SYSTEMS AND METHODS FOR ASSESSING DRUG EFFICACY

• Main Authors: ONUCHIC, VITOR FERREIRA, WANG, MENGCHI, WISE, AARON, ZHANG, SHILE, KANG, HAN, KRUGLYAK, KRISTINA
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 06.06.2019
• Subjects: CALCULATING; COMPUTER SYSTEMS BASED ON SPECIFIC COMPUTATIONAL MODELS; COMPUTING; COUNTING; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; PHYSICS

Provided is a computer-implemented method, including inputting to a trained machine learning classifier genomic information of a non-training subject that includes features from a tumor sample, wherein the trained machine learning classifier trained on features of tumor samples obtained from training subjects and their a responsiveness to checkpoint inhibition treatment and the machine-learning classifier is trained to predict responsiveness to the treatment, and generating a checkpoint inhibition responsiveness classification predictive of the subject's responding to the checkpoint inhibition with the trained machine-learning classifier, and reporting the checkpoint inhibition responsiveness classification using a graphical user interface. Also provided are a computer system for performing the method and a machine learning classifier trained by the method. L'invention concerne un procédé mis en uvre par ordinateur, consistant à entrer dans une machine entraînée des informations génomiques de classificateur d'un sujet hors formation qui comprend des caractéristiques tirées d'un échantillon de tumeur, le classificateur d'apprentissage automatique entraîné étant entraîné sur des caractéristiques d'échantillons de tumeur obtenus de sujets de formation et leur réactivité au traitement d'inhibition de point de contrôle et le classificateur d'apprentissage automatique étant entraîné pour prédire la réactivité au traitement, et à générer une classification de réactivité d'inhibition de point de contrôle prédictive de la réponse du sujet à l'inhibition de point de contrôle au moyen du classificateur d'apprentissage machine entraîné, et à rapporter la classification de réactivité d'inhibition de point de contrôle à l'aide d'une interface utilisateur graphique. L'invention concerne également un système informatique permettant de mettre en uvre le procédé et un classificateur d'apprentissage automatique entraîné par le procédé.