小细胞肺癌及其配对的正常肺组织差异表达蛋白质的双相电泳-飞行时间质谱研究

• Published in: Xi'an jiao tong da xue xue bao. Journal of Xi'an Jiaotong University (medical sciences). Yi xue ban Vol. 27; no. 6; pp. 533 - 537
• Main Author: 杨拴盈 张王刚 张潍 周斌 田应选 南岩东 卜丽娜 阮禹松 孙秀珍 杨德昌
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 西安交通大学医学院第二附属医院,呼吸内科,陕西,西安,710004%西安交通大学医学院第二附属医院,血液科,陕西,西安,710004%西安交通大学医学院第二附属医院,胸外科,陕西,西安,710004%西安交通大学生命科学与技术学院信息中心,陕西,西安,710049 2006
• Subjects: 双相电泳; 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱; 小细胞肺癌; 肽质量指纹图谱; 蛋白质组学; 蛋白质组学; 肽质量指纹图谱; 小细胞肺癌; 双相电泳; 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
• ISSN: 1671-8259
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8259.2006.06.004

目的应用比较蛋白质组学方法分析小细胞肺癌（sCLC）与其配对的正常肺组织差异表达蛋白质，为阐明SCLC发病机制、筛选其早期诊断标志物提供有益的思路。方法应用双相电泳（2-DE）分离6例SCLC及其配对的正常肺组织可溶性总蛋白；应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI—TOF-MS）获得差异蛋白点的肽质量指纹图谱（PMF）；通过Mascot软件查询NCBI或SWISS-PROT数据库鉴定蛋白质。结果每张图谱约检测到800多个蛋白质点。经匹配分析，肺癌组织之间和正常肺组织之间凝胶图像的匹配率分别为75．5％和78．2％；选择14个背景清晰、重复性及分辨率较好、蛋白表达差异明显的点进行质谱分析，结合表观分子量及等电点（pI），初步鉴定了11种（六类）蛋白质：①与蛋白质降解通路有关的蛋白质：蛋白酶体α亚单位3型、蛋白酶体β亚单位2型及D亚单位5型；②自由基／抗氧化剂类：锰-超氧化物歧化酶（Mn-SOD）、过氧化氢酶（CAT）和黄素还原酶（FR）；③细胞骨架类：原肌球蛋白-3（Tpm-3）；④与能量代谢有关的蛋白质：硫氧还蛋白过氧化物酶（TPX1）；⑤分子伴侣：抑制素（PHB），内质网蛋白ER29（Erp29）；⑥其他：可溶性NSF黏附蛋白（alpha SNAP）。结论应用2-DE及MALDI—TOF-MS方法分离并初步鉴定了11种（六类）蛋白质；这些蛋白质与SCLC发生发展密切相关，部分可能成为SCLC诊断及治疗的分子靶点。