型糖尿病大鼠神经视网膜组织中差异蛋白质分析
以高脂饮食联合小剂量链脲菌素(Streptozotocin,STZ)注射方法诱导大鼠II型糖尿病(T2DM)模型为研究对象,采用比较蛋白质组学技术鉴定和分析早期糖尿病神经视网膜差异表达蛋白。通过联用液氮内研磨、冰浴超声、高速离心提取全蛋白技术,提取每只大鼠神经视网膜全蛋白质总量约900μg。采用双向凝胶电泳(2-DE)分离技术,获得2500个以上可辩认的蛋白质斑点。通过蛋白质组学比对技术筛选出糖尿病状态下神经视网膜差异表达蛋白,用基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALDI-TOF-MS/MS)和肽质量指纹图谱(PMF)鉴定出20个差异蛋白点。按照Gene Ontology(GO)分类体系...
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Published in | Fēnxī huàxué Vol. 38; no. 10; pp. 1462 - 1468 |
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Main Author | |
Format | Journal Article |
Language | Chinese |
Published |
南京医科大学第一附属医院,南京,210029%南京医科大学基础医学院,南京,210029
2010
|
Subjects | |
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ISSN | 0253-3820 |
DOI | 10.3724/SP.J.1096.2010.01462 |
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Abstract | 以高脂饮食联合小剂量链脲菌素(Streptozotocin,STZ)注射方法诱导大鼠II型糖尿病(T2DM)模型为研究对象,采用比较蛋白质组学技术鉴定和分析早期糖尿病神经视网膜差异表达蛋白。通过联用液氮内研磨、冰浴超声、高速离心提取全蛋白技术,提取每只大鼠神经视网膜全蛋白质总量约900μg。采用双向凝胶电泳(2-DE)分离技术,获得2500个以上可辩认的蛋白质斑点。通过蛋白质组学比对技术筛选出糖尿病状态下神经视网膜差异表达蛋白,用基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALDI-TOF-MS/MS)和肽质量指纹图谱(PMF)鉴定出20个差异蛋白点。按照Gene Ontology(GO)分类体系,对差异蛋白归类分析,揭示其亚细胞定位和分子功能。应用Pathway Studio软件对差异表达蛋白的生物学意义进行分析,认为凋亡是早期糖尿病视网膜病变(Diabetic retinopathy,DR)重要的细胞事件;AnnexinΙ、CRYAB、mtHsp70蛋白是与病理过程相关的关键蛋白,对研究DR致病机制有重要意义。 |
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AbstractList | 以高脂饮食联合小剂量链脲菌素(Streptozotocin,STZ)注射方法诱导大鼠II型糖尿病(T2DM)模型为研究对象,采用比较蛋白质组学技术鉴定和分析早期糖尿病神经视网膜差异表达蛋白。通过联用液氮内研磨、冰浴超声、高速离心提取全蛋白技术,提取每只大鼠神经视网膜全蛋白质总量约900μg。采用双向凝胶电泳(2-DE)分离技术,获得2500个以上可辩认的蛋白质斑点。通过蛋白质组学比对技术筛选出糖尿病状态下神经视网膜差异表达蛋白,用基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALDI-TOF-MS/MS)和肽质量指纹图谱(PMF)鉴定出20个差异蛋白点。按照Gene Ontology(GO)分类体系,对差异蛋白归类分析,揭示其亚细胞定位和分子功能。应用Pathway Studio软件对差异表达蛋白的生物学意义进行分析,认为凋亡是早期糖尿病视网膜病变(Diabetic retinopathy,DR)重要的细胞事件;AnnexinΙ、CRYAB、mtHsp70蛋白是与病理过程相关的关键蛋白,对研究DR致病机制有重要意义。 O65; 以高脂饮食联合小剂量链脲菌素(Streptozotocin, STZ ) 注射方法诱导大鼠II型糖尿病 (T2DM) 模型为研究对象, 采用比较蛋白质组学技术鉴定和分析早期糖尿病神经视网膜差异表达蛋白.通过联用液氮内研磨、冰浴超声、高速离心提取全蛋白技术,提取每只大鼠神经视网膜全蛋白质总量约900 μg.采用双向凝胶电泳(2-DE) 分离技术,获得2500个以上可辩认的蛋白质斑点.通过蛋白质组学比对技术筛选出糖尿病状态下神经视网膜差异表达蛋白,用基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱 (MALDI-TOF- MS/MS) 和肽质量指纹图谱 (PMF) 鉴定出20个差异蛋白点.按照Gene Ontology (GO)分类体系,对差异蛋白归类分析,揭示其亚细胞定位和分子功能.应用Pathway Studio软件对差异表达蛋白的生物学意义进行分析,认为凋亡是早期糖尿病视网膜病变(Diabetic retinopathy,DR) 重要的细胞事件;AnnexinΙ、CRYAB、mtHsp70蛋白是与病理过程相关的关键蛋白,对研究DR致病机制有重要意义. |
Author | 王亚冬 童明庆 崔毓贵 张民英 郭雪江 王玲 许志洋 王富强 |
AuthorAffiliation | 南京医科大学第一附属医院,南京210029 南京医科大学基础医学院,南京210029 |
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Issue | 10 |
Keywords | 比较蛋白质组学 大鼠神经视网膜 双向凝胶电泳 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 糖尿病 |
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Notes | Rat neural retina Q510.3 Rat neural retina; Comparative proteomics; Two-dimensional gel electrophoresis; Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry; Diabetes 22-1125/O6 Two-dimensional gel electrophoresis Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry Diabetes Comparative proteomics |
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PublicationDecade | 2010 |
PublicationTitle | Fēnxī huàxué |
PublicationTitleAlternate | Chinese Journal of Analytical Chemistry |
PublicationTitle_FL | CHINESE JOURNAL OF ANALYTICAL CHEMISTRY |
PublicationYear | 2010 |
Publisher | 南京医科大学第一附属医院,南京,210029%南京医科大学基础医学院,南京,210029 |
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SourceID | wanfang chongqing |
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SubjectTerms | 双向凝胶电泳 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 大鼠神经视网膜 比较蛋白质组学 糖尿病 |
Title | 型糖尿病大鼠神经视网膜组织中差异蛋白质分析 |
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