膜蕨科植物rbc L基因的适应性进化和共进化分析

Q941.2; 膜蕨科植物是薄囊蕨类中种类最多的科,主要分布在潮湿的热带地区,拥有陆生、附生、半附生和攀生等多种生态型.为进一步了解膜蕨科植物辐射式物种分化的分子适应机制,该研究在时间框架下采用位点模型对膜蕨科植物rbcL基因的进化式样进行分析.结果表明:共鉴定出6个氨基酸正选择位点(125I、227L、231A、258F、304S和351L),其中位点304S位于环六上,对维持Rubisco功能有重要作用.此外,还计算了Rubisco大亚基内部氨基酸位点之间的共进化关系,共检测出39组(35个氨基酸)共进化位点,其中位点在α螺旋上的占46%,在β折叠上的占14%.膜蕨科植物rbcL基因这种复...

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Published in广西植物 Vol. 37; no. 2; pp. 145 - 152
Main Authors 王春波, 郭治友
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 黔南民族师范学院 生物科学与农学院,贵州 都匀,558000 2017
Subjects
膜蕨科
正选择位点
rbcL gene
coevolution
rbcL基因
Hymenophyllaceae
生态型
positive selection
ecotypes
共进化
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ISSN1000-3142
DOI10.11931/guihaia.gxzw201601031

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Summary:Q941.2; 膜蕨科植物是薄囊蕨类中种类最多的科,主要分布在潮湿的热带地区,拥有陆生、附生、半附生和攀生等多种生态型.为进一步了解膜蕨科植物辐射式物种分化的分子适应机制,该研究在时间框架下采用位点模型对膜蕨科植物rbcL基因的进化式样进行分析.结果表明:共鉴定出6个氨基酸正选择位点(125I、227L、231A、258F、304S和351L),其中位点304S位于环六上,对维持Rubisco功能有重要作用.此外,还计算了Rubisco大亚基内部氨基酸位点之间的共进化关系,共检测出39组(35个氨基酸)共进化位点,其中位点在α螺旋上的占46%,在β折叠上的占14%.膜蕨科植物rbcL基因这种复杂的进化式样可能与其起源较早有关.鉴于此,基于UCLD分子钟模型对膜蕨科植物的分化时间进行了估计,结果显示膜蕨科植物首次发生分歧的时间在三叠纪早期,瓶蕨属和膜蕨属的分歧时间分别发生在侏罗纪早期和白垩纪晚期,并且得出陆生生态型是其它生态型进化的基础,推测最近几次最热事件可能对物种分化的形成产生一定的作用.该研究结果对认识膜蕨科植物如何应对被子植物兴起所导致的陆地生态系统改变具重要意义.
ISSN:1000-3142
DOI:10.11931/guihaia.gxzw201601031