まれな変異に重点を置いた尿酸値の遺伝率の研究
痛風は，尿酸が原因で起こる関節炎であり，罹患者も多い．先行研究では血清尿酸値の遺伝率は30〜70％と推定されている．遺伝子ベース検定を用いた最近の研究では，まれな変異の有無がヒト集団中の血清尿酸値分散に大きく寄与していることが示唆されている．遺伝子ベース検定は，1つの遺伝子に含まれる複数の遺伝子変異の影響を1回の検定で考慮するものである．本論文では，数値計算を用い，遺伝子ベース検定のサンプルサイズと検出力の関係を解析した．仮想的なヒト集団を，まれな変異を持つ人々と持たない人々の二つの群に分けた．この二群間での尿酸値の平均値の差は，先行研究によるURAT1変異の有無によって生じる差と同じ値を使っ...
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| Published in | 痛風と尿酸・核酸 Vol. 45; no. 1; pp. 23 - 30 |
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| Main Authors | , , , , , , , , |
| Format | Journal Article |
| Language | Japanese |
| Published |
一般社団法人 日本痛風・尿酸核酸学会
25.07.2021
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| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 2435-0095 |
| DOI | 10.14867/gnamtsunyo.45.1_23 |
Cover
| Abstract | 痛風は，尿酸が原因で起こる関節炎であり，罹患者も多い．先行研究では血清尿酸値の遺伝率は30〜70％と推定されている．遺伝子ベース検定を用いた最近の研究では，まれな変異の有無がヒト集団中の血清尿酸値分散に大きく寄与していることが示唆されている．遺伝子ベース検定は，1つの遺伝子に含まれる複数の遺伝子変異の影響を1回の検定で考慮するものである．本論文では，数値計算を用い，遺伝子ベース検定のサンプルサイズと検出力の関係を解析した．仮想的なヒト集団を，まれな変異を持つ人々と持たない人々の二つの群に分けた．この二群間での尿酸値の平均値の差は，先行研究によるURAT1変異の有無によって生じる差と同じ値を使った．また，各個人の尿酸値は，その個人が属する各群の平均値を期待値とする正規分布に従うと仮定した．等分散性を仮定しないWelchのt検定を行い，検出力を計算した．今回の数値計算から，まれな変異は，一つのSNPだけを用いている場合，1万人から数万人ほどの大きさのサンプルが必要であることがわかった．複数のSNPをまとめた検定を行うことで，検出力が上がり，数百から数千人規模の研究でも検出できることが示された．この研究は，今まで主に研究対象となってきた「ありふれた疾患，ありふれた変異」に加え，遺伝子ベース検定による，「ありふれた疾患，まれな変異」の研究の可能性を示した． |
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| AbstractList | 痛風は，尿酸が原因で起こる関節炎であり，罹患者も多い．先行研究では血清尿酸値の遺伝率は30〜70％と推定されている．遺伝子ベース検定を用いた最近の研究では，まれな変異の有無がヒト集団中の血清尿酸値分散に大きく寄与していることが示唆されている．遺伝子ベース検定は，1つの遺伝子に含まれる複数の遺伝子変異の影響を1回の検定で考慮するものである．本論文では，数値計算を用い，遺伝子ベース検定のサンプルサイズと検出力の関係を解析した．仮想的なヒト集団を，まれな変異を持つ人々と持たない人々の二つの群に分けた．この二群間での尿酸値の平均値の差は，先行研究によるURAT1変異の有無によって生じる差と同じ値を使った．また，各個人の尿酸値は，その個人が属する各群の平均値を期待値とする正規分布に従うと仮定した．等分散性を仮定しないWelchのt検定を行い，検出力を計算した．今回の数値計算から，まれな変異は，一つのSNPだけを用いている場合，1万人から数万人ほどの大きさのサンプルが必要であることがわかった．複数のSNPをまとめた検定を行うことで，検出力が上がり，数百から数千人規模の研究でも検出できることが示された．この研究は，今まで主に研究対象となってきた「ありふれた疾患，ありふれた変異」に加え，遺伝子ベース検定による，「ありふれた疾患，まれな変異」の研究の可能性を示した． |
| Author | 三島, 英換 河合, 洋介 長﨑, 正朗 長谷川, 嵩矩 三澤, 計治 松尾, 雅文 安西, 尚彦 大内, 基司 小島, 要 |
| Author_xml | – sequence: 1 fullname: 小島, 要 organization: 国立国際医療研究センター – sequence: 1 fullname: 河合, 洋介 organization: 東北大学東北メディカル・メガバンク機構 – sequence: 1 fullname: 大内, 基司 organization: 獨協医科大学医学部薬理学講座 – sequence: 1 fullname: 三澤, 計治 organization: 理化学研究所革新知能統合研究センター – sequence: 1 fullname: 安西, 尚彦 organization: 千葉大学大学院医学研究院薬理学教室 – sequence: 1 fullname: 三島, 英換 organization: 東北大学病院腎・高血圧・内分泌科 – sequence: 1 fullname: 松尾, 雅文 organization: 神戸学院大学 – sequence: 1 fullname: 長﨑, 正朗 organization: 京都大学学際融合教育研究推進センター – sequence: 1 fullname: 長谷川, 嵩矩 organization: 東京大学医科学研究所 |
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| Copyright | 2021 一般社団法人日本痛風・尿酸核酸学会 |
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| DOI | 10.14867/gnamtsunyo.45.1_23 |
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| EISSN | 2435-0095 |
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| Title | まれな変異に重点を置いた尿酸値の遺伝率の研究 |
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