표현형 최적화의 처리량을 증가시키기 위한 유전자 변형의 우선순위 결정
표현형 성능을 개선시키기 위해 하나 이상의 미생물 균주 내에서 유전자에 적용할 변형을 결정하기 위한 시스템, 방법 및 컴퓨터 판독 가능 매체가 제공된다. 본 발명은 적어도 하나의 미생물 균주에서 제 1 유전자 세트에 이루어진 제 1 유전자 변형에 적어도 부분적으로 기초하여 제 1 표현형 성능 데이터에 접근하는 단계; 제 1 표현형 성능 데이터 및 제 1 유전자 변형 및 제 2 유전자 변형에 공통적인 적어도 하나의 변형 특징에 적어도 부분적으로 기초하여, 제 2 유전자 변형의 제 2 표현형 성능을 예측하는 단계; 및 제 2 표현형 성...
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| Main Authors | , , , , |
|---|---|
| Format | Patent |
| Language | Korean |
| Published |
13.02.2020
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| Abstract | 표현형 성능을 개선시키기 위해 하나 이상의 미생물 균주 내에서 유전자에 적용할 변형을 결정하기 위한 시스템, 방법 및 컴퓨터 판독 가능 매체가 제공된다. 본 발명은 적어도 하나의 미생물 균주에서 제 1 유전자 세트에 이루어진 제 1 유전자 변형에 적어도 부분적으로 기초하여 제 1 표현형 성능 데이터에 접근하는 단계; 제 1 표현형 성능 데이터 및 제 1 유전자 변형 및 제 2 유전자 변형에 공통적인 적어도 하나의 변형 특징에 적어도 부분적으로 기초하여, 제 2 유전자 변형의 제 2 표현형 성능을 예측하는 단계; 및 제 2 표현형 성능에 적어도 부분적으로 기초하여 제 2 유전자 변형에 적용되도록 제 2 유전자 변형의 우선순위를 결정하는 단계를 교시한다.
Systems, methods and computer-readable media are provided for determining modifications to apply to genes within at least one microbial strain to improve phenotypic performance. The disclosure teaches accessing first phenotypic performance data based at least in part upon first gene modifications made to a first set of genes in at least one microbial strain; predicting second phenotypic performance of second gene modifications, based at least in part upon the first phenotypic performance data and at least one modification feature that is common to the first gene modifications and the second gene modifications; and prioritizing the second gene modifications to be applied to a second set of genes based at least in part upon the second phenotypic performance. |
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| AbstractList | 표현형 성능을 개선시키기 위해 하나 이상의 미생물 균주 내에서 유전자에 적용할 변형을 결정하기 위한 시스템, 방법 및 컴퓨터 판독 가능 매체가 제공된다. 본 발명은 적어도 하나의 미생물 균주에서 제 1 유전자 세트에 이루어진 제 1 유전자 변형에 적어도 부분적으로 기초하여 제 1 표현형 성능 데이터에 접근하는 단계; 제 1 표현형 성능 데이터 및 제 1 유전자 변형 및 제 2 유전자 변형에 공통적인 적어도 하나의 변형 특징에 적어도 부분적으로 기초하여, 제 2 유전자 변형의 제 2 표현형 성능을 예측하는 단계; 및 제 2 표현형 성능에 적어도 부분적으로 기초하여 제 2 유전자 변형에 적용되도록 제 2 유전자 변형의 우선순위를 결정하는 단계를 교시한다.
Systems, methods and computer-readable media are provided for determining modifications to apply to genes within at least one microbial strain to improve phenotypic performance. The disclosure teaches accessing first phenotypic performance data based at least in part upon first gene modifications made to a first set of genes in at least one microbial strain; predicting second phenotypic performance of second gene modifications, based at least in part upon the first phenotypic performance data and at least one modification feature that is common to the first gene modifications and the second gene modifications; and prioritizing the second gene modifications to be applied to a second set of genes based at least in part upon the second phenotypic performance. |
| Author | CHOWDHURY ANUPAM THORN KURT SHEARER ALEXANDER ENYEART PETER FLASHMAN MICHAEL |
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