次世代シーケンサーデータの解析手法 第 12 回 Galaxy：ヒストリーとワークフロー

Galaxy は、ウェブブラウザ上でマウスを操作して行う GUI ベースの（Linux コマンドを覚える必要のない）データ解析環境である。前回は、Galaxy の概要と公共サーバ Galaxy Main の基本的な利用法について述べた。第 12 回は、前回 Galaxy Main 上で行った解析結果（ヒストリー）の他の研究者との共有や、以前行った解析手順（ワークフロー）を他のデータに適用する手段を中心に述べる。また、ヒストリー間のデータのコピーや、自身の PC を経由しない Galaxy Main へのデータの取り込みなど、関連した便利な機能についても紹介する。今回の内容は、ウェブブラウザの違...

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Bibliographic Details
Published in日本乳酸菌学会誌 Vol. 29; no. 2; pp. 79 - 88
Main Authors 寺田, 朋子, 大田, 達郎, 清水, 謙多郎, 門田, 幸二
Format Journal Article
LanguageJapanese
Published 日本乳酸菌学会 02.07.2018
Subjects
Galaxy
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Summary:Galaxy は、ウェブブラウザ上でマウスを操作して行う GUI ベースの（Linux コマンドを覚える必要のない）データ解析環境である。前回は、Galaxy の概要と公共サーバ Galaxy Main の基本的な利用法について述べた。第 12 回は、前回 Galaxy Main 上で行った解析結果（ヒストリー）の他の研究者との共有や、以前行った解析手順（ワークフロー）を他のデータに適用する手段を中心に述べる。また、ヒストリー間のデータのコピーや、自身の PC を経由しない Galaxy Main へのデータの取り込みなど、関連した便利な機能についても紹介する。今回の内容は、ウェブブラウザの違いに起因する不具合を避けるため、Google Chrome または Firefox（Internet Explorer は非推奨）を用いてほしい。ウェブサイト（R で）塩基配列解析（URL: http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r_seq.html）中に本連載をまとめた項目（URL: http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r_seq.html#about_book_JSLAB）が存在する。ウェブ資料（以下、W）や関連ウェブサイトなどを効率的に活用してほしい。
ISSN:1343-327X
2186-5833
DOI:10.4109/jslab.29.79