Usporedba vrijednosti dvaju različitih kompleta početnica za dokaz vrste Pasteurella caballi lančanom reakcijom polimerazom u uzorcima bronhoalveolarnog ispirka ždrebadi čistokrvnoga arapskog konja

• Published in: Veterinarski arhiv Vol. 86; no. 2; p. 173
• Main Authors: Sayin, Zafer, Erganis, Osman, Sakmanoglu, Asli, Hadimli, Hasan H, Pinarkara, Yasemin, Maden, Mehmet, Al Shattrawi, Huda J. G
• Format: Paper
• Language: Croatian; English
• Published: Veterinarski fakultet Sveučilišta u Zagrebu 22.04.2016
• Subjects: 16S rRNA; Arabian foals; arapski konj; lančana reakcija polimerazom; Pasteurella caballi; polymerase chain reaction; Primer 3; Primer-BLAST; ždrebad
• ISSN: 0372-5480; 1331-8055

Pasteurella caballi (P. caballi) izdvojena je i identificirana u uzorcima bronhoalveolarnog ispirka i tkiva pluća ždrebadi čistokrvnoga arapskoga konja uobičajenim mikrobiološkim postupcima. Potom je istražena vrijednost dvaju različitih kompleta početnica za dokaz i potvrdu vrste P. caballi lančanom reakcijom polimerazom. Početnica 1 za dokaz gena 16S rRNA P. caballi bila je pripremljena upotrebom programa Primer 3, a početnica 2 upotrebom programa Primer-BLAST. Lančana reakcija polimerazom rabljena je za potvrdu sojeva vrste P. caballi i za njezin izravni dokaz u uzorcima bronhoalveolarnog ispirka i plućnoga tkiva. Ukupno je bilo izdvojeno 35 izolata Pasteurella spp. iz 25 (38,4 %) od 65 pretraženih uzoraka bronhoalveolarnog ispirka i 10 (58,8 %) izolata iz 17 uzoraka plućnoga tkiva. Ti su sojevi bili identificirani na osnovi poznatih mikrobioloških i biokemijskih značajki. Početnice 1 i 2 pokazale su 100 %-tnu osjetljivost za identifikaciju uzgojenih sojeva. Međutim, početnica set-1 za dokaz vrste P. caballi bila je slabije specifičnosti od početnice set-2 pri pretrazi uzoraka bronhoalveolarnog ispirka i plućnoga tkiva. Osjetljivost i specifičnost početnice 2 bila je povrđena analizom genske sekvencije. Istraživanje pokazuje da početnica set-2 za lančanu reakciju polimerazom za dokaz 16S rRNA pruža brz i točan alat za dokazivanje i potvrdu izolata vrste P. caballi u bronhoalveolarnom ispirku i plućnom tkivu ždrebadi.