대규모의 성능 예측을 개선하기 위해 소규모 미생물에 대한 실험 및 플레이트 모델을 디자인하기 위한 매개변수 축소

• Main Authors: ENYEART PETER, SERBER ZACHARIAH, TREYNOR THOMAS, HAUCK TRENT, DE KOK STEFAN, HUMPHRIES CRYSTAL, HANSEN RICHARD, LIEDER SARAH, SHELLMAN ERIN, TAYLOR AMELIA, TYNER KRISTINA
• Format: Patent
• Language: Korean
• Published: 14.01.2022
• Subjects: APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PHYSICS; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

시스템, 방법 및 컴퓨터 판독 가능 매체가 제 2의 더 큰 규모에서 유기체의 성능을 예측하는 데 사용되는 제 1 규모 성능 데이터를 생성하기 위해 제 1 규모에서 유기체에 대한 실험을 디자인하기 위해 제공된다. 디자인은 제 2 규모에서 유기체의 성능 매개변수에 대한 제 2 규모 조건의 기여도에 적어도 부분적으로 기초하여 제 1 규모 선별 조건을 결정하는 것을 포함한다. 제 1 선별 조건은 제 1 규모에서 복제할 수 없는 제 2 규모 조건에 대한 하나 이상의 프록시를 포함한다. 디자인은 제 2 규모에서 유기체의 대사의 컴퓨터 모델링에 적어도 부분적으로 기초하여 제 1 규모의 선별 매개변수를 결정한다. Systems, methods and computer-readable media are provided for designing experiments for organisms at a first scale to generate first-scale performance data used in predicting performance of the organisms at a second, larger scale. The design includes determining first-scale screening conditions based at least in part upon the contribution of second-scale conditions to performance parameters of an organism at the second scale. The first-scale screening conditions include one or more proxies for second-scale conditions that cannot be replicated at first scale. The design determines first-scale screening parameters based at least in part upon computer modeling of the metabolism of the organism at the second scale.