桔梗根系响应元宝枫凋落叶的转录组分析

Q946%S567.239%S792.35; [目的]探究北京地区元宝枫凋落叶对桔梗药用活性成分积累的影响,通过转录组测序揭示桔梗根部活性成分合成的分子机制.[方法]利用Illumina对桔梗根部进行转录组测序,分析萜类、类黄酮和苯丙烷类次生代谢产物合成通路中的基因表达变化.[结果]共检测到15 727个SSR位点.发现753个DEGs注释到GO数据库的三大分类中,314个DEGs注释到KEGG数据库的105个代谢通路中.与对照组相比,分别有17,7,26个DEGs参与萜类、类黄酮和苯丙烷类化合物的生物合成.[结论]萜类和苯丙烷合成途径的DEGs主要上调表达,类黄酮合成途径的DEGs普遍下调表...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in西北植物学报 Vol. 44; no. 12; pp. 1900 - 1914
Main Authors 冯超群, 阮坤非, 师劭彤, 李森, 程少颖, 刘忠华
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 林木育种与生态修复国家工程研究中心,北京 100083 2024
北京林业大学生物科学与技术学院,北京 100083
Subjects
differentially expressed genes(DEG)
secondary metabolites
transcriptome
合成调控
Acer truncatum
差异表达基因(DEG)
元宝枫
转录组
桔梗
次生代谢产物
synthetic regulation
Platycodon grandiflorum
Online AccessGet full text
ISSN1000-4025
DOI10.7606/j.issn.1000-4025.20240342

Cover

More Information
Summary:Q946%S567.239%S792.35; [目的]探究北京地区元宝枫凋落叶对桔梗药用活性成分积累的影响,通过转录组测序揭示桔梗根部活性成分合成的分子机制.[方法]利用Illumina对桔梗根部进行转录组测序,分析萜类、类黄酮和苯丙烷类次生代谢产物合成通路中的基因表达变化.[结果]共检测到15 727个SSR位点.发现753个DEGs注释到GO数据库的三大分类中,314个DEGs注释到KEGG数据库的105个代谢通路中.与对照组相比,分别有17,7,26个DEGs参与萜类、类黄酮和苯丙烷类化合物的生物合成.[结论]萜类和苯丙烷合成途径的DEGs主要上调表达,类黄酮合成途径的DEGs普遍下调表达.推测萜类和苯丙烷类物质合成上升,类黄酮合成下降.获得了桔梗根部的全部转录组信息,并初步预测了桔梗萜类、类黄酮以及苯丙烷类合成可能的调控通路.
ISSN:1000-4025
DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.20240342