武夷名丛叶绿体基因组序列特征及系统发育分析

• Published in: 南方农业学报 Vol. 54; no. 5; pp. 1352 - 1362
• Main Authors: 黎巷汝, 赵雅琦, 张艳, 赵佳林, 刘菲, 张渤, 洪永聪, 李力
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 福建农林大学园艺学院,福建福州 350002 2023; 武夷学院茶与食品学院,福建南平 354300%福建农林大学农学院,福建福州 350002%武夷学院茶与食品学院,福建南平 354300
• Subjects: 系统发育; phylogenetic analysis; 武夷名丛; 叶绿体基因组; Wuyi Mingcong; 序列特征; chloroplast genome; sequence feature

S571.103.53; [目的]分析武夷名丛叶绿体基因组序列特征及系统发育进化关系,为加强武夷名丛种质鉴定及其资源多样性的开发利用提供参考依据.[方法]利用PacBio和Illumina高通量测序技术对5个武夷名丛品种(白鸡冠、半天妖、肉桂、水金龟和铁罗汉)叶绿体基因组进行测序、组装和注释,并结合已发表的大红袍叶绿体基因组序列进行叶绿体全基因组序列比较及系统发育进化分析.[结果]6个武夷名丛品种的叶绿体基因组的长度为157024～157126 bp,均由环状双链DNA组成,包含2个反向重复区(IR)(25944～26095 bp)、1个大单拷贝区(LSC)(86594～86859 bp)和1...