滇龙胆GrHDR基因的克隆与表达分析

Q943; 龙胆苦苷(gentiopicroside)是中药龙胆中的主要药效成分,属于萜类化合物的衍生物.1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-二磷酸还原酶[1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl-4-diphosphate reductase,HDR]是萜类物质合成途径中的关键酶.为探讨不同光照条件下滇龙胆HDR(GrHDR)基因的表达与龙胆苦苷含量之间的关系,该文以滇龙胆叶片cDNA为模板,采用PCR和TA克隆技术获得GrHDR基因序列,对该序列进行生物信息学分析和表达分析,并采用高效液相色谱法测定龙胆苦苷含量,对该基因表达与龙胆苦苷含量进行比较.结果表明:...

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Published in广西植物 Vol. 41; no. 6; pp. 1004 - 1013
Main Authors 杜波, 蔡传涛, 张霁
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 中国科学院大学, 北京 100049 2021
云南省农业科学院药用植物研究所, 昆明 650200
中国科学院大学, 北京 100049%中国科学院西双版纳热带植物园, 昆明 650221%中国科学院西双版纳热带植物园, 昆明 650221
中国科学院西双版纳热带植物园, 昆明 650221
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Abstract Q943; 龙胆苦苷(gentiopicroside)是中药龙胆中的主要药效成分,属于萜类化合物的衍生物.1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-二磷酸还原酶[1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl-4-diphosphate reductase,HDR]是萜类物质合成途径中的关键酶.为探讨不同光照条件下滇龙胆HDR(GrHDR)基因的表达与龙胆苦苷含量之间的关系,该文以滇龙胆叶片cDNA为模板,采用PCR和TA克隆技术获得GrHDR基因序列,对该序列进行生物信息学分析和表达分析,并采用高效液相色谱法测定龙胆苦苷含量,对该基因表达与龙胆苦苷含量进行比较.结果表明:(1)GrHDR基因(GenBank登录号:KJ917165.1)全长1398 bp,编码465个氨基酸,推定GrHDR蛋白是亲水且稳定的,相对分子质量是52281.25 Da,理论等电点是5.32;(2)该蛋白属于LYTB蛋白家族,可能定位于叶绿体上,无信号肽,二级结构主要由 α-螺旋(45.16%)、β-转角(6.24%)、无规卷曲(33.98%)、延伸链(14.62%)构成;(3)GrHDR蛋白序列与同属植物秦艽的HDR蛋白相似性最高(95.71%);(4)实时荧光定量PCR结果显示GrHDR基因在滇龙胆中的表达量为根>叶>茎,而在10%、30%、100%全光光照条件下各组织的表达量有很大差异;(5)高效液相色谱法结果显示,不同光照条件下龙胆苦苷含量一致,均为根>叶>茎,其中100%全光光照下,药用部位根中龙胆苦苷含量达到7.141%,约是30%、10%全光光照条件的两倍,但该结果与同一光照条件下GrHDR基因表达规律不完全一致.该研究为阐述HDR基因功能及其与龙胆苦苷含量的关系提供参考.
AbstractList Q943; 龙胆苦苷(gentiopicroside)是中药龙胆中的主要药效成分,属于萜类化合物的衍生物.1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-二磷酸还原酶[1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl-4-diphosphate reductase,HDR]是萜类物质合成途径中的关键酶.为探讨不同光照条件下滇龙胆HDR(GrHDR)基因的表达与龙胆苦苷含量之间的关系,该文以滇龙胆叶片cDNA为模板,采用PCR和TA克隆技术获得GrHDR基因序列,对该序列进行生物信息学分析和表达分析,并采用高效液相色谱法测定龙胆苦苷含量,对该基因表达与龙胆苦苷含量进行比较.结果表明:(1)GrHDR基因(GenBank登录号:KJ917165.1)全长1398 bp,编码465个氨基酸,推定GrHDR蛋白是亲水且稳定的,相对分子质量是52281.25 Da,理论等电点是5.32;(2)该蛋白属于LYTB蛋白家族,可能定位于叶绿体上,无信号肽,二级结构主要由 α-螺旋(45.16%)、β-转角(6.24%)、无规卷曲(33.98%)、延伸链(14.62%)构成;(3)GrHDR蛋白序列与同属植物秦艽的HDR蛋白相似性最高(95.71%);(4)实时荧光定量PCR结果显示GrHDR基因在滇龙胆中的表达量为根>叶>茎,而在10%、30%、100%全光光照条件下各组织的表达量有很大差异;(5)高效液相色谱法结果显示,不同光照条件下龙胆苦苷含量一致,均为根>叶>茎,其中100%全光光照下,药用部位根中龙胆苦苷含量达到7.141%,约是30%、10%全光光照条件的两倍,但该结果与同一光照条件下GrHDR基因表达规律不完全一致.该研究为阐述HDR基因功能及其与龙胆苦苷含量的关系提供参考.
Author 蔡传涛
杜波
张霁
AuthorAffiliation 中国科学院西双版纳热带植物园, 昆明 650221;中国科学院大学, 北京 100049%中国科学院西双版纳热带植物园, 昆明 650221%中国科学院西双版纳热带植物园, 昆明 650221;中国科学院大学, 北京 100049;云南省农业科学院药用植物研究所, 昆明 650200
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Wanfang Data Journals
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China Online Journals (COJ)
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Issue 6
Keywords 组织表达分析
GrHDR基因
滇龙胆
序列分析
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