大豆巢式关联作图(NAM)群体构建及花色和种皮色遗传分析
巢式关联作图(Nested Association Mapping,NAM)群体在作物学遗传与育种研究中具有广泛的应用.本研究在前期大豆种质资源评价基础上,利用 35份不同地区来源的代表性种质与中豆 41(公共母本)杂交,构建了一套大豆NAM群体.PCA和聚类分析发现,不同亲本组合的RIL群体基本聚在一起,显示出清晰的遗传结构.利用该NAM群体亲本间花色和种皮色具有显著差异的RIL群体进行全基因组关联分析,定位到 1 个主要位点qFC13-1 与花色显著关联,该位点与W1 位点重合;定位到 12 个位点与种皮色显著相关,其中 9 个位点为 3 种以上方法共定位,3 个位点为 2 种方法共定位,...
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| Published in | 作物学报 Vol. 50; no. 3; pp. 556 - 575 |
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| Main Authors | , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , |
| Format | Journal Article |
| Language | Chinese |
| Published |
长江大学,湖北荆州 434025
12.03.2024
农业农村部长江中游作物绿色高效生产重点实验室(部省共建)/长江大学农学院,湖北荆州 434025%中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与遗传改良国家重大科学工程/农业农村部北京大豆生物学重点实验室,北京 100081%长江大学,湖北荆州 434025%安徽农业大学农学院,安徽合肥 230036%江西省农业科学院作物研究所,江西南昌 330200%呼伦贝尔市农业科学研究所,内蒙古呼伦贝尔 162650%河北省农林科学院粮油作物研究所,河北石家庄 050035%江苏徐怀地区徐州农业科学研究所,江苏徐州 210031%宁夏农林科学院作物研究所,宁夏银川 750021 |
| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 0496-3490 |
| DOI | 10.3724/SP.J.1006.2024.34094 |
Cover
| Abstract | 巢式关联作图(Nested Association Mapping,NAM)群体在作物学遗传与育种研究中具有广泛的应用.本研究在前期大豆种质资源评价基础上,利用 35份不同地区来源的代表性种质与中豆 41(公共母本)杂交,构建了一套大豆NAM群体.PCA和聚类分析发现,不同亲本组合的RIL群体基本聚在一起,显示出清晰的遗传结构.利用该NAM群体亲本间花色和种皮色具有显著差异的RIL群体进行全基因组关联分析,定位到 1 个主要位点qFC13-1 与花色显著关联,该位点与W1 位点重合;定位到 12 个位点与种皮色显著相关,其中 9 个位点为 3 种以上方法共定位,3 个位点为 2 种方法共定位,包括 4 个已知位点和 8 个新位点.研究结果表明,构建的NAM群体适于进行大豆相关性状遗传分析,为大豆复杂性状的遗传解析和育种实践提供了良好的基础材料. |
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| AbstractList | 巢式关联作图(Nested Association Mapping,NAM)群体在作物学遗传与育种研究中具有广泛的应用.本研究在前期大豆种质资源评价基础上,利用 35份不同地区来源的代表性种质与中豆 41(公共母本)杂交,构建了一套大豆NAM群体.PCA和聚类分析发现,不同亲本组合的RIL群体基本聚在一起,显示出清晰的遗传结构.利用该NAM群体亲本间花色和种皮色具有显著差异的RIL群体进行全基因组关联分析,定位到 1 个主要位点qFC13-1 与花色显著关联,该位点与W1 位点重合;定位到 12 个位点与种皮色显著相关,其中 9 个位点为 3 种以上方法共定位,3 个位点为 2 种方法共定位,包括 4 个已知位点和 8 个新位点.研究结果表明,构建的NAM群体适于进行大豆相关性状遗传分析,为大豆复杂性状的遗传解析和育种实践提供了良好的基础材料. |
| Abstract_FL | Nested Association Mapping(NAM)population is widely applied in genetic study and breeding practice in many crops.A NAM panel was constructed by crossing of 35 parental lines with the common maternal lines(Zhongdou 41)based on previous evaluation of soybean germplasm.Principle component analysis and clustering analysis showed that clear genetic structure was observed between subpanel of RIL populations.Genetic analysis was performed on flower color and seed coat color in NAM subpanel with significant difference between paternal and maternal parents,and we found that qFC13-1 was significantly associ-ated with flower color,which coincided with the W1 locus.Twelve loci identified were significantly correlated with seed coat color,among which nine loci were co-located by more than three methods,and the other three loci were co-located by two meth-ods,including four reported loci and eight novel loci.In conclusion,NAM population was suitable for genetic analysis of soybean,which provided material basis for genetic interpretation and breeding practice for complex traits in soybean. |
| Author | 陈伊洁 郭庆元 王晓波 高华伟 王好让 郭勇 张丽娟 关荣霞 郭兵福 常汝镇 熊亚俊 李英慧 宋健 王俊 孙如建 阎哲 徐瑞新 姬月梅 刘康林 洪慧龙 谷勇哲 邱丽娟 闫龙 刘章雄 |
| AuthorAffiliation | 长江大学,湖北荆州 434025;农业农村部长江中游作物绿色高效生产重点实验室(部省共建)/长江大学农学院,湖北荆州 434025%中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与遗传改良国家重大科学工程/农业农村部北京大豆生物学重点实验室,北京 100081%长江大学,湖北荆州 434025%安徽农业大学农学院,安徽合肥 230036%江西省农业科学院作物研究所,江西南昌 330200%呼伦贝尔市农业科学研究所,内蒙古呼伦贝尔 162650%河北省农林科学院粮油作物研究所,河北石家庄 050035%江苏徐怀地区徐州农业科学研究所,江苏徐州 210031%宁夏农林科学院作物研究所,宁夏银川 750021 |
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| Author_FL | GUAN Rong-Xia GUO Bing-Fu WANG Hao-Rang YAN Long CHANG Ru-Zhen ZHANG Li-Juan SUN Ru-Jian LI Ying-Hui WANG Jun GUO Qing-Yuan YAN Zhe CHEN Yi-Jie GUO Yong HONG Hui-Long WANG Xiao-Bo XU Rui-Xin LIU Kang-Lin XIONG Ya-Jun QIU Li-Juan SONG Jian JI Yue-Mei LIU Zhang-Xiong GU Yong-Zhe GAO Hua-Wei |
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| Copyright | Copyright © Wanfang Data Co. Ltd. All Rights Reserved. |
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| DBID | 2B. 4A8 92I 93N PSX TCJ |
| DOI | 10.3724/SP.J.1006.2024.34094 |
| DatabaseName | Wanfang Data Journals - Hong Kong WANFANG Data Centre Wanfang Data Journals 万方数据期刊 - 香港版 China Online Journals (COJ) China Online Journals (COJ) |
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| DocumentTitle_FL | Genetic analysis of seed coat and flower color based on a soybean nested asso-ciation mapping population |
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| IngestDate | Thu May 29 04:05:30 EDT 2025 |
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| IsScholarly | true |
| Issue | 3 |
| Keywords | NAM群体 soybean 花色 遗传分析 NAM population genetic analysis 大豆 flower color seed coat color 种皮色 |
| Language | Chinese |
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| PublicationDecade | 2020 |
| PublicationTitle | 作物学报 |
| PublicationTitle_FL | Acta Agronomica Sinica |
| PublicationYear | 2024 |
| Publisher | 长江大学,湖北荆州 434025 农业农村部长江中游作物绿色高效生产重点实验室(部省共建)/长江大学农学院,湖北荆州 434025%中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与遗传改良国家重大科学工程/农业农村部北京大豆生物学重点实验室,北京 100081%长江大学,湖北荆州 434025%安徽农业大学农学院,安徽合肥 230036%江西省农业科学院作物研究所,江西南昌 330200%呼伦贝尔市农业科学研究所,内蒙古呼伦贝尔 162650%河北省农林科学院粮油作物研究所,河北石家庄 050035%江苏徐怀地区徐州农业科学研究所,江苏徐州 210031%宁夏农林科学院作物研究所,宁夏银川 750021 |
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| Title | 大豆巢式关联作图(NAM)群体构建及花色和种皮色遗传分析 |
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