基于重测序鉴定耐盐转基因大豆事件外源T-DNA整合位点及特异性检测

• Published in: 南京农业大学学报 Vol. 46; no. 4; pp. 710 - 717
• Main Authors: 魏嘉, 王秀东, 卜显峰, 马瑞, 于志晶, 蔡勤安
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 吉林省农业科学院农业生物技术研究所/吉林省农业生物技术重点实验室,吉林 长春 130033%吉林省万发农业站,吉林 四平 136500%吉林省农业技术推广总站,吉林 长春 130033 01.07.2023
• Subjects: 重测序; 转基因大豆; transgenic soybean; BADH基因; BADH gene; T-DNA flanking sequence; T-DNA侧翼序列; re-sequencing
• ISSN: 1000-2030
• DOI: 10.7685/jnau.202207008

S565.1; [目的]转基因大豆事件L8014 是本研究前期利用农杆菌介导的大豆子叶节高效遗传转化技术体系,将来源于山菠菜的基因BADH导入大豆(Glycine max)'Williams 82'而获得具有良好耐盐(1.5%NaCl)性状的转基因大豆(该材料已经完成环境释放试验).T-DNA插入位点侧翼序列的获得与分析对于转基因事件的安全评价及应用非常重要,本文旨在明确该转基因大豆材料的分子特征及其检测方法,以进一步推进安全评价.[方法]利用Southern杂交检测转基因大豆外源基因的拷贝数;基于基因组重测序技术,采用 BWA(Burrows-Wheeler-Alignment)方法将重测序数据与 T-DNA 序列以及大豆基因组序列进行比对分析.[结果]T-DNA在大豆基因组 10 号染色体上的基因组区间 3925017-3926022 位点,插入方式为反向插入;结合PCR扩增技术获得外源T-DNA整合位点的左、右边界侧翼序列,基于该序列建立了转BADH基因大豆事件L8014 的特异性PCR检测方法.[结论]本研究获得了转基因事件的整合位点及侧翼序列,方法快速、结果可靠,为转基因大豆及其衍生产品的检测提供了技术支撑.