CONSENSUS CODING SEQUENCES OF HUMAN BREAST AND COLORECTAL CANCERS

• Main Authors: PARSONS, D., WILLIAMS, JONES, SIAN, MANDELKER, DIANA, VELCULESU, VICTOR, E, SJOBLOM, TOBIAS, KINZLER, KENNETH, W, LIN, JIMMY, WOOD, LAURA, D, BARBER, THOMAS, VOGELSTEIN, BERT
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 21.02.2008
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

Analysis of 13,023 genes in 11 breast and 11 colorectal cancers revealed that individual tumors accumulate an average of ~90 mutant genes but that only a subset of these contribute to the neoplastic process. Using stringent criteria to delineate this subset, we identified 189 genes (average of 11 per tumor) that were mutated at significant frequency. The vast majority of these genes were not known to be genetically altered in tumors and are predicted to affect a wide range of cellular functions, including transcription, adhesion, and invasion. These data define the genetic landscape of two human cancer types, provide new targets for diagnostic and therapeutic intervention and monitoring. L'analyse faisant l'objet de la présente invention, portant sur 13 023 gènes présents dans 11 cancers du sein et 11 cancers colorectaux, a révélé que les tumeurs individuelles rassemblent une moyenne de ~ 90 gènes mutants mais que seul un sous-ensemble de ceux-ci contribue au processus néoplasique. L'utilisation de critères rigoureux pour définir ce sous-ensemble a permis d'identifier 189 gènes (une moyenne de 11 par tumeur) qui avaient muté avec une fréquence significative. La grande majorité de ces gènes n'est pas connue pour être génétiquement modifiée dans des tumeurs et elle est supposée affecter une large gamme de fonctions cellulaires, y compris la transcription, l'adhérence, et l'invasion. Ces données définissent le tableau génétique de deux types de cancers humains et définissent de nouvelles cibles pour une intervention et un suivi diagnostique et thérapeutique.