基于高通量测序的山羊卵巢基质、卵泡转录组分析

S827; [目的]比较山羊Capra hircus卵巢基质、大卵泡和小卵泡间的mRNA表达图谱,为探究卵泡发育机制提供一定的研究基础.[方法]采用高通量测序技术对发情期川中黑山羊的卵巢基质、大卵泡和小卵泡进行转录组测序,利用生物信息学方法检测mRNA表达谱,筛选差异基因,对其进行GO和KEGG通路分析,最后随机抽取5个差异基因进行荧光定量PCR验证.[结果]卵巢基质vs大卵泡、卵巢基质vs小卵泡和小卵泡Vs大卵泡的差异表达基因分别为524、180和403个.筛选出INHA、TNFRSF19等15个与卵泡发育相关的基因,其主要富集在内质网蛋白质加工、类固醇生物合成、卵母细胞减数分裂等信号通路....

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Published in华南农业大学学报 Vol. 41; no. 2; pp. 23 - 32
Main Authors 陆婷婷, 邹娴, 杨镇玮, 雷放, 陈奕业, 柳广斌, 孙宝丽, 刘德武, 李耀坤
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 广东省农业科学院动物科学研究所/畜禽育种国家重点实验室/广东省畜禽育种与营养研究重点实验室,广东广州510640 01.03.2020
华南农业大学动物科学学院,广东广州,510642%华南农业大学动物科学学院,广东广州510642
Subjects
卵巢基质
高通量测序
山羊
转录组
卵泡
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ISSN1001-411X
DOI10.7671/j.issn.1001-411X.201905006

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Abstract S827; [目的]比较山羊Capra hircus卵巢基质、大卵泡和小卵泡间的mRNA表达图谱,为探究卵泡发育机制提供一定的研究基础.[方法]采用高通量测序技术对发情期川中黑山羊的卵巢基质、大卵泡和小卵泡进行转录组测序,利用生物信息学方法检测mRNA表达谱,筛选差异基因,对其进行GO和KEGG通路分析,最后随机抽取5个差异基因进行荧光定量PCR验证.[结果]卵巢基质vs大卵泡、卵巢基质vs小卵泡和小卵泡Vs大卵泡的差异表达基因分别为524、180和403个.筛选出INHA、TNFRSF19等15个与卵泡发育相关的基因,其主要富集在内质网蛋白质加工、类固醇生物合成、卵母细胞减数分裂等信号通路.通过qRT-PCR验证,定量结果与测序结果基本一致.[结论]川中黑山羊卵巢基质、大卵泡和小卵泡的基因表达模式不同,小卵泡与卵巢基质的基因表达模式更相近.
AbstractList S827; [目的]比较山羊Capra hircus卵巢基质、大卵泡和小卵泡间的mRNA表达图谱,为探究卵泡发育机制提供一定的研究基础.[方法]采用高通量测序技术对发情期川中黑山羊的卵巢基质、大卵泡和小卵泡进行转录组测序,利用生物信息学方法检测mRNA表达谱,筛选差异基因,对其进行GO和KEGG通路分析,最后随机抽取5个差异基因进行荧光定量PCR验证.[结果]卵巢基质vs大卵泡、卵巢基质vs小卵泡和小卵泡Vs大卵泡的差异表达基因分别为524、180和403个.筛选出INHA、TNFRSF19等15个与卵泡发育相关的基因,其主要富集在内质网蛋白质加工、类固醇生物合成、卵母细胞减数分裂等信号通路.通过qRT-PCR验证,定量结果与测序结果基本一致.[结论]川中黑山羊卵巢基质、大卵泡和小卵泡的基因表达模式不同,小卵泡与卵巢基质的基因表达模式更相近.
Author 李耀坤
陈奕业
柳广斌
雷放
刘德武
陆婷婷
杨镇玮
邹娴
孙宝丽
AuthorAffiliation 华南农业大学动物科学学院,广东广州,510642%华南农业大学动物科学学院,广东广州510642;广东省农业科学院动物科学研究所/畜禽育种国家重点实验室/广东省畜禽育种与营养研究重点实验室,广东广州510640
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Author_FL ZOU Xian
YANG Zhenwei
LIU Guangbin
LIU Dewu
LI Yaokun
LEI Fang
CHEN Yiye
SUN Baoli
LU Tingting
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Title 基于高通量测序的山羊卵巢基质、卵泡转录组分析
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