基于MSR1 mRNA和蛋白在泛癌组织中表达的生物信息学分析及其意义

• Published in: 吉林大学学报（医学版） Vol. 49; no. 2; pp. 425 - 439
• Main Authors: 张德洪, 郑明珠, 李家秋, 路中
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 潍坊医学院临床医学院,山东 潍坊 261053%潍坊医学院附属医院肿瘤科,山东 潍坊 261031 28.03.2023
• Subjects: 肿瘤微环境; 泛癌; 脂质代谢; 巨噬细胞清道夫受体1; 免疫治疗
• ISSN: 1671-587X
• DOI: 10.13481/j.1671-587X.20230219

R730.3; 目的:通过生物信息学分析探讨巨噬细胞清道夫受体1(MSR1)在泛癌组织中的表达水平、患者生存情况和免疫特性,阐明MSR1作为新的生物标志物对肿瘤的诊断、预后和免疫治疗的价值.方法:采用临床生信之家数据库和Sangerbox数据库分析正常组织和肿瘤组织中MSR1 mRNA表达水平,采用人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析MSR1蛋白表达情况,采用单因素生存分析和Kaplan-Meier分析评估MSR1对预后的价值,采用肿瘤免疫单细胞中心(TISCH)数据库的单细胞测序结果分析MSR1在各种细胞类型中的表达情况,采用肿瘤免疫估计资源(TIMER2.0)、肿瘤免疫共基因小鼠(TISMO)、肿瘤免疫功能障碍与排斥(TIDE)和基因集癌症分析(GSCA)数据库分析泛癌组织中MSR1表达水平与免疫细胞浸润、免疫检查点基因表达和免疫治疗反应之间的相关性.结果:与正常组织比较,在17种肿瘤组织中MSR1 mRNA表达水平上调,包括乳腺浸润性癌(BRCA)、结肠腺癌(COAD)、食道癌(ESCA)、多形性胶质母细胞瘤(GBM)、头颈部鳞状细胞癌(HNSC)、肾透明细胞癌(KIRC)、肾性肾乳头状细胞癌(KIRP)、脑低级别胶质瘤(LGG)、肝细胞癌(LIHC)、卵巢浆液性囊腺癌(OV)、胰腺腺癌(PAAD)、前列腺癌(PRAD)、皮肤黑色素瘤(SKCM)、胃腺癌(STAD)、睾丸生殖细胞肿瘤(TGCT)、甲状腺癌(THCA)和子宫颈肉瘤(UCS)(P<0.01);与正常组织比较,乳腺癌、子宫内膜癌、肝癌、卵巢癌、皮肤黑色素瘤、睾丸癌、胰腺癌和前列腺癌组织中MSR1蛋白表达水平也有不同程度的升高.在膀胱尿路上皮癌(BLCA)[风险比(HR)=1.01,P=0.047,95％CI(1.00,1.03)]、LGG[HR=1.03,P<0.001,95％CI(1.02,1.04)]、LIHC[HR=1.04,P=0.007,95％CI(1.01,1.07)]、OV[HR=1.02,P=0.028,95％CI(1.00,1.03)]、STAD[HR=1.02,P=0.016,95％CI(1.00,1.04)]、THCA[HR=1.06,P=0.006,95％CI(1.02,1.11)]和葡萄膜黑色素瘤(UVM)[HR=1.18,P=0.044,95％CI(1.00,1.40)]中MSR1高表达与患者较差的总生存期(OS)有关;