大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析

S917.4; 该研究通过毛细管电泳法筛选微卫星引物,从GenBank的51对微卫星引物中共筛选出12对具有特异性和多态性的引物,并合成荧光标记引物,对广东大口黑鲈(Micropterus salmoides)主养区3个养殖群体进行STR分型,以分析其遗传多样性.结果显示所检测的12个微卫星位点中,3个位点呈现高多态性,4个具有中度多态性,其余5个位点为低多态性.3个群体的遗传多样性水平偏低,期望杂合度(He)分别为0.3125、0.3606和0.3284.群体间遗传分化指数及AMOVA分析显示,群体间遗传分化属于低水平,遗传变异有85.83％ 是由群体内不同个体间的差异造成的.群体间遗传距离...

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Published in南方水产科学 Vol. 15; no. 2; pp. 64 - 71
Main Authors 孙成飞, 谢汶峰, 胡婕, 董浚键, 田园园, 吴灶和, 叶星
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广东 广州 510380 01.04.2019
上海海洋大学,上海 201306%仲恺农业工程学院,广东 广州,510380%中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广东 广州 510380
Subjects
微卫星
遗传多样性
毛细管电泳
大口黑鲈
遗传结构
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ISSN2095-0780
DOI10.12131/20180203

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Abstract S917.4; 该研究通过毛细管电泳法筛选微卫星引物,从GenBank的51对微卫星引物中共筛选出12对具有特异性和多态性的引物,并合成荧光标记引物,对广东大口黑鲈(Micropterus salmoides)主养区3个养殖群体进行STR分型,以分析其遗传多样性.结果显示所检测的12个微卫星位点中,3个位点呈现高多态性,4个具有中度多态性,其余5个位点为低多态性.3个群体的遗传多样性水平偏低,期望杂合度(He)分别为0.3125、0.3606和0.3284.群体间遗传分化指数及AMOVA分析显示,群体间遗传分化属于低水平,遗传变异有85.83％ 是由群体内不同个体间的差异造成的.群体间遗传距离分析显示,3个养殖群体间的遗传距离和遗传相似度比较接近.遗传结构分析表明3个养殖群体来自于同一个亚群.研究结果提示现阶段中国大口黑鲈养殖群体的遗传多样性已显著下降,因此在选育种过程应高度重视提高与维持种群遗传多样性的问题.
AbstractList S917.4; 该研究通过毛细管电泳法筛选微卫星引物,从GenBank的51对微卫星引物中共筛选出12对具有特异性和多态性的引物,并合成荧光标记引物,对广东大口黑鲈(Micropterus salmoides)主养区3个养殖群体进行STR分型,以分析其遗传多样性.结果显示所检测的12个微卫星位点中,3个位点呈现高多态性,4个具有中度多态性,其余5个位点为低多态性.3个群体的遗传多样性水平偏低,期望杂合度(He)分别为0.3125、0.3606和0.3284.群体间遗传分化指数及AMOVA分析显示,群体间遗传分化属于低水平,遗传变异有85.83％ 是由群体内不同个体间的差异造成的.群体间遗传距离分析显示,3个养殖群体间的遗传距离和遗传相似度比较接近.遗传结构分析表明3个养殖群体来自于同一个亚群.研究结果提示现阶段中国大口黑鲈养殖群体的遗传多样性已显著下降,因此在选育种过程应高度重视提高与维持种群遗传多样性的问题.
Author 吴灶和
田园园
叶星
孙成飞
谢汶峰
董浚键
胡婕
AuthorAffiliation 中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广东 广州 510380;上海海洋大学,上海 201306%仲恺农业工程学院,广东 广州,510380%中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广东 广州 510380
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WU Zhaohe
DONG Junjian
TIAN Yuanyuan
XIE Wenfeng
HU Jie
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Keywords 微卫星
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Publisher 中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广东 广州 510380
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Title 大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析
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