METHODS AND SYSTEMS FOR COMPUTATIONAL DECODING OF BIOLOGICAL, CHEMICAL, AND PHYSICAL ENTITIES

The present disclosure provides systems and methods for detecting components of an array of biological, chemical, or physical entities. In an aspect, the present disclosure provides a method for detecting an array of biological, chemical, or physical entities, comprising: (a) using one or more light...

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Main Authors LOBANOV, Vadim, STERN, David, MALLICK, Parag, PATEL, Sujal M, SEGHERS, Ryan K, EGERTSON, Jarrett D
Format Patent
LanguageEnglish
French
Published 16.12.2021
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Abstract The present disclosure provides systems and methods for detecting components of an array of biological, chemical, or physical entities. In an aspect, the present disclosure provides a method for detecting an array of biological, chemical, or physical entities, comprising: (a) using one or more light sensing devices, acquiring pixel information from sites in an array, wherein the sites comprise biological, chemical, or physical entities that produce light; (b) processing the pixel information to identify a set of regions of interest (ROIs) corresponding to the sites in the array that produce the light; (c) classifying the pixel information for the ROIs into a categorical classification from among a plurality of distinct categorical classifications, thereby producing a plurality of pixel classifications; and (d) identifying one or more components of the array of biological, chemical, or physical entities based at least in part on the plurality of pixel classifications. La présente invention concerne des systèmes et des procédés pour détecter des éléments d'un réseau d'entités biologiques, chimiques ou physiques. Selon un aspect, la présente invention concerne un procédé pour détecter un réseau d'entités biologiques, chimiques ou physiques, lequel procédé consiste à : (a) à l'aide d'un ou plusieurs dispositifs de détection de lumière, acquérir des informations de pixel à partir de sites dans un réseau, les sites comprenant des entités biologiques, chimiques ou physiques qui produisent de la lumière ; (b) traiter les informations de pixel pour identifier un ensemble de régions d'intérêt (ROI) correspondant aux sites dans le réseau qui produisent la lumière ; (c) classifier les informations de pixel pour les ROI dans une classification catégorielle parmi une pluralité de classifications catégorielles distinctes, permettant ainsi de produire une pluralité de classifications de pixels ; et (d) identifier un ou plusieurs éléments du réseau d'entités biologiques, chimiques ou physiques sur la base, au moins en partie, de la pluralité de classifications de pixels.
AbstractList The present disclosure provides systems and methods for detecting components of an array of biological, chemical, or physical entities. In an aspect, the present disclosure provides a method for detecting an array of biological, chemical, or physical entities, comprising: (a) using one or more light sensing devices, acquiring pixel information from sites in an array, wherein the sites comprise biological, chemical, or physical entities that produce light; (b) processing the pixel information to identify a set of regions of interest (ROIs) corresponding to the sites in the array that produce the light; (c) classifying the pixel information for the ROIs into a categorical classification from among a plurality of distinct categorical classifications, thereby producing a plurality of pixel classifications; and (d) identifying one or more components of the array of biological, chemical, or physical entities based at least in part on the plurality of pixel classifications. La présente invention concerne des systèmes et des procédés pour détecter des éléments d'un réseau d'entités biologiques, chimiques ou physiques. Selon un aspect, la présente invention concerne un procédé pour détecter un réseau d'entités biologiques, chimiques ou physiques, lequel procédé consiste à : (a) à l'aide d'un ou plusieurs dispositifs de détection de lumière, acquérir des informations de pixel à partir de sites dans un réseau, les sites comprenant des entités biologiques, chimiques ou physiques qui produisent de la lumière ; (b) traiter les informations de pixel pour identifier un ensemble de régions d'intérêt (ROI) correspondant aux sites dans le réseau qui produisent la lumière ; (c) classifier les informations de pixel pour les ROI dans une classification catégorielle parmi une pluralité de classifications catégorielles distinctes, permettant ainsi de produire une pluralité de classifications de pixels ; et (d) identifier un ou plusieurs éléments du réseau d'entités biologiques, chimiques ou physiques sur la base, au moins en partie, de la pluralité de classifications de pixels.
Author EGERTSON, Jarrett D
MALLICK, Parag
SEGHERS, Ryan K
LOBANOV, Vadim
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