A SYSTEM, METHOD, AND COMPUTER PROGRAM PRODUCT FOR ANALYZING SPECTROMETRY DATA TO INDENTIFY AND QUANTIFY INDIVIDUAL COMPONENTS IN A SAMPLE

A system is provided for analyzing metabolomics data received from an analytical device across a group of samples. The system automatically receives a data matrix corresponding to each of the samples, wherein the data matrix includes rows corresponding to each of the samples and columns correspondin...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors YOUNG, SIDNEY, STANLEY, BARRETT, THOMAS, HENRY, BEECHER, CHRISTOPHER, WILLIAM
Format Patent
LanguageEnglish
French
Published 08.11.2007
Subjects
Online AccessGet full text

Cover

Loading…
Abstract A system is provided for analyzing metabolomics data received from an analytical device across a group of samples. The system automatically receives a data matrix corresponding to each of the samples, wherein the data matrix includes rows corresponding to each of the samples and columns corresponding to a group of ions present in the respective samples. A processor is provided for determining a characteristic value corresponding to at least one of a group of components present in the samples, wherein the components are made up of at least a portion of the group of ions, using at least one of a correlation function and a factorization function. A user interface is in communication with the processor for displaying a visual indication of the characteristic value such that a user may receive a visual indication of the types of components present in the samples. L'invention porte sur un système d'analyse de données de métabolites reçues d'un dispositif d'analyse par l'intermédiaire d'un groupe d'échantillons. Le système reçoit automatiquement au moins une matrice de données correspondant à chacun des échantillons, ladite matrice comprenant des rangées correspondant à chacun des échantillons, et des colonnes correspondant à un groupe d'ions présent dans chacun des échantillons. Un processeur détermine une valeur caractéristique correspondant à au moins un groupe de composants présents dans les échantillons, lesdits composants étant composés d'au moins une partie des groupes d'ions, en utilisant au moins une fonction de corrélation et une fonction de factorisation. Une interface utilisateur communique avec le processeur pour afficher une indication visuelle de la valeur caractéristique de manière à ce qu'un utilisateur puisse recevoir une indication visuelle des types de composants présents dans les échantillons.
AbstractList A system is provided for analyzing metabolomics data received from an analytical device across a group of samples. The system automatically receives a data matrix corresponding to each of the samples, wherein the data matrix includes rows corresponding to each of the samples and columns corresponding to a group of ions present in the respective samples. A processor is provided for determining a characteristic value corresponding to at least one of a group of components present in the samples, wherein the components are made up of at least a portion of the group of ions, using at least one of a correlation function and a factorization function. A user interface is in communication with the processor for displaying a visual indication of the characteristic value such that a user may receive a visual indication of the types of components present in the samples. L'invention porte sur un système d'analyse de données de métabolites reçues d'un dispositif d'analyse par l'intermédiaire d'un groupe d'échantillons. Le système reçoit automatiquement au moins une matrice de données correspondant à chacun des échantillons, ladite matrice comprenant des rangées correspondant à chacun des échantillons, et des colonnes correspondant à un groupe d'ions présent dans chacun des échantillons. Un processeur détermine une valeur caractéristique correspondant à au moins un groupe de composants présents dans les échantillons, lesdits composants étant composés d'au moins une partie des groupes d'ions, en utilisant au moins une fonction de corrélation et une fonction de factorisation. Une interface utilisateur communique avec le processeur pour afficher une indication visuelle de la valeur caractéristique de manière à ce qu'un utilisateur puisse recevoir une indication visuelle des types de composants présents dans les échantillons.
Author BEECHER, CHRISTOPHER, WILLIAM
YOUNG, SIDNEY, STANLEY
BARRETT, THOMAS, HENRY
Author_xml – fullname: YOUNG, SIDNEY, STANLEY
– fullname: BARRETT, THOMAS, HENRY
– fullname: BEECHER, CHRISTOPHER, WILLIAM
BookMark eNqNjk0KwjAUhLvQhX93eOC2QrWodPlIUg00SU1flbgpReJKqqCn8NTGnwO4Gmb4Zphh1OuunR9ET4TKVSRUDErQ1vAYUHNgRpU1CQulNRuL6q28ZgS5sQHAwh2l3kBVCkbWhKZ1wJEQyIDUXGiSufss7Wr8mhDLveQ1Fp91owNUhRTCA1RlIcZR_9xe7n7y01E0zQWx7czfro2_39qT7_yjOZhFkqznSbZaZpim_1EvdxtBxA
ContentType Patent
DBID EVB
DatabaseName esp@cenet
DatabaseTitleList
Database_xml – sequence: 1
  dbid: EVB
  name: esp@cenet
  url: http://worldwide.espacenet.com/singleLineSearch?locale=en_EP
  sourceTypes: Open Access Repository
DeliveryMethod fulltext_linktorsrc
Discipline Medicine
Chemistry
Sciences
Physics
DocumentTitleAlternate SYSTÈME, PROCÉDÉ ET PROGRAMME INFORMATIQUE D'ANALYSE DE DONNÉES SPECTROMÉTRIQUES POUR IDENTIFIER ET QUANTIFIER DES COMPOSANTS INDIVIDUELS DANS UN ÉCHANTILLON
ExternalDocumentID WO2007109659A3
GroupedDBID EVB
ID FETCH-epo_espacenet_WO2007109659A33
IEDL.DBID EVB
IngestDate Fri Jul 19 14:50:46 EDT 2024
IsOpenAccess true
IsPeerReviewed false
IsScholarly false
Language English
French
LinkModel DirectLink
MergedId FETCHMERGED-epo_espacenet_WO2007109659A33
Notes Application Number: WO2007US64385
OpenAccessLink https://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&date=20071108&DB=EPODOC&CC=WO&NR=2007109659A3
ParticipantIDs epo_espacenet_WO2007109659A3
PublicationCentury 2000
PublicationDate 20071108
PublicationDateYYYYMMDD 2007-11-08
PublicationDate_xml – month: 11
  year: 2007
  text: 20071108
  day: 08
PublicationDecade 2000
PublicationYear 2007
RelatedCompanies BEECHER, CHRISTOPHER, WILLIAM
METABOLON, INC
YOUNG, SIDNEY, STANLEY
BARRETT, THOMAS, HENRY
RelatedCompanies_xml – name: BARRETT, THOMAS, HENRY
– name: BEECHER, CHRISTOPHER, WILLIAM
– name: METABOLON, INC
– name: YOUNG, SIDNEY, STANLEY
Score 2.684378
Snippet A system is provided for analyzing metabolomics data received from an analytical device across a group of samples. The system automatically receives a data...
SourceID epo
SourceType Open Access Repository
SubjectTerms CALCULATING
COMPUTING
COUNTING
ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
PHYSICS
Title A SYSTEM, METHOD, AND COMPUTER PROGRAM PRODUCT FOR ANALYZING SPECTROMETRY DATA TO INDENTIFY AND QUANTIFY INDIVIDUAL COMPONENTS IN A SAMPLE
URI https://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&date=20071108&DB=EPODOC&locale=&CC=WO&NR=2007109659A3
hasFullText 1
inHoldings 1
isFullTextHit
isPrint
link http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/link/0/eLvHCXMwfR1dT8IwsEH8fFPU-IGmiWZPEJV9wB6IKesGM2xdtoLMF7IvEhMziGD8D_5qbwWUJ56aXttLv669u95dEbrXlImewc6ot9RoUlcikFNiPZbrDU1On-SJ_JgKL1fH1XoD5WWkjkroY-0LI-KEfovgiEBRCdD7QpzXs38lFhW2lfOH-B1A02eLt6m0lo6bhVW7RDtt02OUGZJhgNwmuf6yrIh0ohN5B-0CI90sDMDMYafwS5ltXirWMdrzAF--OEGlLK-gQ2P991oFHTirJ-8K2hc2mskcgCs6nJ-iH4KDMOCmU8OOyXuM1jBxKTaY4w2AP8Wez7o-cYqUDgyOQdSDCqQfvtluFweeaXCfQUs_xJRwgjnDtktNl9tWKDABo7vMANge2nRA-gI7c6FSAFAMPSCO1zfP0J1lcqNXh-GN_2Zz_Mo250I-R-V8mmcXCDeTqBVrWiPNHiNFmyiRGukt4G6iVJb1pKFeouo2TFfbi6_RkVCLCo1sFZUXn1_ZDdzni_hWLMMvOPmYcQ
link.rule.ids 230,309,783,888,25578,76884
linkProvider European Patent Office
linkToHtml http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/link/0/eLvHCXMwfR1dT8Iw8IL4gW-KGj9Qm2h4gohsjO2BmLIOmG7rMgqCL2SDkZgYIILxP_irvRVQnnhqem0v_br27np3BbjX1LER484o6pVwXFRDlFMiI1KKZU0ZPSpjpTSSXq6up7U66nOv0kvBx9oXRsYJ_ZbBEZGihkjvC3lez_6VWEzaVs4foncETZ8aosbya-m4mli151m9ZvmccTNvmii35b1gWZZEOjGosgO7yGTrSaR9q1tP_FJmm5dK4wj2fMQ3WRxDKp5kIWOu_17LwoG7evLOwr600RzOEbiiw_kJ_FDS7reF5RaIa4kWZwVCPUZM7vod5E-JH_BmQN0kZR1TEBT1sAJ1-m-21yRt3zJFwLFl0CeMCkoEJ7bHLE_Yjb7EhIzuMoNgu2uzDnUkdu5hpTZCCfaAur5jncJdwxJmq4jDG_zN5uCVb86FcgbpyXQSnwOpDkM90rTyKC6FqjZWw0po6MjdhCNFMYblygXktmG63F58C5mWcJ2BY3svV3AoVaRSO5uD9OLzK77Gu30R3cgl-QWJCpth
openUrl ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info%3Aofi%2Fenc%3AUTF-8&rfr_id=info%3Asid%2Fsummon.serialssolutions.com&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Apatent&rft.title=A+SYSTEM%2C+METHOD%2C+AND+COMPUTER+PROGRAM+PRODUCT+FOR+ANALYZING+SPECTROMETRY+DATA+TO+INDENTIFY+AND+QUANTIFY+INDIVIDUAL+COMPONENTS+IN+A+SAMPLE&rft.inventor=YOUNG%2C+SIDNEY%2C+STANLEY&rft.inventor=BARRETT%2C+THOMAS%2C+HENRY&rft.inventor=BEECHER%2C+CHRISTOPHER%2C+WILLIAM&rft.date=2007-11-08&rft.externalDBID=A3&rft.externalDocID=WO2007109659A3