abstract S917.4; 为了解非编码RNA在锦鲤体色分化变异中的分子调控机制,在课题组前期对锦鲤皮肤组织转录组测序的基础上,筛选到4条在3种皮肤(黑色、红色、白色)组织中显著差异表达的lncRNA;基于RNAhybrid和TargetScan靶基因预测软件,发现lncRNA172145与黑色素合成通路中miR-206之间存在靶向结合位点.借助CPC、CPAT及CNIT软件,对lncRNA172145编码能力进行分析,证实该序列为lncRNA,不具备编码蛋白的能力.然后,利用qRT-PCR技术对该序列时空表达水平进行了检测,发现在眼睛、黑色皮肤、鳍条及血液中表达量显著高于其他组织;自原肠胚时期表达量开始显著上升,高水平趋势一直持续到孵化后20d.通过双荧光素酶报告实验,进一步证实lncRNA172145与miR-206之间存在靶向调控关系.最后,通过合成miR-206拮抗剂,对miR-206进行体内沉默,发现与注射阴性对照拮抗剂组和PBS组相比,miR-206拮抗剂组的lncRNA172145表达水平显著升高.研究表明,lncRNA172145可能通过靶向到miR-206,参与到黑色素合成通路的调控,这为后续深入挖掘二者在黑色素合成通路中具体的分子机制提供了基础资料.
AbstractList S917.4; 为了解非编码RNA在锦鲤体色分化变异中的分子调控机制,在课题组前期对锦鲤皮肤组织转录组测序的基础上,筛选到4条在3种皮肤(黑色、红色、白色)组织中显著差异表达的lncRNA;基于RNAhybrid和TargetScan靶基因预测软件,发现lncRNA172145与黑色素合成通路中miR-206之间存在靶向结合位点.借助CPC、CPAT及CNIT软件,对lncRNA172145编码能力进行分析,证实该序列为lncRNA,不具备编码蛋白的能力.然后,利用qRT-PCR技术对该序列时空表达水平进行了检测,发现在眼睛、黑色皮肤、鳍条及血液中表达量显著高于其他组织;自原肠胚时期表达量开始显著上升,高水平趋势一直持续到孵化后20d.通过双荧光素酶报告实验,进一步证实lncRNA172145与miR-206之间存在靶向调控关系.最后,通过合成miR-206拮抗剂,对miR-206进行体内沉默,发现与注射阴性对照拮抗剂组和PBS组相比,miR-206拮抗剂组的lncRNA172145表达水平显著升高.研究表明,lncRNA172145可能通过靶向到miR-206,参与到黑色素合成通路的调控,这为后续深入挖掘二者在黑色素合成通路中具体的分子机制提供了基础资料.
Author 董在杰
朱文彬
罗明坤
王兰梅
傅建军
AuthorAffiliation 南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡 214128;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室,江苏无锡 214081%中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室,江苏无锡 214081
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