西葫芦NCED基因家族鉴定及其响应干旱胁迫分析

• Published in: 西北植物学报 Vol. 43; no. 4; pp. 569 - 581
• Main Authors: 刘建汀, 叶新如, 张前荣, 李永平, 温庆放, 朱海生
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 福建省蔬菜遗传育种重点实验室,福州350013 2023; 福建省蔬菜工程技术研究中心,福州350013; 福建省农业科学院作物研究所,福州350013
• Subjects: NCED基因家族; 干旱胁迫; 生物信息学分析; 西葫芦; 表达分析
• ISSN: 1000-4025
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2023.04.0569

Q781%Q786%S642.6; NCED基因家族成员在调节植物响应干旱胁迫中发挥着关键作用,该研究通过生物信息学技术分析NCED在西葫芦基因组中的分布、结构及进化,研究家族成员在不同组织中的表达特异性及其对10％PEG 6000模拟干旱、0.1 mmol·L-1 ABA激素和自然干旱胁迫的响应,以解析NCED基因家族的生物学功能.结果表明:(1)从西葫芦全基因组中鉴定出6个NCED家族基因(CpNCED1～6),且6个基因均不含内含子、分别分布于西葫芦的1、10、12、14、19和20号共6条染色体上.(2)理化性质分析发现,CpNCED1～6蛋白长度为569～590 aa,理论分子量在62.64～65.54 kD之间.(3)蛋白保守元件分析显示,除CpNCED3蛋白在遗传进化过程中出现3个基序(motif 12、motif 13和motif 15)的缺失外,其余5个蛋白都有完整的16个motif保守基序,且分布在600个氨基酸以内,同时大部分NCED蛋白序列保守性较高.(4)顺式作用元件分析显示,西葫芦CpNCED1～6基因均含ABRE、W box、MBS、P-box、TCA-element、CGTCA-motif、TGA-element 和 TGA-box 等潜在的干旱胁迫响应元件.(5)qRT-PCR分析表明,CpNCED1～6基因在西葫芦不同组织中的表达具有组织特异性,其中,CpNCED4和CpNCED1在茎中的表达量显著高于其他4个基因,CpNCED2、CpNCED4、CpNCED6在花中的表达显著高于其余3个基因且CpNCED2表达量最高,CpNCED1～6在果实和叶中的表达量均相对较低;与对照组相比,CpNCED1～6受模拟干旱、ABA激素和自然干旱胁迫均上调表达;伴随干旱胁迫的产生,叶片中脱落酸(ABA)含量逐渐升高,暗示CpNCEDs在西葫芦干旱胁迫响应与ABA的生物合成过程中发挥着正向调控作用.研究发现,6个CpNCED1～6基因与西葫芦干旱胁迫响应密切相关,且对西葫芦干旱胁迫的响应以及ABA生物合成具有重要作用,尤其以CpNCED2和CpNCED4基因的作用更为明显.