基于经皮冠状动脉介入治疗术后支架内再狭窄的免疫相关基因及免疫细胞浸润的生物信息学分析

• Published in: 吉林大学学报（医学版） Vol. 50; no. 3; pp. 749 - 758
• Main Authors: 冯玉飞, 金珊, 王玉冰, 鲁印飞, 庞丽娟, 刘克坚
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 广东省湛江市湛江中心人民医院病理科,广东 湛江 524000 28.05.2024; 石河子大学第一附属医院病理科,新疆 石河子 832000; 石河子大学第一附属医院心内一科,新疆 石河子 832000%石河子大学医学院病理系,新疆 石河子 832000; 石河子大学第一附属医院病理科,新疆 石河子 832000%石河子大学医学院病理系,新疆 石河子 832000
• Subjects: 免疫浸润; Biomarker; 支架内再狭窄; 差异表达免疫相关基因; CD19; Immune infiltration; 生物标志物; In-stent restenosis; Differentially expressed immune-related gene
• ISSN: 1671-587X
• DOI: 10.13481/j.1671-587X.20240319

R392.12; 目的:筛选支架内再狭窄(ISR)中差异表达的免疫相关基因(DEIRGs),分析ISR中免疫细胞浸润情况,并阐明ISR发生发展的机制.方法:由基因表达数据库(GEO)下载GSE46560数据集样本mRNA基因表达数据,分为ISR组与非ISR(non-ISR)组.采用R软件"Limma"包筛选出差异表达基因(DEGs)并与免疫相关基因(IRGs)交集获得ISR中DEIRGs.采用R软件进行DEIRGs的基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,采用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,以Cytoscape软件可视化并计算核...