蛋白质组学研究中傅立叶变换离子回旋共振质谱数据采集方法的比较

探讨了线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱（LTQ-FT）的数据采集模式对蛋白质组鉴定结果的影响,比较和分析了针对不同复杂程度样本的最佳采集模式。对于α-乳清蛋白4种标准蛋白质酶切肽段混合物的简单体系,在傅立叶变换离子回旋共振腔中选3个最强母离子进行选择离子监测扫描后,再实施二级碎裂的方法（SIM3）得到的肽段覆盖率,分别是直接选10个最强母离子进行二级碎裂（FT10）方法得到的肽段覆盖率的1.5～1.9倍。另外,对酵母蛋白酶切肽段混合物的复杂体系鉴定时,只采集双电荷和三电荷母离子进行二级扫描的方法（FT10_23）比单电荷、双电荷和三电荷都采集的方法（FT10_123）得到的图谱鉴定成功率...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published inFēnxī huàxué Vol. 38; no. 9; pp. 1238 - 1242
Main Author 曾家伟 贾伟 应万涛 钱小红
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,北京,102206 2010
Subjects
线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱
蛋白质组学
质谱采集模式
蛋白质组学
质谱采集模式
线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱
Online AccessGet full text
ISSN0253-3820
DOI10.3724/SP.J.1096.2010.01238

Cover

More Information
Summary:探讨了线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱（LTQ-FT）的数据采集模式对蛋白质组鉴定结果的影响,比较和分析了针对不同复杂程度样本的最佳采集模式。对于α-乳清蛋白4种标准蛋白质酶切肽段混合物的简单体系,在傅立叶变换离子回旋共振腔中选3个最强母离子进行选择离子监测扫描后,再实施二级碎裂的方法（SIM3）得到的肽段覆盖率,分别是直接选10个最强母离子进行二级碎裂（FT10）方法得到的肽段覆盖率的1.5～1.9倍。另外,对酵母蛋白酶切肽段混合物的复杂体系鉴定时,只采集双电荷和三电荷母离子进行二级扫描的方法（FT10_23）比单电荷、双电荷和三电荷都采集的方法（FT10_123）得到的图谱鉴定成功率提高64.1%。实验还对不同数据采集模式下图谱的特点进行了考察。本研究表明,针对不同复杂程度的样本,应采取不同的质谱数据采集方法。
Bibliography:Proteomics; Mass spectrometer acquisition methods; Linear quadrupole ion trap-Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometer
Linear quadrupole ion trap-Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometer
22-1125/O6
O657.63
Mass spectrometer acquisition methods
Proteomics
ISSN:0253-3820
DOI:10.3724/SP.J.1096.2010.01238