七彩神仙鱼BTN1A1基因克隆及其在嗜水气单胞菌胁迫下的表达分析
S917.4; [目的]克隆七彩神仙鱼(Symphysodon aequifasciatus)嗜乳脂蛋白1A1(Butyrophilin 1A1,BTN1A1)基因,分析其在病原刺激下的表达模式,为了解七彩神仙鱼BTN1A1基因功能提供依据.[方法]利用生物信息学对七彩神仙鱼2个BTN1A1基因(BTN1A1-1和BTNA41-2)进行结构和进化分析.根据前期获得的七彩神仙鱼皮肤转录组数据,选取BTN1A1-1和BTN1A1-2基因的CDS区设计引物进行克隆.采用qRT-PCR分析BTN1A1在各组织中的表达及嗜水气单胞菌刺激下的表达模式.[结果]BTN1A1-1和BTN1A1-2的ORF序列...
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Published in | 广东农业科学 Vol. 51; no. 4; pp. 45 - 53 |
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Main Authors | , , , |
Format | Journal Article |
Language | Chinese |
Published |
上海海洋大学水产与生命学院/农业农村部淡水水产种质资源重点实验室/水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室/水产科学国家级实验教学示范中心,上海 201306
01.04.2024
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Subjects | |
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ISSN | 1004-874X |
DOI | 10.16768/j.issn.1004-874X.2024.04.004 |
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Summary: | S917.4; [目的]克隆七彩神仙鱼(Symphysodon aequifasciatus)嗜乳脂蛋白1A1(Butyrophilin 1A1,BTN1A1)基因,分析其在病原刺激下的表达模式,为了解七彩神仙鱼BTN1A1基因功能提供依据.[方法]利用生物信息学对七彩神仙鱼2个BTN1A1基因(BTN1A1-1和BTNA41-2)进行结构和进化分析.根据前期获得的七彩神仙鱼皮肤转录组数据,选取BTN1A1-1和BTN1A1-2基因的CDS区设计引物进行克隆.采用qRT-PCR分析BTN1A1在各组织中的表达及嗜水气单胞菌刺激下的表达模式.[结果]BTN1A1-1和BTN1A1-2的ORF序列长度为894、1 275 bp,分别编码298、424个氨基酸.BTN1A1-1和BTN1A1-2蛋白均具有1个信号肽、1个Ig结构域、1个lg_like结构域和1个跨膜结构域的经典结构,BTN1A1-2还具有1个胞质结构域.七彩神仙鱼BTN1A1-1与慈鲷科其他鱼类相似性较高,与尼加拉瓜湖始丽鱼(Archocentrus centrarchus)BTNIAI对应氨基酸序列同源性最高、为94.14%.但BTN1A1-2与其他鱼类发生分离,形成独特分支.BTN1A1-1和BTN1A1-2在七彩神仙鱼各组织中均有表达,但在鳃、肠道、皮肤等与免疫相关的组织中表达量相对较高.七彩神仙鱼BTN1A1-1在嗜水气单胞菌胁迫后表达量先显著下降后上升,而BTN1A1-2表达量则先显著上升后下降.[结论]七彩神仙鱼BTN1A1-1基因相对保守,而BTN1A1-2基因在进化上较为特殊.二者在免疫刺激下的差异表达暗示其可能在七彩神仙鱼免疫防御中发生功能分化. |
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ISSN: | 1004-874X |
DOI: | 10.16768/j.issn.1004-874X.2024.04.004 |