毛竹PeDWF4基因克隆及表达模式分析

S718.46; [目的]通过对毛竹PeDWF4基因结构特点和表达特征的研究,揭示其在响应逆境胁迫过程中的作用.[方法]采用同源序列比对的方法,从毛竹基因组数据库中获得DWF4同源基因信息并克隆,通过生物信息学方法分析该基因的结构、理化特征,以及基因编码蛋白的保守结构域、进化关系等,应用RT-PCR技术分析基因在毛竹不同组织中的表达情况,使用实时荧光定量PCR技术分别分析高盐、干旱、低温和强光等胁迫条件下该基因在叶片中的表达模式.[结果]从毛竹中克隆获得1个DWF4同源基因PeDWF4,编码区长度为1 503 bp,对应的基因组序列为6 149 bp,包含8个外显子和7个内含子,内含子完全符合...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in林业科学研究 Vol. 31; no. 5; pp. 50 - 56
Main Authors 王思宁, 孙化雨, 李利超, 杨意宏, 徐浩, 赵韩生, 高志民
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 河北农业大学,河北,保定071001 01.10.2018
国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所,北京100102%国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所,北京100102
Subjects
Online AccessGet full text
ISSN1001-1498
DOI10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.05.007

Cover

Abstract S718.46; [目的]通过对毛竹PeDWF4基因结构特点和表达特征的研究,揭示其在响应逆境胁迫过程中的作用.[方法]采用同源序列比对的方法,从毛竹基因组数据库中获得DWF4同源基因信息并克隆,通过生物信息学方法分析该基因的结构、理化特征,以及基因编码蛋白的保守结构域、进化关系等,应用RT-PCR技术分析基因在毛竹不同组织中的表达情况,使用实时荧光定量PCR技术分别分析高盐、干旱、低温和强光等胁迫条件下该基因在叶片中的表达模式.[结果]从毛竹中克隆获得1个DWF4同源基因PeDWF4,编码区长度为1 503 bp,对应的基因组序列为6 149 bp,包含8个外显子和7个内含子,内含子完全符合GT-AG剪接原则.PeDWF4编码1个500 aa的碱性蛋白,属于细胞色素P450家族的单加氧酶.组织特异性表达分析表明,PeDWF4在毛竹不同组织中均检测到表达,其中,叶片中表达丰度最高,其次是根,茎、叶鞘和笋中的表达量较低.在NaCl(400 mmol·L-1)和干旱胁迫条件下,叶片中PeDWF4的表达均先受到诱导,后受到抑制,其中,NaC1处理下,表达量在2h时达到最高(为对照的3.5倍),6h时最低(为对照的20%);干旱处理下,表达量在1h时达到最高(为对照的2倍),8h时最低(为对照的60%).强光(1 200μmol·m-2 ·s-1)和低温(4℃)胁迫均诱导PeDWF4的表达,其中,强光处理2h时表达量达到最高(为对照的4.5倍),随后降低,8h时仍为对照的2倍;低温处理下,叶片中PeDWF4表达量在1h时达到最高(约为对照的3倍),随后持续下降,8h时仍为对照的2倍.[结论]从毛竹中克隆了BL生物合成关键限速酶基因PeDWF4,该基因在毛竹中呈现组成型表达,在叶片中的表达受到NaC1、干旱、低温和强光等非生物胁迫的影响,基因表达的变化表明PeDWF4可能有助于毛竹适应逆境胁迫.
AbstractList S718.46; [目的]通过对毛竹PeDWF4基因结构特点和表达特征的研究,揭示其在响应逆境胁迫过程中的作用.[方法]采用同源序列比对的方法,从毛竹基因组数据库中获得DWF4同源基因信息并克隆,通过生物信息学方法分析该基因的结构、理化特征,以及基因编码蛋白的保守结构域、进化关系等,应用RT-PCR技术分析基因在毛竹不同组织中的表达情况,使用实时荧光定量PCR技术分别分析高盐、干旱、低温和强光等胁迫条件下该基因在叶片中的表达模式.[结果]从毛竹中克隆获得1个DWF4同源基因PeDWF4,编码区长度为1 503 bp,对应的基因组序列为6 149 bp,包含8个外显子和7个内含子,内含子完全符合GT-AG剪接原则.PeDWF4编码1个500 aa的碱性蛋白,属于细胞色素P450家族的单加氧酶.组织特异性表达分析表明,PeDWF4在毛竹不同组织中均检测到表达,其中,叶片中表达丰度最高,其次是根,茎、叶鞘和笋中的表达量较低.在NaCl(400 mmol·L-1)和干旱胁迫条件下,叶片中PeDWF4的表达均先受到诱导,后受到抑制,其中,NaC1处理下,表达量在2h时达到最高(为对照的3.5倍),6h时最低(为对照的20%);干旱处理下,表达量在1h时达到最高(为对照的2倍),8h时最低(为对照的60%).强光(1 200μmol·m-2 ·s-1)和低温(4℃)胁迫均诱导PeDWF4的表达,其中,强光处理2h时表达量达到最高(为对照的4.5倍),随后降低,8h时仍为对照的2倍;低温处理下,叶片中PeDWF4表达量在1h时达到最高(约为对照的3倍),随后持续下降,8h时仍为对照的2倍.[结论]从毛竹中克隆了BL生物合成关键限速酶基因PeDWF4,该基因在毛竹中呈现组成型表达,在叶片中的表达受到NaC1、干旱、低温和强光等非生物胁迫的影响,基因表达的变化表明PeDWF4可能有助于毛竹适应逆境胁迫.
Author 王思宁
徐浩
高志民
李利超
杨意宏
孙化雨
赵韩生
AuthorAffiliation 国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所,北京100102%国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所,北京100102;河北农业大学,河北,保定071001
AuthorAffiliation_xml – name: 国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所,北京100102%国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所,北京100102;河北农业大学,河北,保定071001
Author_FL ZHAO Han-sheng
XU Hao
LI Li-chao
GAO Zhi-min
YANG Yi-hong
WANG Si-ning
SUN Hua-yu
Author_FL_xml – sequence: 1
  fullname: WANG Si-ning
– sequence: 2
  fullname: SUN Hua-yu
– sequence: 3
  fullname: LI Li-chao
– sequence: 4
  fullname: YANG Yi-hong
– sequence: 5
  fullname: XU Hao
– sequence: 6
  fullname: ZHAO Han-sheng
– sequence: 7
  fullname: GAO Zhi-min
Author_xml – sequence: 1
  fullname: 王思宁
– sequence: 2
  fullname: 孙化雨
– sequence: 3
  fullname: 李利超
– sequence: 4
  fullname: 杨意宏
– sequence: 5
  fullname: 徐浩
– sequence: 6
  fullname: 赵韩生
– sequence: 7
  fullname: 高志民
BookMark eNrjYmDJy89LZWBQMjTQMzQ2MjfVz9JLzsvO1MupzK6ozNIzMjC00DMw1TMwMGdh4DQ0MDDUNTSxtOBg4CouzjIwAGowMuRk0H22fvbz1TsDUl3C3Uyezt_1dPaCp63dL2e1Pe3verFwxYt9-56tWPh0T__TjrZn8ybwMLCmJeYUp_JCaW6GUDfXEGcPXR9_d09nRx_dYkOgwbqmaZYWBsmWqaYphoaWqalJJsaWqSmphhZJZpZGlhaG5mlpaZaWKanm5mYpqcnmxkbJpilGRkaJliZAtxokm1saczOoQ8wtT8xLS8xLj8_KLy3KA9oYD_EcyG8GpkDVxgDasFZh
ClassificationCodes S718.46
ContentType Journal Article
Copyright Copyright © Wanfang Data Co. Ltd. All Rights Reserved.
Copyright_xml – notice: Copyright © Wanfang Data Co. Ltd. All Rights Reserved.
DBID 2B.
4A8
92I
93N
PSX
TCJ
DOI 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.05.007
DatabaseName Wanfang Data Journals - Hong Kong
WANFANG Data Centre
Wanfang Data Journals
万方数据期刊 - 香港版
China Online Journals (COJ)
China Online Journals (COJ)
DatabaseTitleList
DeliveryMethod fulltext_linktorsrc
Discipline Forestry
DocumentTitle_FL Cloning and Expression Pattern Analysis of PeDWF4 Gene in Moso Bamboo (Phyllostachys edulis)
EndPage 56
ExternalDocumentID lykxyj201805007
GrantInformation_xml – fundername: 林业公益性行业科研专项经费项目“毛竹核心种质重测序及竹壁发育关键基因研究”; 国家科技支撑计划课题研究任务“竹藤资源收集保存与优质基因资源筛选”
  funderid: (201504106); (2015BAD04B0101)
GroupedDBID -04
2B.
4A8
5GY
5XA
5XE
7X2
92G
92I
93N
ABUWG
ACGFS
AEUYN
AFKRA
ALMA_UNASSIGNED_HOLDINGS
ATCPS
BENPR
BHPHI
BPHCQ
BVBZV
CCEZO
CCPQU
CHDYS
CW9
ECGQY
HCIFZ
M0K
PATMY
PHGZM
PHGZT
PMFND
PQQKQ
PROAC
PSX
PYCSY
TCJ
TGD
U1G
U5N
ID FETCH-LOGICAL-s1027-5f980c9e5d119eeb439ede18b6929817fff99de776dec732c5d222a940070c793
ISSN 1001-1498
IngestDate Thu May 29 03:59:41 EDT 2025
IsPeerReviewed false
IsScholarly true
Issue 5
Keywords DWF4
基因表达
毛竹
油菜素内酯
非生物胁迫
Language Chinese
LinkModel OpenURL
MergedId FETCHMERGED-LOGICAL-s1027-5f980c9e5d119eeb439ede18b6929817fff99de776dec732c5d222a940070c793
PageCount 7
ParticipantIDs wanfang_journals_lykxyj201805007
PublicationCentury 2000
PublicationDate 2018-10-01
PublicationDateYYYYMMDD 2018-10-01
PublicationDate_xml – month: 10
  year: 2018
  text: 2018-10-01
  day: 01
PublicationDecade 2010
PublicationTitle 林业科学研究
PublicationTitle_FL Forest Research
PublicationYear 2018
Publisher 河北农业大学,河北,保定071001
国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所,北京100102%国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所,北京100102
Publisher_xml – name: 河北农业大学,河北,保定071001
– name: 国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所,北京100102%国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所,北京100102
SSID ssj0027521
ssib051373067
ssib001101254
ssib002263439
Score 2.1770184
Snippet S718.46;...
SourceID wanfang
SourceType Aggregation Database
StartPage 50
Title 毛竹PeDWF4基因克隆及表达模式分析
URI https://d.wanfangdata.com.cn/periodical/lykxyj201805007
Volume 31
hasFullText 1
inHoldings 1
isFullTextHit
isPrint
link http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/link/0/eLvHCXMwnV3Na9VAEA-1BfEifuI37-AcU18-9uuYfS-hCJYiLfZWXpKNH5Un2FewvVtED_VsQe2t4MGzIv1v8qz_hTObvJdQK35ACMswOzuTSTKzy-xvHee2z_AfxwfcFQXOTUJjjCtl7rtBHqQqZ3lW2H3c9xb5wkp4d5WtzpxSraqlzVE6n22fuK_kf7yKNPQr7ZL9B89OhSIB2-hfvKOH8f5XPoaYQ5SA0hALiDRotWT6D5IQYgYqAR3ZhoaoSw2JF3IqUBFIbikJSOSREHkQSWromC4Sa4nIo3vERszS9uKgYqjO3pwktROigDgELUk-6SNAWQlRHyJuKV1QoW0o0NMVQSLI2KrGbd1F33ZCitewWClKWT16oLg1Aw2TDQunniioUhWHIHNQIjvGQoYiOazNooGS9tqHJ6dVdNXbSuzaBx1MRhe2gcJ6LYNRUkg2Tw32eyd09KsuSWOliiz0kdeKDlR_hlNK2Q4fgdf6TFgrFlSAunVWUaGn_xKvAl8wG7Cy4frj-adb6y-2nlC9obRwstV5wMfwwCsm4ukyi6Mw5wtBFQpzOl5cut_kwoTc1sbK83kQNhCwzAtEYKH7J6sTrNqkOLGxRuglDe_8Vj-71W1YDIYPW1nZ8jnnbD2d6kTVt3Hemdl-dME5TefN0iGGFx13_Hnv-6cv1WdRfvha7n0sX7758W6n3H19tH9wdHg4Ptgvv-2Wr3bG799eclaSeLm34NYnhLgbmBgLlxVKdjNlWO55ypgU7TO58WTKMeuXniiKQqncCMFzk4nAz1iO-fBAhYRylWFouuzMDp8NzRWnY7jKCO6QmyAMuZ8qnwueDgoWDPBhcHbV6dSWrtV_gI21Y6649meW686Z5j2-4cyOnm-am5jVjtJbtf9-AkWzdlU
linkProvider ProQuest
openUrl ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info%3Aofi%2Fenc%3AUTF-8&rfr_id=info%3Asid%2Fsummon.serialssolutions.com&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=%E6%AF%9B%E7%AB%B9PeDWF4%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E5%85%8B%E9%9A%86%E5%8F%8A%E8%A1%A8%E8%BE%BE%E6%A8%A1%E5%BC%8F%E5%88%86%E6%9E%90&rft.jtitle=%E6%9E%97%E4%B8%9A%E7%A7%91%E5%AD%A6%E7%A0%94%E7%A9%B6&rft.au=%E7%8E%8B%E6%80%9D%E5%AE%81&rft.au=%E5%AD%99%E5%8C%96%E9%9B%A8&rft.au=%E6%9D%8E%E5%88%A9%E8%B6%85&rft.au=%E6%9D%A8%E6%84%8F%E5%AE%8F&rft.date=2018-10-01&rft.pub=%E6%B2%B3%E5%8C%97%E5%86%9C%E4%B8%9A%E5%A4%A7%E5%AD%A6%2C%E6%B2%B3%E5%8C%97%2C%E4%BF%9D%E5%AE%9A071001&rft.issn=1001-1498&rft.volume=31&rft.issue=5&rft.spage=50&rft.epage=56&rft_id=info:doi/10.13275%2Fj.cnki.lykxyj.2018.05.007&rft.externalDocID=lykxyj201805007
thumbnail_s http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/image/custom?url=http%3A%2F%2Fwww.wanfangdata.com.cn%2Fimages%2FPeriodicalImages%2Flykxyj%2Flykxyj.jpg