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Genome sequence of Xanthomonas fuscans subsp fuscans strain 4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads

by Darrasse , Armelle (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences), Carrere , Sebastien (INRA , Auzeville (France). UMR 0441 Laboratoire des Interactions Plantes Micro organismes), Barbe , Valerie (Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Evry(France). Centre National du Séquençage), Boureau , Tristan (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences), Arrieta-Ortiz , Mario L. (University of the Andes, Bogota(Colombie). Laboratory of Mycology and Plant Pathology), Bonneau , Sophie (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences), Briand , Martial (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences), Brin , Chrystelle (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences), Cociancich , Stephane (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Montpellier(France). UMR BGPI, Biologie et Génétique des Intéractions Plantes-Parasites), Durand , Karine (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences), Fouteau , Stephanie (Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Evry(France). Center National de Séquençage), Gagnevin , Lionel (Université de La Réunion, Saint-Pierre(France). UMR PVBMT, Peuplements Végétaux et Bioagresseurs en Milieu Tropical), Guerin , Fabien (Université de La Réunion, Saint-Pierre(France). UMR PVBMT, Peuplements Végétaux et Bioagresseurs en Milieu Tropical), Guy , Endrick (INRA , Auzeville (France). UMR 0441 Laboratoire des Interactions Plantes Micro organismes), Indiana , Arnaud (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences), Koebnik , Ralf (Institut de Recherche pour le Développement, Montpellier(France). UMR RPB, Résistance des Plantes aux Bioagresseurs), Lauber , Emmanuelle (INRA , Auzeville (France). UMR 0441 Laboratoire des Interactions Plantes Micro organismes), Munoz , Alejandra (University of the Andes, Bogota(Colombie). Laboratory of Mycology and Plant Pathology), Noël , Laurent (INRA , Auzeville (France). UMR 0441 Laboratoire des Interactions Plantes Micro organismes), Pieretti , Isabelle (Centre de Coopération International en Recherche Agronomique pour le Développement, Montpellier(France). UMR BGPI, Biologie et Génétique des Intéractions Plantes-Parasites), Poussier , Stéphane (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences), Pruvost , Olivier (Université de La Réunion, Saint-Pierre(France). UMR PVBMT, Peuplements Végétaux et Bioagresseurs en Milieu Tropical), Robene-Soustrade , Isabelle (Université de La Réunion, Saint-Pierre(France). UMR PVBMT, Peuplements Végétaux et Bioagresseurs en Milieu Tropical), Rott , Philippe (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Montpellier(France). UMR BGPI, Biologie et Génétique des Intéractions Plantes-Parasites), Royer , Monique (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Montpellier(France). UMR BGPI, Biologie et Génétique des Intéractions Plantes-Parasites), Serres-giardi , Laurana (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences), Szurek , Boris (Institut de Recherche pour le Développement, Montpellier(France). UMR RPB, Résistance des Plantes aux Bioagresseurs), van Sluys , Marie-Anne (University of Sao Paulo, Sao Paulo(Brésil). Institute of Bioscience, Department of Botany, Laboratory GaTE (Genomics and Transposable Elements)), Verdier , Valerie (Institut de Recherche pour le Développement, Montpellier(France). UMR RPB, Résistance des Plantes aux Bioagresseurs), Verniere , Christian (Université de La Réunion, Saint-Pierre(France). UMR PVBMT, Peuplements Végétaux et Bioagresseurs en Milieu Tropical), Arlat , Matthieu (INRA , Auzeville (France). UMR 0441 Laboratoire des Interactions Plantes Micro organismes), Manceau , Charles (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences), Jacques , Marie Agnes (INRA , BEAUCOUZE (France). UMR 1345 Institut de Recherche en Horticulture et Semences)
Published in http://www.biomedcentral.com/bmcgenomics (2013)
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Integrated RNA-seq and sRNA-seq analysis identifies novel nitrate-responsive genes in Arabidopsis thaliana roots

by Vidal , Elena A. (Pontifical Catholic University of Chile, Santiago(Chili). Faculty of Biological Sciences, Department of Molecular Genetics and Microbiology, FONDAP, Center for Genome Regulation - Millennium Nucleus Center for Plant Functional Genomics), Moyano , Tomas C. (Pontifical Catholic University of Chile, Santiago(Chili). Faculty of Biological Sciences, Department of Molecular Genetics and Microbiology, FONDAP, Center for Genome Regulation - Millennium Nucleus Center for Plant Functional Genomics), Krouk , Gabriel (INRA , Montpellier (France). UMR 0386 Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes), Katari , Manpreet S. (New York University, New York(Etats-Unis). Department of Biology, Center for Genomics and Systems Biology), Tanurdzic , Milos (Cold Spring Harbor Laboratory, New York(Etats-Unis).), McCombie , W. Richard (Cold Spring Harbor Laboratory, New York(Etats-Unis).), Coruzzi , Gloria M.(auteur de correspondance) (New York University, New York(Etats-Unis). Department of Biology, Center for Genomics and Systems Biology), Gutierrez , Rodrigo A.(auteur de correspondance) (Pontifical Catholic University of Chile, Santiago(Chili). Faculty of Biological Sciences, Department of Molecular Genetics and Microbiology, FONDAP, Center for Genome Regulation - Millennium Nucleus Center for Plant Functional Genomics)
Published in http://www.biomedcentral.com/bmcgenomics (2013)
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Response of the goat mammary gland to infection with Staphylococcus Aureus revealed by gene expression profiling in milk somatic and white blood cells

by Cremonesi , Paola (Consiglio Nazionale delle Ricerche, Lodi(Italie).), Capoferri , Rossana(auteur de correspondance) (Istituto Sperimetnale Italiano L. Spallanzani , Lodi(Italie).), Pisoni , Giuliano (Università degli Studi di Milano, Milano(Italie). Dipartimento di Scienze Veterinarie per la Salute, la Produzione Animale et la Sicurezza Alimentare), Del Corvo , Marcello (Parco Tecnologico Padano, Lodi(Italie).), Strozzi , Francesco (Parco Tecnologico Padano, Lodi(Italie).), Rupp , Rachel (INRA , Auzeville (France). UR 0631 Station d'Amélioration Génétique des Animaux), Caillat , Hugues (INRA (France). UR 0631 Station d'Amélioration Génétique des Animaux), Modesto , Paola (Università degli Studi di MilanoIstituto Zooprofilattico Sperimentale di Piemonte, MilanoTorino(Italie). Dipartimento di Scienze Veterinarie per la Salute, la Produzione Animale e la Sicurezza Alimentare), Moroni , Paolo (Universita degli Studi di MilanoCornell University, MilanNew York(Etats-Unis). Dipartimento di Scienze Veterinarie per la Salute, la Produzione Animale e la Sicurezza AlimentareQuality Milk Production Services), Williams , John L (Parco Tecnologico Padano, Lodi(Italie).), Castiglioni , Bianca (Consiglio Nazionale delle Ricerche, Lodi(Italie).), Stella , Alessandra (Parco Tecnologico Padano, Lodi(Italie).)
Published in http://www.biomedcentral.com/bmcgenomics (2012)
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Fine mapping of copy number variations on two cattle genome assemblies using high density SNP array

by Hou , Yali (United States Department of AgricultureChinese Academy of Agricultural Sciences, BeltsvilleBeijing(Chine). Bovine Functional Genomics Laboratory, ANRILaboratory of Disease Genomics and Individualized Medicine, Beijing Institute of Genomics), Bickhart , Derek M (United States Department of Agriculture, Beltsville(Etats-Unis). Bovine Functional Genomics Laboratory, ANRI), Hvinden , Miranda L (Pfizer Animal Genetics, Kalamazoo, MI(Etats-Unis).), Li , Congjun (United States Department of Agriculture, Beltsville(Etats-Unis). Bovine Functional Genomics Laboratory, ANRI), Song , Jiuzhou (University of Maryland, College Park(Etats-Unis). Department of Animal and Avian Sciences), Boichard , Didier (INRA , Jouy-En-Josas (France). UMR 1313 Génétique Animale et Biologie Intégrative), Fritz , Sébastien (Union Nationale des Coopératives Agricoles d'Elevage et d'Insémination Animale, Paris(France). Genetics Team), Eggen , André (Illumina, San Diego, California(Etats-Unis).), DeNise , Sue (Pfizer Animal Genetics, Kalamazoo, MI(Etats-Unis).), Wiggans , George R (United States Department of Agriculture, Beltsville(Etats-Unis). Animal Improvement Programs Laboratory, ANRI), Sonstegard , Tad S (United States Department of Agriculture, Beltsville(Etats-Unis). Bovine Functional Genomics Laboratory, ANRI), Van Tassell , Curtis P (United States Department of Agriculture, Beltsville(Etats-Unis). Bovine Functional Genomics Laboratory, ANRI), Liu , George E(auteur de correspondance) (United States Department of Agriculture, Beltsville(Etats-Unis). Bovine Functional Genomics Laboratory)
Published in http://www.biomedcentral.com/bmcgenomics (2012)
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Liver transcriptome profile in pigs with extreme phenotypes of intramuscular fatty acid composition

by Ramayo-Caldas , Yuliaxis (Center for Research in Agricultural Genomics, Bellaterra(Espagne). Consorci CSIC-IRTA-UAB-UB), Mach , Nuria (INRA , Jouy-En-Josas (France). UMR 1313 Génétique Animale et Biologie Intégrative), Esteve-Codina , Anna (Center for Research in Agricultural Genomics, Bellaterra(Espagne). Consorci CSIC-IRTA-UAB-UB), Corominas , Jordi (Center for Research in Agricultural Genomics, Bellaterra(Espagne). Consorci CSIC-IRTA-UAB-UB), Castelló , Anna (Center for Research in Agricultural Genomics, Bellaterra Consorci CSIC-IRTA-UAB-UB), Ballester , Maria (Center for Research in Agricultural Genomics, Bellaterra(Espagne). Consorci CSIC-IRTA-UAB-UB), Estelle , Jordi (INRA , Jouy-En-Josas (France). UMR 1313 Génétique Animale et Biologie Intégrative), Ibáñez-Escriche , Noelia (Instituto de Investigación y Tecnología Agroalimentarias, Lleida(Espagne). Genètica i Millora Animal), Fernández , Ana I (Instituto Nacional de Investigaciones Agronomicas, Madrid(Espagne). Departamento de Mejora Genética Animal), Pérez-Enciso , Miguel (Center for Research in Agricultural GenomicsInstitut Català de Recerca i Estudis Avançats Universitat Autónoma de Barcelona, BellaterraBarcelonaBellaterra(Espagne). Consorci CSIC-IRTA-UAB-UBDepartament de Ciència Animal i dels Aliments, Facultat de Veterinària), Folch , Josep M (Center for Research in Agricultural GenomicsUniversitat Autónoma de Barcelona, BellaterraBellaterra(Espagne). Consorci CSIC-IRTA-UAB-UBDepartament de Ciència Animal i dels Aliments, Facultat de Veterinària)
Published in http://www.biomedcentral.com/bmcgenomics (2012)
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Meta-analysis of Chicken – Salmonella infection experiments

by te Pas , Marinus FW(auteur de correspondance) (Wageningen University and Research Center, Lelystad(Pays-Bas). Animal Breeding and Genetics Centre (ABGC), Wageningen UR Livestock Research, Animal Sciences Group), Hulsegge , Ina (Wageningen University and Research CenterWageningen University and Research Center, LelystadLelystad(Pays-Bas). Animal Breeding and Genetics Centre (ABGC), Wageningen UR Livestock Research, Animal Sciences Group), Schokker , Dirkjan (Wageningen University and Research Center, Lelystad(Pays-Bas). Animal Breeding and Genetics Centre (ABGC), Wageningen UR Livestock Research, Animal Sciences Group), Smits , Mari A (Wageningen University and Research CenterWageningen University and Research Center, LelystadLelystad(Pays-Bas). Animal Breeding and Genetics Centre (ABGC), Wageningen UR Livestock Research, Animal Sciences GroupCentral Veterinary Institute - Department of Infectious Biology, Animal Sciences Group), Fife , Mark (Institute for Animal Health, Compton(Royaume Uni). Genetics & Genomics group), Zoorob , Rima (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Paris(France). UMR-S 945, Institut Fédératif de Recherches (IFR) 113, département Immunité-Cancer-Infection, Hôpital Pitié-Salpêtrière), Endale Ahanda , Marie-Laure (INRA , Jouy-En-Josas (France). UMR 1313 Génétique Animale et Biologie Intégrative), Rebel , Johanna MJ (Wageningen University and Research Center, Lelystad(Pays-Bas). Central Veterinary Institute - Department of Infectious Biology, Animal Sciences Group)
Published in http://www.biomedcentral.com/bmcgenomics (2012)
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