膜穿孔蛋白E在上皮性卵巢癌组织中的表达水平及其临床意义

R737.31; 目的:探讨膜穿孔蛋白E(GSDME)在上皮性卵巢癌(EOC)组织中的表达水平,阐明GSDME对EOC发生发展的影响.方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,利用R语言分析正常组织和EOC组织中GSDME mRNA表达水平及其表达水平与EOC发生的关系.利用差异性分析、基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、基因集富集分析(GSEA)、蛋白-蛋白互作(PPI)网络、HUB基因互作网络和免疫浸润分析探讨与GSDME相关联的基因、信号通路及其对EOC发生发展的影响.收集40例EOC患者组织病理切片,按病理分级分为低...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in吉林大学学报(医学版) Vol. 49; no. 2; pp. 440 - 451
Main Authors 陈猛猛, 陈俊宇, 高燕, 房正轩, 赵淑华, 郑晶莹, 刘淑香
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 吉林大学护理学院康复治疗学教研室,吉林 长春 130021%吉林大学第二医院妇产科,吉林 长春 130021%延边大学药学院药剂学教研室,吉林 延吉 133002 28.03.2023
Subjects
Online AccessGet full text
ISSN1671-587X
DOI10.13481/j.1671-587X.20230220

Cover

Abstract R737.31; 目的:探讨膜穿孔蛋白E(GSDME)在上皮性卵巢癌(EOC)组织中的表达水平,阐明GSDME对EOC发生发展的影响.方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,利用R语言分析正常组织和EOC组织中GSDME mRNA表达水平及其表达水平与EOC发生的关系.利用差异性分析、基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、基因集富集分析(GSEA)、蛋白-蛋白互作(PPI)网络、HUB基因互作网络和免疫浸润分析探讨与GSDME相关联的基因、信号通路及其对EOC发生发展的影响.收集40例EOC患者组织病理切片,按病理分级分为低级别(中分化及高分化,24例)组和高级别(低分化,16例)组,按照对顺铂(DDP)的敏感程度分为DDP耐药组和DDP敏感组.另收集正常卵巢、良性卵巢瘤和交界性卵巢癌组织切片各5例作为对照,利用免疫组织化学(IHC)法检测所有组织切片中GSDME的表达强度.取10对新鲜的卵巢癌组织和癌旁组织,采用Western blotting法检测2组样本中GSDME蛋白表达水平.体外培养Skov3和Skov3/DDP细胞,采用Western blotting法检测细胞中GSDME蛋白表达水平,分析其与卵巢癌耐药的关系.结果:TCGA和GTEx数据库中非配对样本分析,与正常卵巢组织比较,EOC组织中GSDME mRNA表达水平明显降低(P<0.05),且高级别组EOC组织中GSDME mRNA表达水平低于低级别组(P<0.05).GSDME单基因差异分析,上调基因有460个,下调基因有329个[Log2差异倍数(FC)的绝对值大于1,即|Log2FC|>1,P<0.05].功能富集及免疫浸润分析,GSDME高表达可以上调循环免疫球蛋白介导的体液免疫反应通路、白细胞迁移通路和免疫球蛋白复合体通路的活性,促进肿瘤微环境中免疫细胞的浸润.IHC染色,GSDME与EOC的病理组织分级及耐药有关,其中DDP敏感组EOC组织中GSDME表达强度明显高于DDP耐药组(P<0.05).Western blotting法检测,与癌旁组织比较,EOC组织中GSDME蛋白表达水平明显降低(P<0.05);与Skov3细胞比较,Skov3/DDP细胞中GSDME蛋白表达水平明显降低(P<0.05).结论:GSDME与EOC的恶性程度和耐药表现有密切关联.GSDME
AbstractList R737.31; 目的:探讨膜穿孔蛋白E(GSDME)在上皮性卵巢癌(EOC)组织中的表达水平,阐明GSDME对EOC发生发展的影响.方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,利用R语言分析正常组织和EOC组织中GSDME mRNA表达水平及其表达水平与EOC发生的关系.利用差异性分析、基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、基因集富集分析(GSEA)、蛋白-蛋白互作(PPI)网络、HUB基因互作网络和免疫浸润分析探讨与GSDME相关联的基因、信号通路及其对EOC发生发展的影响.收集40例EOC患者组织病理切片,按病理分级分为低级别(中分化及高分化,24例)组和高级别(低分化,16例)组,按照对顺铂(DDP)的敏感程度分为DDP耐药组和DDP敏感组.另收集正常卵巢、良性卵巢瘤和交界性卵巢癌组织切片各5例作为对照,利用免疫组织化学(IHC)法检测所有组织切片中GSDME的表达强度.取10对新鲜的卵巢癌组织和癌旁组织,采用Western blotting法检测2组样本中GSDME蛋白表达水平.体外培养Skov3和Skov3/DDP细胞,采用Western blotting法检测细胞中GSDME蛋白表达水平,分析其与卵巢癌耐药的关系.结果:TCGA和GTEx数据库中非配对样本分析,与正常卵巢组织比较,EOC组织中GSDME mRNA表达水平明显降低(P<0.05),且高级别组EOC组织中GSDME mRNA表达水平低于低级别组(P<0.05).GSDME单基因差异分析,上调基因有460个,下调基因有329个[Log2差异倍数(FC)的绝对值大于1,即|Log2FC|>1,P<0.05].功能富集及免疫浸润分析,GSDME高表达可以上调循环免疫球蛋白介导的体液免疫反应通路、白细胞迁移通路和免疫球蛋白复合体通路的活性,促进肿瘤微环境中免疫细胞的浸润.IHC染色,GSDME与EOC的病理组织分级及耐药有关,其中DDP敏感组EOC组织中GSDME表达强度明显高于DDP耐药组(P<0.05).Western blotting法检测,与癌旁组织比较,EOC组织中GSDME蛋白表达水平明显降低(P<0.05);与Skov3细胞比较,Skov3/DDP细胞中GSDME蛋白表达水平明显降低(P<0.05).结论:GSDME与EOC的恶性程度和耐药表现有密切关联.GSDME
Author 赵淑华
刘淑香
郑晶莹
陈猛猛
陈俊宇
房正轩
高燕
AuthorAffiliation 吉林大学护理学院康复治疗学教研室,吉林 长春 130021%吉林大学第二医院妇产科,吉林 长春 130021%延边大学药学院药剂学教研室,吉林 延吉 133002
AuthorAffiliation_xml – name: 吉林大学护理学院康复治疗学教研室,吉林 长春 130021%吉林大学第二医院妇产科,吉林 长春 130021%延边大学药学院药剂学教研室,吉林 延吉 133002
Author_FL LIU Shuxiang
CHEN Mengmeng
FANG Zhengxuan
GAO Yan
ZHENG Jingying
ZHAO Shuhua
CHEN Junyu
Author_FL_xml – sequence: 1
  fullname: CHEN Mengmeng
– sequence: 2
  fullname: CHEN Junyu
– sequence: 3
  fullname: GAO Yan
– sequence: 4
  fullname: FANG Zhengxuan
– sequence: 5
  fullname: ZHAO Shuhua
– sequence: 6
  fullname: ZHENG Jingying
– sequence: 7
  fullname: LIU Shuxiang
Author_xml – sequence: 1
  fullname: 陈猛猛
– sequence: 2
  fullname: 陈俊宇
– sequence: 3
  fullname: 高燕
– sequence: 4
  fullname: 房正轩
– sequence: 5
  fullname: 赵淑华
– sequence: 6
  fullname: 郑晶莹
– sequence: 7
  fullname: 刘淑香
BookMark eNrjYmDJy89LZWCQNTTQMzQ2sTDUz9IzNDM31DW1MI_QMzIwMjYwMjJgYeCEC3Iw8BYXZyYZGBgZGFuaGxlzMvi_aJvzfOX-p2unvJjd_XzmXtenc1Y82dH1fNa6Zw3Ln_Zufbp90fOZPc93tzzf3f5kx9rns1peLFzxYt--Zxu2PN25-Wl_19PWbU92bHm6q-tZS_-TnZ08DKxpiTnFqbxQmpsh1M01xNlD18ff3dPZ0Ue32NDA1EDXyNIyxTzROMk0MdEwMdnC3CzN2NAo1cTSIjkxJcXCxMzILNXS3MzQLM081SzZMDUl1dDcPNnENNXUJDUFqMnEmJtBC2JueWJeWmJeenxWfmlRHtDG-KTC1MrslIqKJEgAgLwKALwhcOY
ClassificationCodes R737.31
ContentType Journal Article
Copyright Copyright © Wanfang Data Co. Ltd. All Rights Reserved.
Copyright_xml – notice: Copyright © Wanfang Data Co. Ltd. All Rights Reserved.
DBID 2B.
4A8
92I
93N
PSX
TCJ
DOI 10.13481/j.1671-587X.20230220
DatabaseName Wanfang Data Journals - Hong Kong
WANFANG Data Centre
Wanfang Data Journals
万方数据期刊 - 香港版
China Online Journals (COJ)
China Online Journals (COJ)
DatabaseTitleList
DeliveryMethod fulltext_linktorsrc
DocumentTitle_FL Expression level of gasdermin E in epithelial ovarian cancer tissue and its clinical significance
EndPage 451
ExternalDocumentID bqeykdxxb202302020
GrantInformation_xml – fundername: 吉林省科技厅自然科学基金项目
  funderid: (20200201589JC)
GroupedDBID -05
2B.
4A8
92I
93N
ALMA_UNASSIGNED_HOLDINGS
CCEZO
CIEJG
PSX
TCJ
ID FETCH-LOGICAL-s1050-299d7a3b5aa1ac876f312e498cadd84626e97616f7e6c1ede177c45e54edb5a43
ISSN 1671-587X
IngestDate Thu May 29 04:07:10 EDT 2025
IsPeerReviewed false
IsScholarly true
Issue 2
Keywords 基因表达
上皮性卵巢肿瘤
生物信息学
膜穿孔蛋白E
Language Chinese
LinkModel OpenURL
MergedId FETCHMERGED-LOGICAL-s1050-299d7a3b5aa1ac876f312e498cadd84626e97616f7e6c1ede177c45e54edb5a43
PageCount 12
ParticipantIDs wanfang_journals_bqeykdxxb202302020
PublicationCentury 2000
PublicationDate 2023-03-28
PublicationDateYYYYMMDD 2023-03-28
PublicationDate_xml – month: 03
  year: 2023
  text: 2023-03-28
  day: 28
PublicationDecade 2020
PublicationTitle 吉林大学学报(医学版)
PublicationTitle_FL Journal of Jilin University(Medicine Edition)
PublicationYear 2023
Publisher 吉林大学护理学院康复治疗学教研室,吉林 长春 130021%吉林大学第二医院妇产科,吉林 长春 130021%延边大学药学院药剂学教研室,吉林 延吉 133002
Publisher_xml – name: 吉林大学护理学院康复治疗学教研室,吉林 长春 130021%吉林大学第二医院妇产科,吉林 长春 130021%延边大学药学院药剂学教研室,吉林 延吉 133002
SSID ssib002039723
ssib051370734
ssib001103979
ssib002806622
ssib001050969
ssj0001844652
ssib009969601
ssib006703839
ssib000970483
ssib036438310
Score 2.3209193
Snippet R737.31; 目的:探讨膜穿孔蛋白E(GSDME)在上皮性卵巢癌(EOC)组织中的表达水平,阐明GSDME对EOC发生发展的影响.方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,利用R语言分析正常组织和EOC组织中GSDME...
SourceID wanfang
SourceType Aggregation Database
StartPage 440
Title 膜穿孔蛋白E在上皮性卵巢癌组织中的表达水平及其临床意义
URI https://d.wanfangdata.com.cn/periodical/bqeykdxxb202302020
Volume 49
hasFullText 1
inHoldings 1
isFullTextHit
isPrint
link http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/link/0/eLvHCXMwpR1NT9RAtEG4eDEaNX6HROdEFrftdDpznO52Q0zUCyTcSLs71cQEo0CCnDygRtRw8QJy0Yt4wJiIChLxz2zZ_Rm-N53dTsIeVg2bZuj7_tj2ve7M1HFucChaVRV3bs2qSYWKKq2krUxUEq4CqC6U39Rvibh9h03N0FuzwezIWGrNWlpaTCebKwPXlfxLVOEcxBVXyf5FZPtM4QSMIb5whAjDcagYk5gTzoiokTgkUpCoQeKAyDoRFEEiIjxCkABQPUYYoEpOYkoioJQaJokEEMMpDzJEHF4nUYCDCJh6hp5rGRFwpL1BaPiAvIIP11Klq0VwEsX4Ac5RlURUMwQ9fC2ioaXDAE4yw8fgSA1iyA3QEATShV1Ea0OqcBLRREyEVltSoz_oI5k1YMhQgkUNEtUI51puDU0ocULkhqACp_90hMRCW881Sg1d2hsMQKEYgcIw8Gl5i0cUGRFRcAFfBSWEISUGjmldfO05GAj7eYzn44Q0s74dv0HDuaCwXAcMkW2naJ0xutrjUY8cYo8B87R3gIr1OPcYigAJMd2qOsu0pUDo1Y6rNKHFBMY6sF4GE_i7pgd3z2A4C0BODT_oWqmTsB87ywLANNkoNXmIR-H-m1LAG1OyyF8xSCmObpKNQd60QJhQ3v_4rq-KgYGaqKdVRrDQrQQ8nLXrjGJrXnM99ayigRYblpn6kxYbMB8rbXDFfFHb9JhPYvrhSvmyluvPsE0fqScPWsvLaYEDfyecMS8McSrLmIzqUcNqskJ8r4T1kAi3hLKaLpwtYv2W7-G_dtPE8S0SZZPEoIjg1l7DAjfgqvarCJ_h7shl0xG4fgh1Bi2fjHPcxFFPU-lZapZeogtuDnKAXnE5nyXz96zmYPq0c8p09eOyuESfcUZW7p917nafb3U-_c533nbfveps_Irzre323lpn8_PR04_5m2_5jw-djdedg9XOwYv23k5nc7X7frt7eHj0ZTff_5qvr-XPvrf3dvOfa0er6-39l-ecmUY8XZuqmPfXVBbQhxWo9Fth4qdBkrhJE8rOzHc9RQVvQlEJfZ_HFDSDLstCxZquaik3DJs0UAFVLSCi_nlndP7hvLrgjLf8hKpQec2WakFp64mMZUGSAZHr85T5F53rxgFz5v60MHc8BS4NhXXZOVle1644o4uPl9RV6LwW02smdf4ApSIT8A
linkProvider EBSCOhost
openUrl ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info%3Aofi%2Fenc%3AUTF-8&rfr_id=info%3Asid%2Fsummon.serialssolutions.com&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=%E8%86%9C%E7%A9%BF%E5%AD%94%E8%9B%8B%E7%99%BDE%E5%9C%A8%E4%B8%8A%E7%9A%AE%E6%80%A7%E5%8D%B5%E5%B7%A2%E7%99%8C%E7%BB%84%E7%BB%87%E4%B8%AD%E7%9A%84%E8%A1%A8%E8%BE%BE%E6%B0%B4%E5%B9%B3%E5%8F%8A%E5%85%B6%E4%B8%B4%E5%BA%8A%E6%84%8F%E4%B9%89&rft.jtitle=%E5%90%89%E6%9E%97%E5%A4%A7%E5%AD%A6%E5%AD%A6%E6%8A%A5%EF%BC%88%E5%8C%BB%E5%AD%A6%E7%89%88%EF%BC%89&rft.au=%E9%99%88%E7%8C%9B%E7%8C%9B&rft.au=%E9%99%88%E4%BF%8A%E5%AE%87&rft.au=%E9%AB%98%E7%87%95&rft.au=%E6%88%BF%E6%AD%A3%E8%BD%A9&rft.date=2023-03-28&rft.pub=%E5%90%89%E6%9E%97%E5%A4%A7%E5%AD%A6%E6%8A%A4%E7%90%86%E5%AD%A6%E9%99%A2%E5%BA%B7%E5%A4%8D%E6%B2%BB%E7%96%97%E5%AD%A6%E6%95%99%E7%A0%94%E5%AE%A4%2C%E5%90%89%E6%9E%97+%E9%95%BF%E6%98%A5+130021%25%E5%90%89%E6%9E%97%E5%A4%A7%E5%AD%A6%E7%AC%AC%E4%BA%8C%E5%8C%BB%E9%99%A2%E5%A6%87%E4%BA%A7%E7%A7%91%2C%E5%90%89%E6%9E%97+%E9%95%BF%E6%98%A5+130021%25%E5%BB%B6%E8%BE%B9%E5%A4%A7%E5%AD%A6%E8%8D%AF%E5%AD%A6%E9%99%A2%E8%8D%AF%E5%89%82%E5%AD%A6%E6%95%99%E7%A0%94%E5%AE%A4%2C%E5%90%89%E6%9E%97+%E5%BB%B6%E5%90%89+133002&rft.issn=1671-587X&rft.volume=49&rft.issue=2&rft.spage=440&rft.epage=451&rft_id=info:doi/10.13481%2Fj.1671-587X.20230220&rft.externalDocID=bqeykdxxb202302020
thumbnail_s http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/image/custom?url=http%3A%2F%2Fwww.wanfangdata.com.cn%2Fimages%2FPeriodicalImages%2Fbqeykdxxb%2Fbqeykdxxb.jpg