膜穿孔蛋白E在上皮性卵巢癌组织中的表达水平及其临床意义
R737.31; 目的:探讨膜穿孔蛋白E(GSDME)在上皮性卵巢癌(EOC)组织中的表达水平,阐明GSDME对EOC发生发展的影响.方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,利用R语言分析正常组织和EOC组织中GSDME mRNA表达水平及其表达水平与EOC发生的关系.利用差异性分析、基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、基因集富集分析(GSEA)、蛋白-蛋白互作(PPI)网络、HUB基因互作网络和免疫浸润分析探讨与GSDME相关联的基因、信号通路及其对EOC发生发展的影响.收集40例EOC患者组织病理切片,按病理分级分为低...
Saved in:
Published in | 吉林大学学报(医学版) Vol. 49; no. 2; pp. 440 - 451 |
---|---|
Main Authors | , , , , , , |
Format | Journal Article |
Language | Chinese |
Published |
吉林大学护理学院康复治疗学教研室,吉林 长春 130021%吉林大学第二医院妇产科,吉林 长春 130021%延边大学药学院药剂学教研室,吉林 延吉 133002
28.03.2023
|
Subjects | |
Online Access | Get full text |
ISSN | 1671-587X |
DOI | 10.13481/j.1671-587X.20230220 |
Cover
Abstract | R737.31; 目的:探讨膜穿孔蛋白E(GSDME)在上皮性卵巢癌(EOC)组织中的表达水平,阐明GSDME对EOC发生发展的影响.方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,利用R语言分析正常组织和EOC组织中GSDME mRNA表达水平及其表达水平与EOC发生的关系.利用差异性分析、基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、基因集富集分析(GSEA)、蛋白-蛋白互作(PPI)网络、HUB基因互作网络和免疫浸润分析探讨与GSDME相关联的基因、信号通路及其对EOC发生发展的影响.收集40例EOC患者组织病理切片,按病理分级分为低级别(中分化及高分化,24例)组和高级别(低分化,16例)组,按照对顺铂(DDP)的敏感程度分为DDP耐药组和DDP敏感组.另收集正常卵巢、良性卵巢瘤和交界性卵巢癌组织切片各5例作为对照,利用免疫组织化学(IHC)法检测所有组织切片中GSDME的表达强度.取10对新鲜的卵巢癌组织和癌旁组织,采用Western blotting法检测2组样本中GSDME蛋白表达水平.体外培养Skov3和Skov3/DDP细胞,采用Western blotting法检测细胞中GSDME蛋白表达水平,分析其与卵巢癌耐药的关系.结果:TCGA和GTEx数据库中非配对样本分析,与正常卵巢组织比较,EOC组织中GSDME mRNA表达水平明显降低(P<0.05),且高级别组EOC组织中GSDME mRNA表达水平低于低级别组(P<0.05).GSDME单基因差异分析,上调基因有460个,下调基因有329个[Log2差异倍数(FC)的绝对值大于1,即|Log2FC|>1,P<0.05].功能富集及免疫浸润分析,GSDME高表达可以上调循环免疫球蛋白介导的体液免疫反应通路、白细胞迁移通路和免疫球蛋白复合体通路的活性,促进肿瘤微环境中免疫细胞的浸润.IHC染色,GSDME与EOC的病理组织分级及耐药有关,其中DDP敏感组EOC组织中GSDME表达强度明显高于DDP耐药组(P<0.05).Western blotting法检测,与癌旁组织比较,EOC组织中GSDME蛋白表达水平明显降低(P<0.05);与Skov3细胞比较,Skov3/DDP细胞中GSDME蛋白表达水平明显降低(P<0.05).结论:GSDME与EOC的恶性程度和耐药表现有密切关联.GSDME |
---|---|
AbstractList | R737.31; 目的:探讨膜穿孔蛋白E(GSDME)在上皮性卵巢癌(EOC)组织中的表达水平,阐明GSDME对EOC发生发展的影响.方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,利用R语言分析正常组织和EOC组织中GSDME mRNA表达水平及其表达水平与EOC发生的关系.利用差异性分析、基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、基因集富集分析(GSEA)、蛋白-蛋白互作(PPI)网络、HUB基因互作网络和免疫浸润分析探讨与GSDME相关联的基因、信号通路及其对EOC发生发展的影响.收集40例EOC患者组织病理切片,按病理分级分为低级别(中分化及高分化,24例)组和高级别(低分化,16例)组,按照对顺铂(DDP)的敏感程度分为DDP耐药组和DDP敏感组.另收集正常卵巢、良性卵巢瘤和交界性卵巢癌组织切片各5例作为对照,利用免疫组织化学(IHC)法检测所有组织切片中GSDME的表达强度.取10对新鲜的卵巢癌组织和癌旁组织,采用Western blotting法检测2组样本中GSDME蛋白表达水平.体外培养Skov3和Skov3/DDP细胞,采用Western blotting法检测细胞中GSDME蛋白表达水平,分析其与卵巢癌耐药的关系.结果:TCGA和GTEx数据库中非配对样本分析,与正常卵巢组织比较,EOC组织中GSDME mRNA表达水平明显降低(P<0.05),且高级别组EOC组织中GSDME mRNA表达水平低于低级别组(P<0.05).GSDME单基因差异分析,上调基因有460个,下调基因有329个[Log2差异倍数(FC)的绝对值大于1,即|Log2FC|>1,P<0.05].功能富集及免疫浸润分析,GSDME高表达可以上调循环免疫球蛋白介导的体液免疫反应通路、白细胞迁移通路和免疫球蛋白复合体通路的活性,促进肿瘤微环境中免疫细胞的浸润.IHC染色,GSDME与EOC的病理组织分级及耐药有关,其中DDP敏感组EOC组织中GSDME表达强度明显高于DDP耐药组(P<0.05).Western blotting法检测,与癌旁组织比较,EOC组织中GSDME蛋白表达水平明显降低(P<0.05);与Skov3细胞比较,Skov3/DDP细胞中GSDME蛋白表达水平明显降低(P<0.05).结论:GSDME与EOC的恶性程度和耐药表现有密切关联.GSDME |
Author | 赵淑华 刘淑香 郑晶莹 陈猛猛 陈俊宇 房正轩 高燕 |
AuthorAffiliation | 吉林大学护理学院康复治疗学教研室,吉林 长春 130021%吉林大学第二医院妇产科,吉林 长春 130021%延边大学药学院药剂学教研室,吉林 延吉 133002 |
AuthorAffiliation_xml | – name: 吉林大学护理学院康复治疗学教研室,吉林 长春 130021%吉林大学第二医院妇产科,吉林 长春 130021%延边大学药学院药剂学教研室,吉林 延吉 133002 |
Author_FL | LIU Shuxiang CHEN Mengmeng FANG Zhengxuan GAO Yan ZHENG Jingying ZHAO Shuhua CHEN Junyu |
Author_FL_xml | – sequence: 1 fullname: CHEN Mengmeng – sequence: 2 fullname: CHEN Junyu – sequence: 3 fullname: GAO Yan – sequence: 4 fullname: FANG Zhengxuan – sequence: 5 fullname: ZHAO Shuhua – sequence: 6 fullname: ZHENG Jingying – sequence: 7 fullname: LIU Shuxiang |
Author_xml | – sequence: 1 fullname: 陈猛猛 – sequence: 2 fullname: 陈俊宇 – sequence: 3 fullname: 高燕 – sequence: 4 fullname: 房正轩 – sequence: 5 fullname: 赵淑华 – sequence: 6 fullname: 郑晶莹 – sequence: 7 fullname: 刘淑香 |
BookMark | eNrjYmDJy89LZWCQNTTQMzQ2sTDUz9IzNDM31DW1MI_QMzIwMjYwMjJgYeCEC3Iw8BYXZyYZGBgZGFuaGxlzMvi_aJvzfOX-p2unvJjd_XzmXtenc1Y82dH1fNa6Zw3Ln_Zufbp90fOZPc93tzzf3f5kx9rns1peLFzxYt--Zxu2PN25-Wl_19PWbU92bHm6q-tZS_-TnZ08DKxpiTnFqbxQmpsh1M01xNlD18ff3dPZ0Ue32NDA1EDXyNIyxTzROMk0MdEwMdnC3CzN2NAo1cTSIjkxJcXCxMzILNXS3MzQLM081SzZMDUl1dDcPNnENNXUJDUFqMnEmJtBC2JueWJeWmJeenxWfmlRHtDG-KTC1MrslIqKJEgAgLwKALwhcOY |
ClassificationCodes | R737.31 |
ContentType | Journal Article |
Copyright | Copyright © Wanfang Data Co. Ltd. All Rights Reserved. |
Copyright_xml | – notice: Copyright © Wanfang Data Co. Ltd. All Rights Reserved. |
DBID | 2B. 4A8 92I 93N PSX TCJ |
DOI | 10.13481/j.1671-587X.20230220 |
DatabaseName | Wanfang Data Journals - Hong Kong WANFANG Data Centre Wanfang Data Journals 万方数据期刊 - 香港版 China Online Journals (COJ) China Online Journals (COJ) |
DatabaseTitleList | |
DeliveryMethod | fulltext_linktorsrc |
DocumentTitle_FL | Expression level of gasdermin E in epithelial ovarian cancer tissue and its clinical significance |
EndPage | 451 |
ExternalDocumentID | bqeykdxxb202302020 |
GrantInformation_xml | – fundername: 吉林省科技厅自然科学基金项目 funderid: (20200201589JC) |
GroupedDBID | -05 2B. 4A8 92I 93N ALMA_UNASSIGNED_HOLDINGS CCEZO CIEJG PSX TCJ |
ID | FETCH-LOGICAL-s1050-299d7a3b5aa1ac876f312e498cadd84626e97616f7e6c1ede177c45e54edb5a43 |
ISSN | 1671-587X |
IngestDate | Thu May 29 04:07:10 EDT 2025 |
IsPeerReviewed | false |
IsScholarly | true |
Issue | 2 |
Keywords | 基因表达 上皮性卵巢肿瘤 生物信息学 膜穿孔蛋白E |
Language | Chinese |
LinkModel | OpenURL |
MergedId | FETCHMERGED-LOGICAL-s1050-299d7a3b5aa1ac876f312e498cadd84626e97616f7e6c1ede177c45e54edb5a43 |
PageCount | 12 |
ParticipantIDs | wanfang_journals_bqeykdxxb202302020 |
PublicationCentury | 2000 |
PublicationDate | 2023-03-28 |
PublicationDateYYYYMMDD | 2023-03-28 |
PublicationDate_xml | – month: 03 year: 2023 text: 2023-03-28 day: 28 |
PublicationDecade | 2020 |
PublicationTitle | 吉林大学学报(医学版) |
PublicationTitle_FL | Journal of Jilin University(Medicine Edition) |
PublicationYear | 2023 |
Publisher | 吉林大学护理学院康复治疗学教研室,吉林 长春 130021%吉林大学第二医院妇产科,吉林 长春 130021%延边大学药学院药剂学教研室,吉林 延吉 133002 |
Publisher_xml | – name: 吉林大学护理学院康复治疗学教研室,吉林 长春 130021%吉林大学第二医院妇产科,吉林 长春 130021%延边大学药学院药剂学教研室,吉林 延吉 133002 |
SSID | ssib002039723 ssib051370734 ssib001103979 ssib002806622 ssib001050969 ssj0001844652 ssib009969601 ssib006703839 ssib000970483 ssib036438310 |
Score | 2.3209193 |
Snippet | R737.31; 目的:探讨膜穿孔蛋白E(GSDME)在上皮性卵巢癌(EOC)组织中的表达水平,阐明GSDME对EOC发生发展的影响.方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,利用R语言分析正常组织和EOC组织中GSDME... |
SourceID | wanfang |
SourceType | Aggregation Database |
StartPage | 440 |
Title | 膜穿孔蛋白E在上皮性卵巢癌组织中的表达水平及其临床意义 |
URI | https://d.wanfangdata.com.cn/periodical/bqeykdxxb202302020 |
Volume | 49 |
hasFullText | 1 |
inHoldings | 1 |
isFullTextHit | |
isPrint | |
link | http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/link/0/eLvHCXMwpR1NT9RAtEG4eDEaNX6HROdEFrftdDpznO52Q0zUCyTcSLs71cQEo0CCnDygRtRw8QJy0Yt4wJiIChLxz2zZ_Rm-N53dTsIeVg2bZuj7_tj2ve7M1HFucChaVRV3bs2qSYWKKq2krUxUEq4CqC6U39Rvibh9h03N0FuzwezIWGrNWlpaTCebKwPXlfxLVOEcxBVXyf5FZPtM4QSMIb5whAjDcagYk5gTzoiokTgkUpCoQeKAyDoRFEEiIjxCkABQPUYYoEpOYkoioJQaJokEEMMpDzJEHF4nUYCDCJh6hp5rGRFwpL1BaPiAvIIP11Klq0VwEsX4Ac5RlURUMwQ9fC2ioaXDAE4yw8fgSA1iyA3QEATShV1Ea0OqcBLRREyEVltSoz_oI5k1YMhQgkUNEtUI51puDU0ocULkhqACp_90hMRCW881Sg1d2hsMQKEYgcIw8Gl5i0cUGRFRcAFfBSWEISUGjmldfO05GAj7eYzn44Q0s74dv0HDuaCwXAcMkW2naJ0xutrjUY8cYo8B87R3gIr1OPcYigAJMd2qOsu0pUDo1Y6rNKHFBMY6sF4GE_i7pgd3z2A4C0BODT_oWqmTsB87ywLANNkoNXmIR-H-m1LAG1OyyF8xSCmObpKNQd60QJhQ3v_4rq-KgYGaqKdVRrDQrQQ8nLXrjGJrXnM99ayigRYblpn6kxYbMB8rbXDFfFHb9JhPYvrhSvmyluvPsE0fqScPWsvLaYEDfyecMS8McSrLmIzqUcNqskJ8r4T1kAi3hLKaLpwtYv2W7-G_dtPE8S0SZZPEoIjg1l7DAjfgqvarCJ_h7shl0xG4fgh1Bi2fjHPcxFFPU-lZapZeogtuDnKAXnE5nyXz96zmYPq0c8p09eOyuESfcUZW7p917nafb3U-_c533nbfveps_Irzre323lpn8_PR04_5m2_5jw-djdedg9XOwYv23k5nc7X7frt7eHj0ZTff_5qvr-XPvrf3dvOfa0er6-39l-ecmUY8XZuqmPfXVBbQhxWo9Fth4qdBkrhJE8rOzHc9RQVvQlEJfZ_HFDSDLstCxZquaik3DJs0UAFVLSCi_nlndP7hvLrgjLf8hKpQec2WakFp64mMZUGSAZHr85T5F53rxgFz5v60MHc8BS4NhXXZOVle1644o4uPl9RV6LwW02smdf4ApSIT8A |
linkProvider | EBSCOhost |
openUrl | ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info%3Aofi%2Fenc%3AUTF-8&rfr_id=info%3Asid%2Fsummon.serialssolutions.com&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=%E8%86%9C%E7%A9%BF%E5%AD%94%E8%9B%8B%E7%99%BDE%E5%9C%A8%E4%B8%8A%E7%9A%AE%E6%80%A7%E5%8D%B5%E5%B7%A2%E7%99%8C%E7%BB%84%E7%BB%87%E4%B8%AD%E7%9A%84%E8%A1%A8%E8%BE%BE%E6%B0%B4%E5%B9%B3%E5%8F%8A%E5%85%B6%E4%B8%B4%E5%BA%8A%E6%84%8F%E4%B9%89&rft.jtitle=%E5%90%89%E6%9E%97%E5%A4%A7%E5%AD%A6%E5%AD%A6%E6%8A%A5%EF%BC%88%E5%8C%BB%E5%AD%A6%E7%89%88%EF%BC%89&rft.au=%E9%99%88%E7%8C%9B%E7%8C%9B&rft.au=%E9%99%88%E4%BF%8A%E5%AE%87&rft.au=%E9%AB%98%E7%87%95&rft.au=%E6%88%BF%E6%AD%A3%E8%BD%A9&rft.date=2023-03-28&rft.pub=%E5%90%89%E6%9E%97%E5%A4%A7%E5%AD%A6%E6%8A%A4%E7%90%86%E5%AD%A6%E9%99%A2%E5%BA%B7%E5%A4%8D%E6%B2%BB%E7%96%97%E5%AD%A6%E6%95%99%E7%A0%94%E5%AE%A4%2C%E5%90%89%E6%9E%97+%E9%95%BF%E6%98%A5+130021%25%E5%90%89%E6%9E%97%E5%A4%A7%E5%AD%A6%E7%AC%AC%E4%BA%8C%E5%8C%BB%E9%99%A2%E5%A6%87%E4%BA%A7%E7%A7%91%2C%E5%90%89%E6%9E%97+%E9%95%BF%E6%98%A5+130021%25%E5%BB%B6%E8%BE%B9%E5%A4%A7%E5%AD%A6%E8%8D%AF%E5%AD%A6%E9%99%A2%E8%8D%AF%E5%89%82%E5%AD%A6%E6%95%99%E7%A0%94%E5%AE%A4%2C%E5%90%89%E6%9E%97+%E5%BB%B6%E5%90%89+133002&rft.issn=1671-587X&rft.volume=49&rft.issue=2&rft.spage=440&rft.epage=451&rft_id=info:doi/10.13481%2Fj.1671-587X.20230220&rft.externalDocID=bqeykdxxb202302020 |
thumbnail_s | http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/image/custom?url=http%3A%2F%2Fwww.wanfangdata.com.cn%2Fimages%2FPeriodicalImages%2Fbqeykdxxb%2Fbqeykdxxb.jpg |