35份甘蔗种质的遗传多样性分析及 DNA指纹图谱构建
S566.102.4; [目的]利用SRAP分子标记分析35份甘蔗种质的遗传多样性,并构建其DNA指纹图谱,为甘蔗种质资源的分子鉴定提供技术支持.[方法]以凉蔗系列(26份)为主的35个甘蔗品种(系)为供试材料,利用SRAP分子标记的8条正向引物和14条反向引物随机组成112对引物组合,从中筛选出核心引物对35份甘蔗材料进行遗传多样性分析,并利用POPGENE 1.32计算各材料间的Nei's遗传相似系数,使用Ntsyspc 2.1 UPGMA方法进行聚类分析,并构建DNA指纹图谱.[结果]从112对引物组合中筛选出4对核心引物组合(Me3/Em8、Me4/Em8、Me5/Em8和M...
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Published in | 南方农业学报 Vol. 50; no. 6; pp. 1157 - 1164 |
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Main Authors | , , , , , , , , |
Format | Journal Article |
Language | Chinese |
Published |
广西农业科学院广西亚热带作物研究所,南宁 530001
2019
广西农业科学院广西亚热带作物研究所广西农垦甘蔗研究所,南宁 530001%广西农业科学院广西亚热带作物研究所,南宁,530001%玉林师范学院,广西玉林,537000 |
Subjects | |
Online Access | Get full text |
ISSN | 2095-1191 |
DOI | 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.06.01 |
Cover
Abstract | S566.102.4; [目的]利用SRAP分子标记分析35份甘蔗种质的遗传多样性,并构建其DNA指纹图谱,为甘蔗种质资源的分子鉴定提供技术支持.[方法]以凉蔗系列(26份)为主的35个甘蔗品种(系)为供试材料,利用SRAP分子标记的8条正向引物和14条反向引物随机组成112对引物组合,从中筛选出核心引物对35份甘蔗材料进行遗传多样性分析,并利用POPGENE 1.32计算各材料间的Nei's遗传相似系数,使用Ntsyspc 2.1 UPGMA方法进行聚类分析,并构建DNA指纹图谱.[结果]从112对引物组合中筛选出4对核心引物组合(Me3/Em8、Me4/Em8、Me5/Em8和Me6/Em2),利用其从35份甘蔗材料中共扩增出102条条带,平均每对引物的扩增条带数、多态性条带数和多态性比率分别为25.5条、21条和81.20%,各引物组合扩增的条带数为21~30条,多态性比率为61.90%~96.55%.根据Nei's遗传相似系数,在遗传相似系数为0.751时,可将35份甘蔗材料分为五大类,26个凉蔗系列品种(系)(除凉蔗07-54外)均归在I类和II类,说明凉蔗系列的亲缘关系较近;桂糖73-167和农垦2号分别被单独归为一类,说明这两个品种(系)间及与其他品种(系)间的亲缘关系较远;I类中除凉蔗系列之外,还包括粤糖91-976和ROC16,说明这两个品种(系)有可能是I类中凉蔗系列的杂交亲本或存在血缘关系;II类中除凉蔗系列外,还包括B8、ROC22、ROC24和ROC10,说明这4个品种(系)的亲缘关系较近,ROC系列可能存在II类中凉蔗系列的亲本.利用这4对核心引物组合构建的DNA指纹图谱均可将35份甘蔗材料鉴别开.[结论]35份甘蔗材料的遗传多样性丰富,构建的DNA指纹图谱可用于甘蔗品种(系)鉴定. |
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AbstractList | S566.102.4; [目的]利用SRAP分子标记分析35份甘蔗种质的遗传多样性,并构建其DNA指纹图谱,为甘蔗种质资源的分子鉴定提供技术支持.[方法]以凉蔗系列(26份)为主的35个甘蔗品种(系)为供试材料,利用SRAP分子标记的8条正向引物和14条反向引物随机组成112对引物组合,从中筛选出核心引物对35份甘蔗材料进行遗传多样性分析,并利用POPGENE 1.32计算各材料间的Nei's遗传相似系数,使用Ntsyspc 2.1 UPGMA方法进行聚类分析,并构建DNA指纹图谱.[结果]从112对引物组合中筛选出4对核心引物组合(Me3/Em8、Me4/Em8、Me5/Em8和Me6/Em2),利用其从35份甘蔗材料中共扩增出102条条带,平均每对引物的扩增条带数、多态性条带数和多态性比率分别为25.5条、21条和81.20%,各引物组合扩增的条带数为21~30条,多态性比率为61.90%~96.55%.根据Nei's遗传相似系数,在遗传相似系数为0.751时,可将35份甘蔗材料分为五大类,26个凉蔗系列品种(系)(除凉蔗07-54外)均归在I类和II类,说明凉蔗系列的亲缘关系较近;桂糖73-167和农垦2号分别被单独归为一类,说明这两个品种(系)间及与其他品种(系)间的亲缘关系较远;I类中除凉蔗系列之外,还包括粤糖91-976和ROC16,说明这两个品种(系)有可能是I类中凉蔗系列的杂交亲本或存在血缘关系;II类中除凉蔗系列外,还包括B8、ROC22、ROC24和ROC10,说明这4个品种(系)的亲缘关系较近,ROC系列可能存在II类中凉蔗系列的亲本.利用这4对核心引物组合构建的DNA指纹图谱均可将35份甘蔗材料鉴别开.[结论]35份甘蔗材料的遗传多样性丰富,构建的DNA指纹图谱可用于甘蔗品种(系)鉴定. |
Author | 韦丽君 檀小辉 庞新华 吕平 程琴 张继 黄秋伟 周全光 梁芳 |
AuthorAffiliation | 广西农业科学院广西亚热带作物研究所,南宁 530001;广西农业科学院广西亚热带作物研究所广西农垦甘蔗研究所,南宁 530001%广西农业科学院广西亚热带作物研究所,南宁,530001%玉林师范学院,广西玉林,537000 |
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DOI | 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.06.01 |
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DocumentTitle_FL | Genetic diversity analysis for 35 sugarcane germplasm resources and construction of DNA fingerprint |
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ISSN | 2095-1191 |
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Issue | 6 |
Keywords | 甘蔗 遗传多样性 DNA指纹图谱 SRAP分子标记 |
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PublicationTitle | 南方农业学报 |
PublicationTitle_FL | Journal of Southern Agriculture |
PublicationYear | 2019 |
Publisher | 广西农业科学院广西亚热带作物研究所,南宁 530001 广西农业科学院广西亚热带作物研究所广西农垦甘蔗研究所,南宁 530001%广西农业科学院广西亚热带作物研究所,南宁,530001%玉林师范学院,广西玉林,537000 |
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Title | 35份甘蔗种质的遗传多样性分析及 DNA指纹图谱构建 |
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