基于线粒体Cytb基因序列的西江流域广西境内卷口鱼遗传多样性分析

• Published in: 南方水产科学 Vol. 16; no. 5; pp. 10 - 18
• Main Authors: 彭敏, 韩耀全, 王大鹏, 施军, 吴伟军, 李育森, 雷建军, 何安尤
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 广西水产科学研究院/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西 南宁 530021%广西水产科学研究院/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西 南宁 530021 01.10.2020; 华南农业大学海洋学院,广东 广州 510642
• Subjects: 遗传分化; 西江流域; 卷口鱼; 遗传多样性; Cytb基因
• ISSN: 2095-0780
• DOI: 10.12131/20200041

Q319+.1; 为了解西江流域广西境内卷口鱼(Ptychidio jordani)种群遗传结构及分化程度,采用线粒体Cytb基因序列对西江流域广西境内6个江段的139尾野生卷口鱼的遗传多样性进行了分析.结果显示,线粒体Cytb基因长度为1053 bp,碱基T、C、A、G的平均含量分别为29.1％、27.7％、29.3％、13.9％,其中A+T(58.4％)高于C+G(41.6％).共定义20个单倍型,并聚为2个分支,未观察到明显的地理聚群.6个卷口鱼群体的平均单倍型多样性和平均核苷酸多样性分别为0.7682、0.0023,其中红水河群体(单倍型多样性h=0.7487,核苷酸多样性π=0.0033)遗传多样性最高,柳江群体(h=0.2744,π=0.0004)和左江群体(h=0.3747,π=0.0003)的遗传多样性相对较低.卷口鱼总体的遗传分化指数(FST)为0.4614(P<0.01),表现出较大的遗传分化.两两群体间遗传分化结果显示,左江和柳江种群之间的遗传分化程度最大,而柳江和西江之间最小.AMOVA分析表明西江流域的卷口鱼群体遗传变异一半来自群体内(53.86％),一半来自群体间(46.14％).中性检验(Tajima's D=?1.0828,P>0.05;Fu's Fs=?6.5725,0.01<P<0.05)与碱基错配分布分析表明西江流域卷口鱼种群大约在0.07～0.187 Ma经历了种群扩张.综上,西江流域广西境内的卷口鱼柳江群体和左江群体遗传多样性较低,总群体分化程度较大,但仍属于一个种群,其中空间距离与地理阻隔对卷口鱼的遗传分化具有一定的促进作用.