ビタミンD受容体とキラリティが異なるリガンド間の特異的相互作用: ab initioフラグメント分子軌道計算

• Published in: Chem-Bio Informatics Journal Vol. 18; pp. 32 - 43
• Main Authors: 栗田, 典之, 小林, 一徹, 上村, みどり, 鈴木, 理恵, 橘高, 敦史, 武田, 涼介, 河合, 健太郎
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: 情報計算化学生物学会(CBI学会) 2018
• Subjects: キラリティー; ビタミンD受容体; フラグメント分子軌道; 分子シミュレーション; 特異的相互作用; 結合親和性
• ISSN: 1347-6297; 1347-0442
• DOI: 10.1273/cbij.18.32

ビタミンD受容体（VDR）とキラリティーが異なる2種類のリガンド間の結合親和性が実験により解析され、リガンドのキラリティーの違いにより、VDRへの結合親和性が大きく変化することが見出された。この原因を明らかにするため、VDRと2種類のリガンド間の特異的相互作用を、ab initio フラグメント分子軌道（FMO）計算を用いて調べた。 その結果、リガンド中でキラリティーが異なる部位が、VDRのヒスチジン残基側鎖のイミダゾール環と強く相互作用し、VDRとリガンド間の結合特性性がヒスチジンのプロトン化状態に依存することが明らかになった。