次世代型シークエンサーを用いたイヌ舌組織由来遺伝子群の発現解析および味覚に関する遺伝子構造の解析

• Published in: ペット栄養学会誌 Vol. 15; no. 1; pp. 1 - 6
• Main Authors: 渡邊, 学, チェン, アイリス, 森, 美香子, 上野, 絵美, 中村, 好孝, 薮本, 恵美子, 阿部, 佳澄, 椿, 真理, 今村, 清美, 関森, 悦子, 西澤, 理絵, 若栗, 浩幸, 中川, 貴之, 望月, 学, 西村, 亮平, 佐々木, 伸雄, 鈴木, 穣, 菅野, 純夫
• Format: Journal Article
• Language: Japanese
• Published: 日本ペット栄養学会 10.04.2012
• Subjects: dog; next generation sequencer; RNA-seq; TAS2R40; taste receptor family
• ISSN: 1344-3763; 2185-7601
• DOI: 10.11266/jpan.15.1

イヌ舌組織における遺伝子発現、味覚受容体の構造の検討を行うため、遺伝子発現頻度解析および味覚受容体の構造解析を行った。正常イヌ舌組織よりRNAを抽出し、次世代シークエンサーを用いてシークエンスを行った。シークエンスタグをイヌゲノムへのマッピングを行い各遺伝子の発現頻度を解析した。味覚受容体にマップされたシークエンスタグをもとに味覚受容体TAS2R40遺伝子およびアミノ酸配列を解析した。RNA-seq解析の結果、984,903シークエンスタグを得た。これらを用いてイヌゲノム上へのマッピングを行った。同定された遺伝子の中で、S100 calcium binding protein A8がもっとも高い発現を示した。また、骨格筋系遺伝子、心筋系遺伝子や解毒系遺伝子群の発現が認められた。味覚受容体をコードする遺伝子構造解析を行ったところ、TAS2R40、TRPV1、PKD1は既存の遺伝子構造よりも5' 端側にマップされるタグが認められ、これまでの遺伝子配列情報よりも完全長に近い遺伝子構造が推測された。また、TAS2R40遺伝子がコードするアミノ酸配列の相同性はヒトと76％マウスと62％であった。